Mahalagang Pagkakaiba – Genotyping vs Sequencing
Ang Genotyping at sequencing ay dalawang pamamaraan na ginagawa upang makakuha ng impormasyon tungkol sa mga nucleic acid, pangunahin ang DNA ng isang organismo. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng genotyping at sequencing ay ang genotyping ay ang proseso ng pagtukoy kung aling genetic variant ang taglay ng indibidwal gamit ang mga marker habang ang sequencing ay ang pagtukoy ng tamang pagkakasunud-sunod ng nucleotide sequence sa loob ng ibinigay na fragment ng DNA.
Ano ang Genotyping?
Ang Genotyping ay ang pagpapasiya ng genetic makeup ng isang indibidwal gamit ang isang sequence ng DNA at mga marker at paghahambing at pagkakakilanlan ng inheritance nito. Ang genotyping ay mahalaga sa evolutionary biology, population biology, taxonomy, ecology, at genetics ng mga organismo. Maaari itong isagawa sa pamamagitan ng iba't ibang pamamaraan kabilang ang DNA sequencing, polymerase chain reaction, restriction fragment length polymorphism (RFLP), random amplified polymorphic detection, amplified fragment length polymorphism (AFLP), DNA microarrays, atbp.
Ang Genotyping ay nagsasangkot ng pagkakasunud-sunod ng mga partikular na maliliit na fragment ng mga sequence ng DNA at paghahanap ng pagkakaugnay ng genetic na komposisyon sa ibang mga indibidwal gamit ang mga genetic marker. Tinutukoy nito ang nag-iisang nucleotide polymorphism (SNPs) sa mga indibidwal o mga partikular na alleles. Naaangkop ang genotyping sa malawak na hanay ng mga organismo kabilang ang mga tao. Naaangkop din ito sa mga microorganism tulad ng mga virus, fungi atbp. at maaaring gamitin upang matukoy ang kanilang mga genetic na variant gamit ang mga reference na profile. Sa molecular epidemiology at forensic microbiology, ang pagkontrol sa mga pathogen, lalo na ang mga microorganism, ay ginagawa sa pamamagitan ng impormasyong nakuha mula sa genotyping. Napakahalaga ng genotyping sa pagsusuri ng pedigree. Ang mga tao ay genotyped upang kumpirmahin ang pagiging ina at pagiging ama. Ipapakita ng genotype ang nangingibabaw at recessive alleles ng mga gene na nagpapasya sa mga partikular na katangian.
Figure_1: RFLP Genotyping
Ano ang Sequencing?
Ang Sequencing ay ang proseso ng pagtukoy ng tamang pagkakasunud-sunod ng nucleotide sa isang partikular na fragment ng DNA o RNA. Halos lahat ng impormasyong kailangan para sa paglaki at pag-unlad ng isang organismo ay naka-encode sa genome nito. Ang pagkakaroon ng mga pamamaraan upang makagawa at paghiwalayin ang ilang daang mga nucleotide na mahahabang mga fragment ng nucleic acid ay humantong sa pagbuo ng mga pamamaraan ng pagtukoy ng eksaktong nucleotide sequence ng isang ibinigay na fragment ng DNA o RNA. Ang iba't ibang uri ng mga paraan ng pagkakasunud-sunod ay magagamit ngayon. Ang mga pamamaraan ng pagkakasunud-sunod na ito, kasama ang mga teknolohiya para sa pagtatayo ng mga aklatan ng genome na kumakatawan sa buong genome ng isang organismo, ay nagpapadali sa pagkakasunud-sunod ng buong genome ng organismong iyon, na gumagawa ng malalim na pagsusuri ng mga istruktura ng gene, mga function ng gene, mga lokasyon ng gene, mga expression ng gene, gene mapping, gene regulatory regions, atbp.
Ang kabuuang genome ng maraming virus, ilang bacteria, archaebacteria, yeast at ilang iba pang mga organismo ay na-sequence at na-map. Ginawang posible ng proyekto ng human genome na i-sequence at imapa ang buong genome ng tao at i-publish ang unang draft nito noong 2003. Ito ay isang pangunahing milestone sa pagsulong ng biology. Ginagamit na ngayon ang mga human genome sequence sa sektor ng medikal upang matukoy ang mga genetic na sanhi ng mga bihirang sakit, i-screen ang panganib ng sakit sa mga bagong silang, tukuyin ang mga genetic na detalye ng iba't ibang cancer, bumuo ng mga bagong therapeutics, at bumuo ng mga bagong diagnostic tool, atbp.
Sa mundo ng halaman, ang rice genome at Arabidopsis genome ay pinagsunod-sunod. Ang kaalaman sa mga pagkakasunud-sunod na ito ay walang alinlangan na magpapabago sa ating pag-unawa sa kung paano gumagana ang mga cell at organismo.
Figure_2: Isang autoradiograph ng sanger sequencing
Ano ang pagkakaiba ng Genotyping at Sequencing?
Genotyping vs Sequencing |
|
| Ang genotyping ay ang proseso ng pagtukoy sa genetic na komposisyon ng isang indibidwal at pagsuri sa grupo o taxonomy ng organismong iyon. | Ang sequencing ay ang proseso ng pagtukoy sa tumpak na pagkakasunud-sunod ng mga nucleotide ng isang partikular na DNA o RNA fragment. |
| Mga Teknik | |
| RFLP, Gene sequencing, PCR, DNA microarrays, AFLP atbp. | Sanger sequencing, Gilbert sequencing, Pyrosequencing, Next Generation Sequencing, Shotgun sequencing atbp. |
| Mga Pangunahing Alalahanin | |
| Ito ay higit na nag-aalala tungkol sa kung ang mga pagkakaiba ng genotype ay nagbibigay ng mga aktwal na pagkakaiba ng phenotype. | Ito ay higit na nababahala tungkol sa pagkakasunud-sunod ng mga nucleotide at ang mga pagkakaiba at pagbabago nito sa ibang mga organismo. |
Buod – Genotyping vs Sequencing
Genotyping at sequencing ay kapaki-pakinabang para sa pag-aaral ng genetic na impormasyon ng mga organismo. Ang genotyping ay ang proseso ng pagtukoy ng mga pagkakaiba-iba ng genotype sa mga indibidwal at paghahanap ng kanilang mga kategorya. Ang sequencing ay ang proseso ng pagtukoy ng tamang pagkakasunud-sunod ng mga nucleotide sa interesadong fragment o sa rehiyon ng DNA. Ang parehong mga diskarte ay nagbibigay ng mahalagang impormasyon tungkol sa mga gene at genome.
