Mahalagang Pagkakaiba – Metabolomics kumpara sa Metabonomics
Ang Metabolites ay ang maliliit na molekula na kasangkot sa mga metabolic reaction sa mga selula. Kasama sa mga metabolite ang mga metabolic intermediate, hormones, pangalawang metabolites, signaling molecules, atbp. Sila ang gumaganang molecule ng biochemical reactions ng mga cell. Ang isang kumpletong hanay ng mga metabolite ng isang biological sample o isang solong organismo ay kilala bilang metabolome. Ang Metabolome ay isang dynamic na koleksyon na nagbabago bawat segundo sa loob ng katawan. Ang metabolomics at metabonomics ay dalawang termino na nauugnay sa pag-aaral ng metabolismo ng isang organismo. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng metabolomics at metabonomics ay ang metabolomics ay mas nababahala tungkol sa normal na endogenous metabolism at metabolic profiling sa antas ng cellular o organ habang ang metabonomics ay mas nababahala sa pagpapalawak ng metabolic profiling na may impormasyon ng mga perturbations ng metabolismo dahil sa mga kadahilanan sa kapaligiran, sakit, gat. microorganism at paghahambing ng metabolic profiling, atbp. Ang metabolismo ay pangunahing hinihimok ng mass spectrometry, at ang metabonomics ay gumagamit ng NMR spectroscopy para sa metabolite analysis.
Ano ang Metabolomics?
Ang Metabolomics ay ang pag-aaral ng mga metabolic na proseso na nangyayari sa mga cell, biofluids, tissue o organismo. Kabilang dito ang pagkilala at pag-quantification ng mga cellular metabolites gamit ang mahusay na analytical at statistical tool. Ang metabolismo ay itinuturing na isang mahalagang pag-aaral dahil ito ay nagpapakita ng impormasyon tungkol sa metabolismo ng isang organismo.
Upang pag-aralan ang mga substrate at produkto ng mga metabolic reaction, ginagamit ng metabolomics ang mass spectrometry bilang isang analytical platform. Ang mass spectrometry ay nagpapakita ng mga uri ng mga metabolite at ang kanilang mga konsentrasyon, na sumasalamin sa aktwal na biochemical na estado ng mga selula o mga tisyu. Samakatuwid, ang metabolomics ay maaaring ituring na pinakamahusay na kinatawan ng molekular na phenotype ng isang organismo. Ang Metabolomics ay isang teknolohiyang omic ng maliliit na molekula ng mga organismo at kumpara sa iba pang pag-aaral ng omic; Napakahalaga ng metabolismo dahil direktang sinasalamin nito ang kasalukuyang katayuan ng biochemical reaction ng mga cell.
Maaari ding ituring ang metabolomics bilang extension ng proteomics dahil nabuo ang mga ito dahil sa mga aktibidad ng enzymes na mga protina tulad ng ipinapakita sa sumusunod na figure.
Figure 01: Metabolomics scheme
Ano ang Metabonomics?
Ang Metabonomics ay tinukoy bilang isang quantitative measurement ng multiparametric metabolic responses sa mga partikular na oras kaugnay ng pathophysiologic stresses o genetic modification. Karaniwan itong inilalapat sa mga pag-aaral na isinagawa tungkol sa nutrisyon ng tao at mga tugon sa mga gamot o sakit. Ang diskarte na ito ay pinasimunuan ni Jeremy Nicholson sa Imperial College, London at ito ay ginamit sa maraming larangan kabilang ang toxicology, diagnosis ng sakit, nutrisyon, atbp. Sa kasaysayan, ang metabonomics ay isa sa mga unang paraan upang mailapat ang saklaw ng system biology sa mga pag-aaral ng metabolismo.
