Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng agarose at polyacrylamide gel electrophoresis ay ang agarose gel electrophoresis ay gumagamit ng horizontally poured agarose gels upang paghiwalayin ang medyo mas malalaking fragment ng DNA, habang ang polyacrylamide gel electrophoresis ay gumagamit ng vertically poured polyacrylamide gels upang paghiwalayin ang mas maiikling nucleic acid fragment.
Ang Electrophoresis ay isang uri ng technique na gumagamit ng electric field na inilapat sa isang gel matrix upang paghiwalayin ang mga biomolecule gaya ng DNA, RNA, at mga protina. Ang paghihiwalay na ito ng mga biomolecule tulad ng DNA, RNA, at mga protina sa pamamagitan ng electrophoresis ay batay sa singil at laki. Ang mga sample ay inilalagay sa mga balon ng gel. Mamaya, ang electric field ay inilapat sa buong gel. Ang patlang ay nagiging sanhi ng negatibong sisingilin na mga molekula upang lumipat patungo sa positibong elektrod. Ang gel matrix ay gumaganap bilang isang molecular sieve kung saan ang pinakamaliit na molekula ay dumadaan o mabilis na naglalakbay habang ang mga malalaking molekula ay mabagal na gumagalaw. Ito ay nagbibigay-daan sa paghihiwalay ng mga molekula batay sa singil at laki. Samakatuwid, ang agarose at polyacrylamide gel electrophoresis ay dalawang uri ng mga diskarte sa gel electrophoresis na pangunahing tumutulong sa paghiwalayin ang mga molekula batay sa kanilang laki at singil.
Ano ang Agarose Gel Electrophoresis?
Ang Agarose gel electrophoresis ay isang pamamaraan na gumagamit ng mga agarose gel upang paghiwalayin ang mga biomolecule gaya ng DNA at RNA. Ito ay isang pamamaraan na ginagamit upang paghiwalayin ang mga nucleic acid pangunahin sa laki. Ang pangunahing tambalang tinatawag na agarose na ginamit sa pamamaraang ito ay isang polysaccharide. Galing ito sa seaweeds. Ang agarose ay maaaring matunaw sa kumukulong buffer at pagkatapos ay maaaring ibuhos sa isang tray na pinananatiling pahalang. Sa tray, ito ay nagiging solid kapag lumamig ito upang bumuo ng isang slab. Ang mga agarose gel ay ibinubuhos na may suklay na nakalagay upang gumawa ng mga balon kung saan nilalagay ang mga nucleic acid gaya ng DNA o RNA kapag ang gel ay tumigas na.
Figure 01: Agarose Gel Electrophoresis
Ang gel ay inilubog sa ibang pagkakataon sa isang naaangkop na buffer, at ang isang kasalukuyang ay inilapat sa kabuuan ng gel. Ang DNA ay may pare-parehong negatibong singil na independiyente sa pagkakasunud-sunod na komposisyon ng molekula. Samakatuwid, ang mga molekula ng DNA ay lilipat mula sa cathode (-) patungo sa anode (+). Ang rate ng paglipat ay direktang nakasalalay sa laki ng molekula. Ang pinakamalaking macromolecules ay may pinakamahirap na oras sa pag-navigate sa gel. Sa kabilang banda, ang mas maliliit na macromolecule ay dumaan sa gel nang mabilis at medyo madali.
Ano ang Polyacrylamide Gel Electrophoresis?
Ang Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) ay isang pamamaraan na gumagamit ng mga polyacrylamide gel upang paghiwalayin ang mga biomolecule. Ito ay isang pamamaraan na malawakang ginagamit upang paghiwalayin ang mga biological macromolecules, karaniwang mga protina at nucleic acid, ayon sa kanilang electrophoretic mobility. Ang hydration ng acrylonitrile ay nagreresulta sa pagbuo ng mga molekula ng acrylamide sa pamamagitan ng nitrile hydratase. Ang acrylamide ay natutunaw sa tubig, at sa pagdaragdag ng mga free radical initiators, acrylamide polymerizes, na nagreresulta sa pagbuo ng polyacrylamide gel. Karaniwan, ang pagtaas ng konsentrasyon ng acrylamide ay nagreresulta sa pagbaba ng laki ng butas sa gel. Ang mga polyacrylamide gel ay ibinubuhos nang patayo, hindi katulad ng mga agarose gel.
Figure 02: Polyacrylamide Gel Electrophoresis
Sa polyacrylamide gel electrophoresis, ang mga molekula ay maaaring tumakbo sa kanilang katutubong estado, na pinapanatili ang mas mataas na pagkakasunud-sunod na istraktura ng mga molekula. Ang pamamaraang ito ay tinatawag na katutubong PAGE. Bilang kahalili, ang isang kemikal na denaturant ay maaari ding idagdag upang alisin ang mas mataas na pagkakasunud-sunod na istraktura at gawing isang hindi nakabalangkas na molekula na ang kadaliang kumilos ay nakasalalay lamang sa haba nito. Ang ganitong uri ay tinatawag na SDS-PAGE.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Agarose at Polyacrylamide Gel Electrophoresis?
- Agarose at polyacrylamide gel electrophoresis ay dalawang uri ng mga teknik ng gel electrophoresis.
- Sa katunayan, ang mga ito ay mga molecular biological technique.
- Ang parehong mga diskarte ay ginagamit upang makita ang mga biological macromolecule tulad ng DNA at mga protina.
- Ang mga diskarteng ito ay ginagawa ng mga bihasang technician o researcher.
- Sa parehong mga diskarte, ang paghihiwalay ng mga macromolecule ay batay sa singil at laki.
- Ang parehong mga diskarte ay nagbibigay-daan sa paghihiwalay ng mga nucleic acid tulad ng DNA at RNA.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Agarose at Polyacrylamide Gel Electrophoresis?
Ang Agarose gel electrophoresis ay isang technique na gumagamit ng horizontally poured agarose gels para paghiwalayin ang mga biomolecules, habang ang polyacrylamide gel electrophoresis ay isang technique na gumagamit ng vertically poured polyacrylamide gels para paghiwalayin ang mga biomolecules. Ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng agarose at polyacrylamide gel electrophoresis. Higit pa rito, ang agarose gel electrophoresis ay ginagamit para sa paghihiwalay ng DNA at RNA, habang ang polyacrylamide gel electrophoresis ay ginagamit para sa paghihiwalay ng mga nucleic acid gaya ng DNA, RNA, o mga protina.
Ang sumusunod na talahanayan ay nagbubuod sa pagkakaiba sa pagitan ng agarose at polyacrylamide gel electrophoresis.
Buod – Agarose vs Polyacrylamide Gel Electrophoresis
Ang Agarose at polyacrylamide gel electrophoresis ay dalawang uri ng gel electrophoresis techniques na ginagamit sa molecular biology laboratories. Gumagamit ang agarose gel electrophoresis ng agarose gel upang paghiwalayin ang mga biomolecules. Ang agarose ay karaniwang hindi nakakalason sa mga tao, habang ang polyacrylamide ay nakakalason sa mga tao. Bukod dito, ang agarose gel electrophoresis ay nagpapakita ng mababang resolution habang ang polyacrylamide gel electrophoresis ay nagpapakita ng mas maraming resolution. Ang polyacrylamide gel electrophoresis ay gumagamit ng polyacrylamide gel upang paghiwalayin ang mga biomolecules. Binubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng agarose at polyacrylamide gel electrophoresis
