Agarose vs Polyacrylamide
Ang Agarose at Polyacrylamide ay parehong water-soluble polymer ngunit, sa pagitan ng mga ito, maraming pagkakaiba ang makikita, simula sa kanilang pinagmulan. Parehong Agarose at Polyacrylamide ay may isang bagay na karaniwan sa kanilang kakayahang bumuo ng mga porous gel matrice. Sa kabila nito, mayroong isang bilang ng mga natatanging pagkakaiba sa pagitan ng dalawa. Ang mga pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng parehong polymer na ito ay nakasalalay sa kanilang likas na pinagmulan, kemikal na istraktura, kanilang iba't ibang gamit, at ang kanilang pagganap sa mga tuntunin ng gel electrophoresis.
Ano ang Agarose?
Ang Agarose ay isang natural na nagaganap na linear polymer na nagmula naman sa isang kumplikadong polymer na tinatawag na agar na matatagpuan sa seaweed. Ang agarose ay nakuha mula sa agar sa pamamagitan ng pagtanggal ng bahagi ng protina nito na tinatawag na agaropektin. Ang agarose ang nagbibigay sa agar ng kakayahang bumuo ng mga gel.
Ang pangunahing paggamit ng agarose ay sa microbiological at molecular biological studies. Sa microbiological studies, ang agarose, kapag dinagdagan ng angkop na nutrients, ay nagbibigay ng solidong base para sa paglinang ng mga microorganism tulad ng bacteria at fungi. Kapag ginamit sa mga semi-solid na konsentrasyon, maaari itong maging kapaki-pakinabang sa pagtatasa ng motility ng mga microorganism na ito. Sa molecular biology, ito ay nagsisilbing isang mahalagang kasangkapan para sa isa sa mga pinakapangunahing proseso ng paglutas na tinatawag na 'gel electrophoresis' o 'agarose gel electrophoresis' (AGE). Ang gel electrophoresis ay isang proseso na nagbibigay-daan para sa paglutas o paghihiwalay ng mga nucleic acid o protina batay sa kanilang laki at singil. Dito, ang agarose ay nagsisilbing porous na parang salaan na gel kung saan nangyayari ang paghihiwalay.
Agarose Structure
Ano ang Polyacrylamide?
Ang Polyacrylamide ay isang synthetic polymer at ginagamit sa iba't ibang uri ng industriya. Tulad ng naunang nabanggit, ang paggamit nito ay nakasalalay sa kakayahan nitong bumuo ng mga gel. Gayunpaman, bilang karagdagan dito, ang kakayahang magpanatili at mag-alis ng tubig sa iba't ibang konsentrasyon ay pinagsasamantalahan din sa iba't ibang industriya.
Ang pinakalaganap at karaniwang paggamit ng polyacrylamide ay sa waste water treatment. Dito, ginagamit ito bilang isang flocculating agent upang alisin ang anumang nasuspinde na organikong materyal; samakatuwid, pagpapabuti ng labo at paglilinaw ng tubig. Ang isa pang paggamit ng polyacrylamide ay sa industriya ng papel. Dito, ginagamit ito upang mapanatili o maubos ang tubig mula sa pulp ng papel kung kinakailangan. Katulad nito, sa industriya ng agrikultura at konstruksiyon, ginagamit ito bilang isang conditioner ng lupa upang maiwasan ang pagguho ng lupa at mapabuti ang kalidad nito.
Tulad ng agarose, ginagamit din ang polyacrylamide sa molecular biology bilang isang mahalagang tool sa pagresolba sa katulad na proseso na tinatawag na 'Polyacrylamide gel electrophoresis' (PAGE). Bilang karagdagan sa lahat ng ito, ang Polyacrylamide ay ginagamit din sa pagproseso ng mineral at pagmamanupaktura ng flocculating agent upang alisin ang anumang nasuspinde na organikong materyal; samakatuwid, pagpapabuti ng labo at paglilinaw ng tubig. Ang isa pang paggamit ng polyacrylamide ay sa industriya ng papel. Dito, ginagamit ito upang mapanatili o maubos ang tubig mula sa pulp ng papel kung kinakailangan. Katulad nito, sa mga industriya ng agrikultura at konstruksiyon, ginagamit ito bilang isang conditioner ng lupa upang maiwasan ang pagguho ng lupa at mapabuti ang kalidad nito. Bilang karagdagan sa lahat ng ito, ginagamit din ang Polyacrylamide sa paggawa ng mga food additives, soft contact lens, at textiles.
Polyacrylamide Structure
Ano ang pagkakaiba ng Agarose at Polyacrylamide?
Pinagmulan ng Agarose at Polyacrylamide:
Agarose: Ang Agarose ay isang polymer na natural na pinagmulan. Ito ay hango sa seaweed.
Polyacrylamide: Ang polyacrylamide ay synthetic na pinagmulan at hindi matatagpuan sa ilalim ng anumang natural na pangyayari.
Molecular Formula ng Agarose at Polyacrylamide:
Agarose: Ang molecular formula ng agarose ay C24H38O19.
Polyacrylamide: Ang molecular formula ng polyacrylamide ay (C 3H5NO)n.
Kemikal na Istraktura ng Agarose at Polyacrylamide:
Agarose: Ang Agarose ay isang linear polysaccharide. Binubuo ito ng paulit-ulit na disaccharide unit na tinatawag na agrobiose na pinagsasama-sama ng hydrogen bonds.
Polyacrylamide: Ang polyacrylamide ay isang chemically cross-linked polymer. Binubuo ito ng mga acrylamide monomer at isang crosslinking agent na N, N’-methylenebisacrylamide.
Toxicity ng Agarose at Polyacrylamide:
Agarose: Parehong hindi nakakalason ang agarose at ang monomer unit nito na agrobiose.
Polyacrylamide: Ang monomer unit ng polyacrylamide, ang acrylamide, ay isang ipinapalagay na carcinogen at kilalang neurotoxin habang ito ay polymerised form ay hindi nakakalason sa kalikasan.
Mga Katangian ng Agarose at Polyacrylamide Gels:
AGE at PAGE:
Agarose: Ang paghahanda ng agarose gel para sa AGE ay mas kaunting oras, madali at simple, at hindi nangangailangan ng initiator o polymerising catalyst.
Polyacrylamide: Ang paghahanda ng polyacrylamide gel para sa PAGE ay matagal at nakakapagod at nangangailangan din ng isang initiator (ammonium persulphate) at polymerising catalyst (N, N, N', N'-tetramethylethylendiamine – TEMED).
Nature:
Ang mga polyacrylamide gel ay mas matatag sa kemikal kaysa sa mga agarose gel.
Laki ng Porma:
Dahil sa parehong konsentrasyon, ang mga polyacrylamide gel matrice ay may posibilidad na magkaroon ng mas maliit na laki ng butas kumpara sa isang agarose gel matrix.
Pagbabago ng Laki ng Pore:
Ang laki ng butas ng butas ng mga polyacrylamide gel ay maaaring baguhin sa mas kontroladong paraan kaysa sa mga agarose gel.
Kapangyarihan sa Pagresolba:
Ang polyacrylamide gel ay may mataas na resolving power habang ang agarose gels ay may mababang resolving power.
Accommodating Nucleic Acid:
Polyacrylamide gels ay kayang tumanggap ng mas malaking dami ng nucleic acid kaysa agarose gels para sa paraan ng pagresolba.