Ang Metabonomics ay mas nababahala tungkol sa paghahambing ng mga biochemical profile kaysa sa pagtukoy ng mga indibidwal na metabolic compound sa metabolomics. Samakatuwid, ang metabonomics ay maaaring tukuyin bilang isang subset ng metabolomics. Pangunahing binibigyang-diin nito ang paghahambing ng mga metabolic profile ng iba't ibang populasyon na may paggalang sa mga sakit, stress sa kapaligiran, pagbabago ng genetic, nutrisyon, gamot, atbp. dahil ang mga metabolite ay ang mahusay na mga marker na nagpapahiwatig ng mga kondisyon ng sakit, mga epekto ng mga gamot, mga stress sa kapaligiran, pagkakalantad sa mga lason., atbp.
Metabonomic na pag-aaral ay nagpapakita ng parehong intracellular at extracellular metabolites. Gumagamit ito ng mga diskarte sa mataas na throughput upang pag-aralan ang isang malaking bilang ng mga metabolite nang sabay-sabay at paulit-ulit, na nagpapagana ng temporal na pagsisiyasat ng physiological status ng mga cell. Inihayag din nito ang ugnayan sa pagitan ng mga metabolite at pathological status ng organismo. Upang suportahan ang pag-aaral ng metabonomic, maaaring gamitin ang genomics at proteomics dahil magkakaugnay ang mga ito tulad ng ipinapakita sa figure sa itaas.
Ano ang pagkakaiba ng Metabolomics at Metabonomics?
Metabolomics vs Metabonomics |
|
| Ang Metabolomics ay ang pag-aaral ng kumpletong hanay ng mga metabolite ng isang organismo | Ang Metabonomics ay ang quantitative study ng multiparametric metabolic responses ng mga living system sa temporal na batayan sa pathophysiological stimuli o genetic modification. |
| Pangunahing Alalahanin | |
| Ang Metabolomics ay higit na nababahala sa metabolic profiling at pagtukoy ng mga indibidwal na metabolite na nasa mga cell. | Mas nababahala ang Metabonomics sa paghahambing ng mga metabolite o metabolic profile ng mga populasyon kaugnay ng mga genetic modification, sakit, stress sa kapaligiran, pathological stimuli, droga, atbp. |
| Impormasyon | |
| Ang Metabolomics ay pangunahing nakatuon sa endogenous metabolism. | Ang Metabonomics ay hindi limitado sa endogenous metabolism. Lumalawak ito upang makahanap ng impormasyon tungkol sa mga kaguluhan sa metabolismo na dulot ng panloob at panlabas na mga salik gaya ng mga pattern ng pandiyeta, lason, proseso ng sakit, atbp. |
| Analytical Tools | |
| Gumagamit ito ng mass spectrometry bilang pangunahing platform ng analytical | Metabonomics ay gumagamit ng NMR spectroscopy bilang pangunahing analytical platform. |
Buod – Metabolomics vs Metabonomics
Ang Metabolome ay kumakatawan sa kumpletong hanay ng maliliit na molekula na tinatawag na metabolites na nasa isang cell o sa isang organismo. Ang Metabolomics ay ang pag-aaral ng buong metabolismo upang makabuo ng metabolic profile. Ang Metabolomics ay nagpapahintulot sa mga siyentipiko na sukatin ang aktwal na physiological status ng cell o ng organismo. Ang Metabonomics ay isang bahagi ng metabolomics na umaabot upang kunin ang impormasyon tungkol sa mga multiparametric metabolic na tugon ng mga buhay na sistema sa pathophysiological stimuli at genetic modifications. Ang Metabonomics ay hindi lamang nababahala sa indibidwal na metabolic profiling tulad ng metabolomics; inihahambing nito ang mga metabolic profile na may kaugnayan sa iba pang mga kadahilanan tulad ng mga stress sa kapaligiran, sakit, lason, atbp. Ang parehong metabolomics at metabonomics ay kinabibilangan ng mga pag-aaral ng mga metabolite ng mga organismo upang masukat ang aktwal na pisyolohikal na katayuan ng mga selula. Kaya, kung minsan ang dalawang ito ay itinuturing na kasingkahulugan, nang hindi isinasaalang-alang ang pagkakaiba sa pagitan ng metabolomics at metabonomics.
