Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng maximum na parsimony at maximum na posibilidad ay depende sa paraan na ginamit sa pagbuo ng phylogenetic tree. Ang maximum na parsimony ay nakatuon sa pag-minimize ng kabuuang mga estado ng character sa panahon ng pagbuo ng phylogenetic tree habang ang maximum na posibilidad ay isang istatistikal na diskarte sa pagguhit ng phylogenetic tree depende sa posibilidad sa pagitan ng genetic data.
Ang Phylogeny ay ang nobelang diskarte tungo sa pag-uuri at katawagan ng mga organismo. Ang Phylogeny ay umaasa sa genetic data at evolutionary relationships. Ang genetic data ay resulta ng DNA sequencing. Sa phylogeny, ang pag-uuri ng mga organismo ay nagaganap batay sa karaniwang ninuno. Pinapataas ng maximum na parsimony at maximum na posibilidad ng isang phylogenetic na relasyon ang katumpakan at pagiging maaasahan ng isang phylogenetic tree.
Ano ang Maximum Parsimony?
Sa pamamaraan ng maximum na parsimony, ang pagliit ng kabuuang pagbabago sa estado ng karakter ay nagaganap sa panahon ng pagsusuri ng phylogenetic. Ang Phylogenetic ay isang sangay ng biology na tumatalakay sa pag-aaral ng mga relasyon sa ebolusyon. Ang phylogenetic tree ay isang puno na nagpapakita ng mga ebolusyonaryong relasyon batay sa isang karaniwang ninuno. Kaya, kapag gumuhit ng isang phylogenetic tree gamit ang konsepto ng maximum na parsimony, ang halaga ng parallel evolution ay pinaliit. Samakatuwid, ang maximum na parsimony ay bubuo ng puno nang mas mabilis kaysa sa iba pang mga pamamaraan. Ito ay dahil ang mga pangunahing natatanging katangian lamang ang isinasaalang-alang sa maximum na parsimony.
Figure 01: Maximum Parsimony
Kapag gumuhit ng maximum na parsimonious tree, ang puno ay palaging ang pinakamaikling posibleng puno na may pinakamababang bilang ng taxa. Gayunpaman, ang pagiging maaasahan ng isang maximum na parsimonious tree ay napakataas. Mag-iiba ang statistical consistency at ang katumpakan ng phylogenetic na relasyon batay sa maximum na parsimony. Bukod dito, may mga kumplikadong algorithm na sinusuri ang maximum na parsimony ng isang phylogenetic na relasyon.
Ano ang Maximum Likelihood?
Ang pinakamataas na posibilidad ay isa sa mga pinaka ginagamit na istatistikal na pamamaraan na nagsusuri ng mga ugnayang phylogenetic. Susuriin ng pamamaraan ang phylogeny batay sa probability model. Dagdag pa, ang pamamaraang ito ay isinasaalang-alang ang parehong ibig sabihin at pagkakaiba. Kaya, sa phylogeny, ang pinakamataas na posibilidad ay nakukuha sa ibinigay na genetic data ng isang partikular na organismo.
Figure 02: Maximum Likelihood
Mayroong parehong mga pakinabang at disadvantages ng paggamit ng istatistikal na paraan ng pinakamataas na posibilidad. Ang pamamaraan ay napaka-angkop kapag sinusuri ang isang simpleng set ng data na naglalaman ng genetic na impormasyon. Kapag mas mababa ang antas ng pagkakaiba-iba sa genetic data, maaasahan ang pinakamataas na marka ng posibilidad. Ang mga resulta na nabuo sa pamamagitan ng maximum na posibilidad ay higit pang nagpapatunay sa maximum na mga marka ng parsimony ng isang partikular na phylogenetic na relasyon. Samakatuwid, ang pagsusuri sa maximum na posibilidad ay gumaganap bilang isang confirmative test.
Kung ihahambing sa mga pakinabang na nabanggit sa itaas, ang pamamaraang ito ay isang mabagal at matinding proseso. Higit pa rito, sa kawalan ng isang solong set ng data, mataas ang output ng error. Kaya, ginagawa rin nitong mas mahirap ang reproducibility ng mga resulta sa pamamagitan ng maximum na pagtatantya ng posibilidad.
Ano ang Mga Pagkakatulad sa pagitan ng Maximum Parsimony at Maximum Likelihood?
- Maximum parsimony at maximum likelihood ay dalawang approach na may mahalagang papel sa phylogeny.
- Ang parehong mga diskarte ay naglalarawan ng kaugnayan ng isang organismo sa ninuno nito batay sa genetic data na magagamit.
- Maaaring bigyang-kahulugan ang mga phylogenetic tree gamit ang parehong maximum na parsimony at maximum na posibilidad.
- Sa parehong mga diskarte, umaasa ang genetic data sa DNA sequencing o RNA sequencing.
- Ang parehong paraan ay mahalaga sa pagbuo ng mga phylogenetic tree.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Maximum Parsimony at Maximum Likelihood?
Ang parehong maximum na parsimony at maximum na posibilidad ay dalawang magkaibang diskarte sa pagbibigay-kahulugan sa isang phylogenetic tree. Ang maximum na parsimony ay naniniwala sa pagsusuri ng ilang mga katangian at pagliit ng mga pagbabago sa karakter mula sa organismo patungo sa organismo. Sa kabaligtaran, ang maximum na paraan ng posibilidad ay isinasaalang-alang ang parehong ibig sabihin at ang pagkakaiba at makakuha ng pinakamataas na posibilidad sa ibinigay na genetic na data ng isang partikular na organismo. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng maximum na parsimony at maximum na posibilidad.
Higit pa rito, ang pagiging maaasahan ng maximum na parsimony lamang ay hindi sapat upang makakuha ng konklusyon. Ngunit, ang maximum na paraan ng posibilidad ay gumaganap bilang isang confirmative test ng mga resulta ng maximum na parsimony. Kaya, ang mga konklusyon ay dapat gawin gamit ang parehong maximum na parsimony at maximum na posibilidad.
Ibinubuod ng infographic sa ibaba ang pagkakaiba sa pagitan ng maximum na parsimony at maximum na posibilidad.
Buod – Maximum Parsimony vs Maximum Likelihood
Ang Phylogeny ay gumaganap ng mahalagang papel sa pagkuha ng mga ebolusyonaryong relasyon sa pamamagitan ng pagbuo ng mga phylogenetic tree. Ang maximum na parsimony ay ang pamamaraan ng pagbuo ng isang puno na may pinakamababang bilang ng pagbabago sa estado ng karakter. Sa kaibahan, ang maximum na posibilidad ng isang phylogenetic tree ay nakasalalay sa paggamit ng maximum na pagkakapareho sa pagitan ng genetic data. Ang data para sa parehong pagsusuri ay nagmumula sa DNA o RNA sequence data. Ang pagiging maaasahan at katumpakan ay mataas kapag ang pagtatayo ng puno ay nagaganap gamit ang parehong mga pamamaraan. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng maximum na parsimony at maximum na posibilidad.
