Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng NAAT at PCR ay ang NAAT ay isang nagpapalaki ng genetic material gamit ang ilang paraan, kabilang ang polymerase chain reaction, strand displacement, o transcription-mediated amplification, habang ang PCR ay isang paraan na nagpapalaki ng genetic material gamit lamang thermal cycling.
Ang mga pathogen ay pangunahing nakikilala sa pamamagitan ng pagpapalakas ng kanilang genetic material. Karamihan sa mga diskarte sa lugar na ito ay nakatuon sa pagtuklas ng genetic na materyal ng pathogen sa pamamagitan ng pagpapalakas ng mga partikular na sequence sa real-time. Samakatuwid, ang mga resulta ay ginawa nang napakabilis sa kontekstong diagnostic. Ang NAAT, PCR, biosensor, at LCR ay ilang mga pamamaraan na ginagamit sa mga laboratoryo upang palakasin ang genetic na materyal ng pathogen.
Ano ang NAAT?
Ang Nucleic acid amplification test (NAAT) ay isang paraan sa molecular biology na nagpapalaki ng genetic material gamit ang ilang paraan gaya ng polymerase chain reaction, strand displacement amplification, o transcription-mediated amplification. Ang pagpapalakas ng genetic na materyal ay maaari ding gawin sa pamamagitan ng mga diskarte tulad ng isang ligation chain reaction at branched DNA reaction (quantiplex b DNA) sa NAAT procedure. Ginagamit ng NAAT ang pagiging tiyak ng Watson-Crick base pairing. Sa pamamaraan ng NAAT, ang isang solong-stranded na probe o primer na molekula ay na-hybrid sa target na molekula ng DNA o RNA. Samakatuwid, ang disenyo ng probe strand ay lubos na makabuluhan upang mapahusay ang sensitivity at specificity ng detection. Pagkatapos, ang susunod na hakbang ng NAAT ay nagpapalaki sa genetic na materyal sa pamamagitan ng paggawa ng maraming kopya nito para sa pagtuklas.
Figure 01: NAAT
Ang NAAT ay kasalukuyang inilalapat para sa pagtuklas ng ilang pathogens gaya ng Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis, at SARS-COV2. Bukod dito, ang NAAT test ay binuo upang paikliin ang panahon ng window. Ang panahon ng window ay ang yugto ng panahon sa pagitan ng kung kailan nahawahan ang isang pasyente at kapag nagpakita sila bilang positibo sa pamamagitan ng mga pagsusuri sa antibody. Higit pa rito, ang paraan ng screening ng NAAT ay unang inaprubahan noong 1999 ng FDA. Maraming pakinabang ang NAAT kabilang ang, pagtuklas ng mababang antas ng DNA o RNA, mataas na sensitivity, at mataas na specificity.
Ano ang PCR?
Ang PCR ay isang paraan sa molecular biology na nagpapalaki ng genetic material gamit lamang ang thermal cycling. Ang PCR ay kumakatawan sa polymerase chain reaction. Ito ay isang pagsubok upang makita ang genetic na materyal mula sa isang partikular na organismo tulad ng bacteria, fungi, at mga virus. Sa diagnosis ng sakit, nakita ng PCR ang pagkakaroon ng pathogen kung ang tao ay may pathogen sa oras ng pagsusuri. Sa diagnosis ng sakit, ang PCR protocol ay may ilang hakbang, kabilang ang sample collection, DNA extraction, PCR, at sequencing. Sa pagsubok ng mga pathogen, ang nakolektang sample ay ginagamit upang kunin ang genetic material (DNA o RNA). Ang pamamaraan ng PCR ay nangangailangan ng mga espesyal na kemikal, panimulang aklat, at enzyme upang makagawa ng milyun-milyong kopya ng genetic material sa loob ng PCR machine na tinatawag na thermal cycler. Kapag na-amplified mula sa produkto ng PCR, maaaring matukoy ang pathogen. Gumagamit ang mga siyentipiko ng espesyal na software upang bigyang-kahulugan ang mga resulta.
Figure 02: PCR
Higit pa rito, may iba't ibang uri ng PCR na kasalukuyang ginagamit sa pananaliksik. Ang RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD, at Nested PCR ay ilan sa mga ito. Ang PCR ay kapaki-pakinabang lalo na sa pagtuklas ng pharyngitis (Streptococcl pharyngitis), atypical pneumonia (Chlymydia pneumoniae), tigdas (Morbillivirus), hepatitis (HBV), at ulcerative urogenital infection (Haemophilus ducreyi).
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng NAAT at PCR?
- Ang NAAT at PCR ay dalawang mahalagang molecular biological na pamamaraan na ginagamit upang palakihin ang genetic material.
- Ang mga nucleic acid (DNA o RNA) ay pinalakas ng parehong mga diskarte.
- Ang mga ito ay mabilis at mabilis na diskarte.
- Ang parehong mga diskarte ay kasalukuyang ginagamit para sa diagnosis ng sakit.
- Mas mahal ang mga ito kaysa sa mga karaniwang pamamaraan.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng NAAT at PCR?
Ang NAAT ay isang paraan sa molecular biology na nagpapalaki ng genetic material gamit ang ilang pamamaraan, habang ang PCR ay isang paraan sa molecular biology na nagpapalaki ng genetic material gamit lamang ang thermal cycling. Gumagamit ang NAAT ng iba't ibang pamamaraan ng pagpapalakas ng genetic material tulad ng polymerase chain reaction, strand displacement amplification, transcription-mediated amplification, ligation chain reaction, at branched DNA reaction (quantiplex b DNA). Sa kabilang banda, ang PCR ay gumagamit ng iba't ibang mga genetic material amplification techniques tulad ng RT-PCR. Multiplex PCR, RAPD, Nested PCR. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng NAAT at PCR.
Ang infographic sa ibaba ay nagpapakita ng mga pagkakaiba sa pagitan ng NAAT at PCR sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – NAAT vs PCR
May iba't ibang molecular biological tool na ginagamit sa mga laboratoryo upang palakasin ang mga genetic na materyales. Ang NAAT, PCR, biosensor, at LCR ay ilang mga naturang pamamaraan. Ang NAAT ay isang molecular biological technique na nagpapalaki ng genetic material gamit ang ilang paraan gaya ng polymerase chain reaction, strand displacement, o transcription-mediated amplification. Ang PCR ay isang paraan sa molecular biology na nagpapalaki ng genetic material gamit ang thermal cycling. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng NAAT at PCR.