Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng proteomics at metabolomics ay ang proteomics ay ang pag-aaral ng lahat ng protina ng isang organismo habang ang metabolomics ay ang pag-aaral ng lahat ng metabolites ng isang organismo.
Ang Genomics ay ang pag-aaral ng genetic make-up ng isang organismo. Ang proteomics at metabolomics ay dalawang omic science na nauugnay sa genomics. Ang proteome ay tumutukoy sa lahat ng mga protina sa isang cell o isang organismo. Ang metabolome, sa kabilang banda, ay tumutukoy sa lahat ng mga metabolite ng isang organismo. Kaya, ang pag-aaral ng proteome ay ang proteomics habang ang pag-aaral ng metabolome ay ang metabolomics. Ang parehong proteomics at metabolomics ay mahalaga sa diagnostics ng sakit at sa characterization at screening ng mga organismo. Bukod dito, pareho silang konektado sa maraming aspeto ng cell biology, lalo na sa cell signaling, pagkasira at pagkabuo ng protina at post-translational modification.
Ano ang Proteomics?
Ang Proteome ay ang kabuuang protina na pandagdag sa isang cell, tissue o isang organismo. Samakatuwid, ang proteomics ay ang pag-aaral ng proteome ng isang organismo. Sa proteomics, nasusuri ang iba't ibang katangian ng mga protina. Samakatuwid, ang proteomics ay pangunahing nakatuon sa istraktura, oryentasyon, pag-andar, pakikipag-ugnayan ng protina, pagbabago, aplikasyon at kahalagahan ng mga protina. Kaya naman maraming proyekto sa pagsasaliksik ang isinasagawa sa larangan ng proteomics sa kasalukuyan.
Ang unang pag-aaral ng proteomic ay ginawa upang matukoy ang nilalaman ng protina sa Escherichia coli. Ang pagmamapa ng kabuuang nilalaman ng protina ay ginawa gamit ang dalawang dimensional (2D) gels. Matapos ang tagumpay ng proyektong ito, ang mga siyentipiko ay lumipat sa pagkilala sa kabuuang nilalaman ng protina sa mga hayop tulad ng mga guinea pig at mice. Sa kasalukuyan, ginagawa ang pagmamapa ng protina ng tao gamit ang 2D gel electrophoresis.
Maraming pakinabang ng pag-aaral ng proteomics dahil ang mga protina ang namamahala sa mga molekula ng karamihan sa aktibidad dahil sa catalyst property ng mga protina. Kaya, ang pag-aaral ng buong protina ay maaaring magbigay ng impormasyon tungkol sa kalagayan ng kalusugan ng isang organismo. Bukod dito, maraming aplikasyon ang proteomics sa genome annotation, pagkilala sa sakit at diagnostics, pagsasagawa ng mga pag-aaral sa expression ng protina sa panahon ng eksperimento at pagbabago ng protina at pag-aaral ng pakikipag-ugnayan, atbp.
Figure 01: Proteomics
May iba't ibang mga pamamaraan na kasangkot sa proteomics, kabilang ang pagkuha ng kabuuang protina, paghihiwalay ng mga ito gamit ang 2D gel electrophoresis, pagkakasunud-sunod ng mga nakuhang protina gamit ang mga pamamaraan tulad ng Edmund's sequencing method o mass spectrometry at pagsusuri ng structural at functional. mga katangian ng protina gamit ang computer-based software at bioinformatics tool.
Ano ang Metabolomics?
Ang Metabolomics ay ang pag-aaral ng lahat ng metabolites sa isang cell, tissue o isang organismo. Kabilang dito ang pagkilala at pag-quantification ng mga cellular metabolites gamit ang iba't ibang advanced na analytical at statistical tool. Ang Metabolomics ay isang mahalagang pag-aaral dahil ito ay nagpapakita ng impormasyon tungkol sa metabolismo ng isang organismo.
Figure 02: Metabolomics
Upang pag-aralan ang mga substrate at produkto ng mga metabolic reaction, ginagamit ng metabolomics ang mass spectrometry bilang isang analytical platform. Ang mass spectrometry ay nagreresulta sa mga metabolite at kanilang mga konsentrasyon, na sumasalamin sa aktwal na biochemical na estado ng mga selula o mga tisyu. Samakatuwid, ang metabolomics ay maaaring ituring na pinakamahusay na representasyon ng molekular na phenotype ng isang organismo. Bilang karagdagan sa mga ito, ang metabolomics ay maaaring ituring na extension ng proteomics dahil karamihan sa mga metabolite ay nabuo dahil sa mga aktibidad ng mga enzyme na mga protina.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Proteomics at Metabolomics?
- Proteomics at metabolomics ay dalawang omic science na nauugnay sa genomics.
- Maaaring ituring ang metabolomics bilang extension ng proteomics.
- Proteome at metabolome ay malapit na magkakaugnay sa maraming pag-aaral.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Proteomics at Metabolomics?
Ang Proteomics ay ang malakihang pag-aaral ng mga protina kasama ang kanilang istraktura at paggana, sa loob ng isang cell o isang organismo. Samantala, ang metabolomics ay ang pag-aaral ng mga profile ng metabolite sa isang cell, tissue o organismo sa ilalim ng isang ibinigay na hanay ng mga kondisyon. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng proteomics at metabolomics. Bukod pa rito, ang mga proteomic ay pangunahing may kinalaman sa kumpletong hanay ng mga protina habang ang metabolomics ay higit sa lahat ay may kinalaman sa kumpletong hanay ng mga metabolite, kabilang ang isang magkakaibang hanay ng mga maliliit na molekula tulad ng peptides, carbohydrates, lipids, nucleosides, at catabolic na mga produkto ng mga exogenous compound, atbp. Samakatuwid, ito ay isa pang pagkakaiba sa pagitan ng proteomics at metabolomics.
Ang infographic sa ibaba ay nagbubuod ng pagkakaiba sa pagitan ng proteomics at metabolomics.
Buod – Proteomics vs Metabolomics
Maaaring pag-aralan ang mga buhay na organismo gamit ang kanilang genome, protina at metabolites. Ang genomics, proteomics at metabolomics ay ang tatlong lugar na nag-aaral ng genetic make-up, protina at metabolites ng isang cell o isang organismo, ayon sa pagkakabanggit. Mahalaga ang Proteomics dahil ito ay isang dinamikong pagmuni-muni ng parehong mga gene at kapaligiran. Napakahalaga ng metabolismo dahil direktang sinasalamin nito ang kasalukuyang katayuan ng biochemical reaction ng mga cell o metabolic status ng isang organismo. Kaya, ito ay nagbubuod ng pagkakaiba sa pagitan ng proteomics at metabolomics.
