Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng buong genome sequencing at exome sequencing ay ang buong genome sequencing ay nagsusunod-sunod sa buong genome ng isang organismo habang ang exome sequencing ay nagse-sequence lamang sa exome o ang protein-coding genes ng isang organismo.
Ang Sequencing ay isang pamamaraan na tumutukoy sa tumpak na pagkakasunud-sunod ng mga nucleotide sa isang partikular na molekula ng DNA. Sinasalamin lamang nito ang tamang pagkakasunud-sunod ng apat na base; adenine (A), guanine (G), cytosine (C) at thymine (T) sa isang fragment ng DNA. Mayroong ilang mga paraan ng sequencing tulad ng Sanger sequencing, next-generation sequencing, atbp. Higit pa rito, alinman sa kumpletong genome ng isang organismo (buong genome sequencing) o ang mga protein-coding genes lamang sa genome (exome sequencing) ang maaaring sumailalim sa sequencing.
Ano ang Whole Genome Sequencing?
Ang genome ng tao ay naglalaman ng halos tatlong bilyong baseng pares ng DNA. Ang buong genome sequencing ay isang paraan na nagse-sequence sa kumpletong genome ng isang organismo. Samakatuwid, sa buong genome sequencing, ang pagsasaalang-alang ay nasa buong koleksyon ng mga molekula ng DNA kabilang ang mga exomes, intron, intergenic space, atbp. Bukod dito, ang buong genome sequencing ay hindi lamang ang genome na naninirahan sa loob ng nucleus kundi pati na rin ang mitochondrial DNA..
Figure 01: Whole Genome Sequencing
Sa paghahanda para sa sequencing na ito, ang unang hakbang ay ang pagkuha ng buong DNA. Pagkatapos, ang na-extract na DNA ay sumasailalim sa sequencing procedure gamit ang isang angkop na sequencing method. Sa pamamagitan ng pagsusuri sa mga resultang sequence, paggamit ng bioinformatics tool, malalaman natin ang mga bihirang sakit, cancer, mga nakakahawang sakit, atbp.
Ano ang Exome Sequencing?
Ang Exome ay isang bahagi ng genome na naglalaman ng humigit-kumulang 1.5% ng genome, at ito ay koleksyon ng mga exon. Ang mga exon ay ang mga sequence na nag-transcribe sa mRNA at pagkatapos ay sa panghuling produkto ng protina. Samakatuwid, ang exome na pagkakasunud-sunod ng mga pagkakasunud-sunod ng buong protina-coding na mga pagkakasunud-sunod sa genome. Ang exome sequencing ay nagpapakita ng mga genetic disorder dahil ang karamihan sa mga genetic disorder ay lumitaw dahil sa mga mutasyon ng protina-coding genes. Samakatuwid, ang mga diagnostic na proseso ng mga genetic disorder ay madalas na gumagamit ng exome sequencing bilang isang paraan upang masuri ang sakit. Gayundin, kapag inihahambing sa buong aplikasyon ng pagkakasunud-sunod ng genome para sa pagsusuri sa genetic, ang exome sequencing ay tumatagal ng mas kaunting oras upang magamit at mas mura.
Figure 02: Exome Sequencing
Sa exome sequencing, una, kailangang piliin lamang ang mga sequence ng protein coding mula sa kabuuang DNA. Tandaan na ang mga tao ay may humigit-kumulang 180000 na pagkakasunud-sunod ng protina-coding. Pagkatapos, ang exome ay sequenced gamit ang isang high throughput sequencing method.
Ano ang Mga Pagkakatulad sa pagitan ng Whole Genome Sequencing at Exome Sequencing?
- Whole Genome Sequencing at Exome Sequencing ay dalawang application ng sequencing.
- Ang parehong paraan ay kapaki-pakinabang sa pagtukoy ng tamang pagkakasunud-sunod ng nucleotide sequence sa parehong pamamaraan.
- Gayundin, nakakatulong ang bioinformatics sa parehong mga diskarte sa pagsusuri ng data.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Whole Genome Sequencing at Exome Sequencing?
Binusunod-sunod ng buong genome sequencing ang buong DNA ng genome ng isang organismo, habang ang exome sequencing ay nagse-sequence lang ng mga protein coding sequence mula sa genome. Samakatuwid, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng buong genome sequencing at exome sequencing. Gayundin, kahit na ang parehong mga pamamaraan ay malawakang ginagamit upang matukoy ang tamang pagkakasunud-sunod ng nucleotide sequence, ang buong genome sequencing ay magastos at nakakaubos ng oras kaysa sa exome sequencing.
Ang infographic sa ibaba ay nag-tabulate ng pagkakaiba sa pagitan ng buong genome sequencing at exome sequencing.
Summary – Whole Genome Sequencing vs Exome Sequencing
Ang Sequencing ay nagpapakita ng tumpak na pagkakasunud-sunod ng mga base sa isang DNA fragment at maaari itong maging buong genome sequencing o exome sequencing. Dito, inaayos ng buong genome sequencing ang kumpletong genome ng isang organismo habang ang exome sequencing ay sinusunod lamang ang mga protein-coding sequence sa genome. Isinasaalang-alang ang kanilang mga aplikasyon, ang buong genome sequencing ay nakakatulong sa pagsusuri ng mga genetic aberrations gaya ng solong nucleotide variation, pagtanggal, pagsingit, atbp. sa buong genome habang ang exome sequencing ay nakakatulong sa pag-detect ng mga genetic na sakit. Samakatuwid, ito ang pagkakaiba sa pagitan ng buong genome sequencing at exome sequencing.
