Mahalagang Pagkakaiba – Proteomics kumpara sa Transcriptomics
Ang teknolohiyang omic ay kasalukuyang uso, kung saan ang iba't ibang biomolecules ng isang organismo ay tinitingnan bilang isang buong koleksyon patungkol sa mga katangian at paggana nito. Ang teknolohiya ng omic ay may malawak na hanay ng mga aplikasyon. Kasama sa iba't ibang omics ng isang biological sample ang genomics, proteomics, transcriptomics at metabolomics. Ang Proteomics ay nagsasangkot ng kumpletong pag-aaral ng lahat ng mga protina sa isang buhay na organismo. Ito ay tinukoy bilang ang hanay ng lahat ng ipinahayag na protina sa isang organismo, ang istruktura at functional na mga katangian nito. Ang kumpletong hanay ng mga protina, samakatuwid, ay bumubuo ng proteome. Ang Transcriptomics ay ang kumpletong pag-aaral ng lahat ng messenger RNA (mRNA) molecules na nasa isang buhay na organismo. Kaya, ang transcriptomics ay tumatalakay sa mga gene na aktibong ipinahayag sa isang buhay na organismo. Ang kabuuang hanay ng mRNA sa isang buhay na organismo ay tinutukoy bilang transcriptome. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng Proteomics at Transcriptomics ay batay sa uri ng biomolecule. Sa proteomics, ang kabuuang hanay ng mga ipinahayag na protina sa isang buhay na organismo ay pinag-aaralan samantalang, sa transcriptomics, ang kabuuang mRNA ng isang buhay na organismo ay pinag-aaralan.
Ano ang Proteomics?
Ang terminong proteomics ay likha noong taong 1995 at unang tinukoy bilang kabuuang protina na pandagdag sa isang cell, tissue o isang organismo. Sa pagsulong sa pag-aaral ng proteomic, binago ito upang ituring bilang isang payong termino kung saan maraming mga larangan ng pag-aaral ang kasama. Sa kasalukuyan, sa ilalim ng paksang proteomics, pinag-aaralan ang istraktura, oryentasyon, mga pag-andar, mga pakikipag-ugnayan nito, mga pagbabago nito, mga aplikasyon nito at ang kahalagahan ng mga protina. Samakatuwid, maraming pananaliksik ang isinasagawa sa larangan ng proteomics sa kasalukuyan.
Ang unang pag-aaral ng proteomic ay ginawa upang matukoy ang nilalaman ng protina sa Escherichia coli. Ang pagmamapa ng kabuuang nilalaman ng protina ay ginawa gamit ang dalawang dimensional (2D) gels. Sa tagumpay nito, ang mga siyentipiko ay lumipat sa pagkilala sa kabuuang nilalaman ng protina sa mga hayop tulad ng mga guinea pig at mice. Sa kasalukuyan, ginagawa ang pagmamapa ng protina ng tao gamit ang 2D gel electrophoresis.
Applications of Proteomics
Maraming bentahe ng pag-aaral ng proteomics, dahil ang mga protina ang namamahala sa mga molekula ng karamihan sa aktibidad dahil sa catalyst property ng mga protina. Kaya, ang pag-aaral ng buong protina ay maaaring magbigay ng impormasyon tungkol sa kalagayan ng kalusugan ng isang organismo. Ang ilang mga application ay;
- Genome annotation: Sa pamamagitan ng pag-aaral sa nilalaman ng protina ng isang organismo, matutukoy ang eksaktong mga genome na responsable para sa aktibong compound ng protina. Sa sitwasyong ito, ang mga resulta mula sa lahat ng genomics, Transcriptomics at proteomics ay mahalaga.
- Pagkilala sa sakit / Diagnostics: Ginagamit ang proteomics sa pagtukoy ng kondisyon ng sakit, sa pamamagitan ng paghahambing ng malusog at may sakit
- Upang isagawa ang expression ng protina na pinag-aralan sa panahon ng eksperimento.
- Mga pagbabago sa protina at pag-aaral sa pakikipag-ugnayan: Upang magamit ang mga protina sa mga kondisyon ng vitro o at sa mga kondisyon ng vivo, upang magpasya sa mga kondisyon ng imbakan ng mga nakuhang protina na ito at upang pag-aralan ang pag-uugali ng protina sa in vitro, in vivo at in – mga pamamaraan ng silico.
Figure 01: Proteomics
May iba't ibang diskarteng kasama sa proteomics
- Pagkuha ng kabuuang protina at paghihiwalay ng mga protina gamit ang 2D gel electrophoresis. Maaari ding paghiwalayin ang mga protina gamit ang High-Performance Liquid Chromatography (HPLC).
- Pagkakasunud-sunod ng mga nakuhang protina gamit ang mga pamamaraan gaya ng paraan ng pagkakasunud-sunod ni Edmund o mass spectrometry.
- Kapag natukoy na ang mga sequence, susuriin ang istruktura at functional na mga katangian ng nilalaman ng protina gamit ang computer-based na software at bioinformatics na mga tool.
Ano ang Transcriptomics?
Ang transcriptome term ay ginawa kamakailan. Ang Transcriptomics ay ang pag-aaral ng kabuuang nilalaman ng mRNA ng isang organismo. Ang kabuuang mRNA ay ang ipinahayag na DNA sa isang buhay na organismo o isang cell. Ang kumpletong koleksyon ng mRNA ay tinutukoy bilang isang transcriptome.
Ang mga hakbang patungo sa pagsusuri sa transcriptome ay kinabibilangan ng,
- Pagkuha ng RNA, paghihiwalay ng mRNA gamit ang column gel chromatography na may poly DT beads.
- Ang sequencing ng mRNA ay tapos na.
Ang Microarray technology ay isang karaniwang paraan ng pagtukoy sa transcriptome ng isang organismo. Ang pamamaraan ng microarray ay nagsasangkot ng isang probe plate na may mga pantulong na hibla ng transcriptome. Sa hybridization, ang mRNA na nasa organismo o mga cell ay maaaring matukoy.
Figure 02: Transcriptomic Techniques
Ang Transcriptomics ay malawak na ngayong ginagamit sa medikal na larangan. Ang mga diagnostic ng sakit at profile ng sakit ay mga pangunahing field kung saan ginagamit ang Transcriptomics. Sa pamamagitan ng pagsusuri sa isang transcriptome ng isang organismo, maaaring makilala ang dayuhang mRNA, at kung mayroong anumang mga impeksyon, maaari itong makilala. Ang non-coding RNA ay maaaring paghiwalayin gamit ang transcriptomic na teknolohiya. At gayundin ang pagpapahayag ng mga gene sa ilalim ng iba't ibang stress sa kapaligiran ay maaaring masubaybayan.
Ano ang Mga Pagkakatulad sa pagitan ng Proteomics at Transcriptomics?
- Parehong bahagi ng konsepto ng omic technology.
- Parehong ginagamit sa mga diagnostic ng sakit at paglalarawan ng sakit ng isang organismo.
- Ang parehong lugar ng pag-aaral ay may kinalaman sa pagkuha ng biomolecule, paghihiwalay ng biomolecule at mga hakbang sa pagkakasunud-sunod.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Proteomics at Transcriptomics?
Protemics vs Transcriptomics |
|
| Kabilang sa Proteomics ang kumpletong pag-aaral ng lahat ng protina sa isang buhay na organismo. | Ang Transcriptomics ay ang kumpletong pag-aaral ng lahat ng messenger RNA (mRNA) molecules na nasa isang buhay na organismo. |
| Napag-aralan ang Uri ng Bio Molecule | |
| Ang mga protina ay pinag-aaralan sa proteomics. | mRNA ay pinag-aaralan sa transcriptomics. |
| Mga Salik na Pinag-aralan | |
| Ang istraktura, paggana, pakikipag-ugnayan, pagbabago at paggamit ng mga protina ay pinag-aaralan sa proteomics. | Ang istraktura ng pagkakasunud-sunod, mga pakikipag-ugnayan sa kapaligiran at mga aplikasyon ng mRNA ay pinag-aaralan sa transcriptomics. |
Buod – Proteomics vs Transcriptomics
May mahalagang papel ang Omics sa larangan ng mga agham ng buhay. Ang Proteomics ay tumutukoy sa pag-aaral ng proteome na bumubuo ng kumpletong koleksyon ng mga protina sa isang cell o isang organismo. Ang Transcriptomics ay tumutukoy sa pag-aaral ng transcriptome na siyang kumpletong hanay ng ipinahayag na DNA na nasa anyo ng mRNA. Ang dalawang lugar ng pag-aaral, proteomics at transcriptomics, ay hinango pagkatapos ng pagpapakilala ng genomics at kasalukuyang malawak na ginagamit sa mga medikal na diagnostic at sa characterization at screening ng mga organismo. Ito ang pagkakaiba sa pagitan ng proteomics at transcriptomics.
I-download ang PDF ng Proteomics vs Transcriptomics
Maaari mong i-download ang PDF na bersyon ng artikulong ito at gamitin ito para sa offline na layunin ayon sa tala ng pagsipi. Paki-download ang bersyon ng PDF dito: Pagkakaiba sa pagitan ng Proteomics at Transcriptomics
