Mahalagang Pagkakaiba – YAC vs BAC Vectors
Ang mga vector ay ginagamit sa molecular cloning. Ang isang vector ay maaaring tukuyin bilang isang molekula ng DNA na kumikilos bilang isang sasakyan upang dalhin ang dayuhang genetic na materyal sa isa pang cell. Ang isang vector na naglalaman ng dayuhang DNA ay kilala bilang recombinant DNA at ito ay dapat magkaroon ng kakayahan sa pagkopya at pagpapahayag nito sa loob ng host organism. Ang yeast artificial chromosome (YAC) at bacterial artificial chromosome (BAC) ay dalawang uri ng mga vector na kasangkot sa pag-clone. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng YAC at BAC ay ang YAC ay isang artificially constructed vector system gamit ang isang partikular na rehiyon ng yeast chromosome upang magpasok ng malalaking segment ng genetic materials sa yeast cells habang ang BAC ay isang artificial constructed vector system gamit ang isang partikular na rehiyon ng E.coli chromosome para magpasok ng malalaking segment ng DNA sa E. coli cells.
Ano ang mga YAC vectors?
Ang YAC (Yeast artificial chromosome) ay isang artificial built chromosome na may kakayahang magdala ng malaking segment ng dayuhang DNA at mag-replika sa loob ng yeast cell. Mayroon itong centromere, telomeres pati na rin ang mga autonomously replicating sequence na mahalaga para sa pagtitiklop at katatagan. Dapat ding taglayin ng YAC ang isang selective marker o mga marker at restriction site upang gawin itong isang epektibong cloning vector. Ang isang malaking sequence mula 1000 kb hanggang 2000 kb ay maaaring ipasok sa YAC at ilipat sa yeast. Napakababa ng transformation efficiency ng YAC.
Figure 01: YAC Vector
Ano ang BAC Vectors?
Ang Bacterial artificial chromosome (BAC) ay isang artipisyal na binuong chromosome para sa molecular cloning. Mayroon itong mga partikular na rehiyon ng E. coli F plasmid at ito ay pabilog at sobrang nakapulupot. Ang BAC ay binuo upang i-clone ang mga fragment ng DNA sa bakterya, lalo na sa E. coli. Maaari itong magdala ng mga fragment ng DNA na may sukat na hanggang 300 kb. Kung ikukumpara sa YAC, ang mga pagsingit ng cloning ng BAC ay mas maliit sa laki. Ang mga BAC ay binuo noong 1992 at sikat pa rin ito dahil sa katatagan at kadalian ng konstruksyon. Ang mga BAC ay kapaki-pakinabang din sa pagbuo ng mga bakuna.
Figure 02: BAC Vector sa molecular cloning
Ano ang pagkakaiba ng YAC at BAC Vectors?
YAC vs BAC Vectors |
|
| Ang YAC ay isang genetically engineered chromosome na may paggamit ng yeast DNA para sa layunin ng pag-clone. | Ang BAC ay isang genetically engineered na molekula ng DNA gamit ang E. coli DNA para sa layunin ng pag-clone. |
| Kasarian | |
| Ang YACs ay idinisenyo upang i-clone ang malalaking fragment ng genomic DNA sa yeast. | Ang BAC ay binuo para sa pag-clone ng malalaking genomic fragment sa Escherichia coli. |
| Insert Length | |
| Ang YAC ay maaaring maglaman ng megabase-sized na genomic insert.(1000 kb – 2000 kb). | Ang mga BAC ay maaaring magdala ng mga insert na 200–300 kb o mas mababa. |
| Construction | |
| YAC DNA ay mahirap linisin nang buo at nangangailangan ng mataas na konsentrasyon para sa pagbuo ng YAC vector system. | Ang BAC ay madaling linisin nang buo at madaling gawin. |
| Chimerism | |
| Ang mga YAC ay kadalasang chimeric. | Ang BACs ay bihirang chimeric. |
| Katatagan | |
| YAC ay hindi matatag. | BAC ay stable. |
| Mga Pagbabago | |
| Ang recombination ng yeast ay napakabisa at palaging nananatiling aktibo. Kaya't maaari itong bumuo ng mga pagtanggal at iba pang muling pagsasaayos sa isang YAC. | E. coli recombination ay pinipigilan at naka-on kapag kinakailangan. Kaya naman, binabawasan nito ang mga hindi gustong muling pagsasaayos sa mga BAC. |
| Maintenance | |
| Ang pagmamanipula ng mga recombinant na YAC ay karaniwang nangangailangan ng YAC na ilipat sa E. coli para sa kasunod na pagmamanipula. Samakatuwid, ito ay isang matrabahong proseso. | Direktang nangyayari ang BAC modification sa E. coli. Kaya hindi na kailangan ng DNA transfer. Kaya naman, hindi matrabaho ang proseso. |
Buod – YAC vs BAC Vectors
Ang YAC ay naging isang mahalagang tool sa pananaliksik sa mga proseso ng pag-clone dahil sa kakayahan nitong i-clone ang malalaking fragment ng DNA sa host organism. Gayunpaman, ang mga YAC ay may ilang mga disadvantages bilang mga vector tulad ng mga kahirapan sa konstruksyon, chimerism, kawalang-tatag, atbp. Samakatuwid upang malampasan ang mga problemang ito, ang mga siyentipiko ay bumuo ng mga BAC vectors. Ang BAC ay itinayo gamit ang mga partikular na rehiyon ng E. coli chromosome. Ito ay isang matatag na vector at madaling mabuo. Gayunpaman, ang haba ng DNA na kayang hawakan ng BAC ay hanggang 20 beses na mas mababa kaysa sa YAC. Ito ang pagkakaiba sa pagitan ng YAC at BAC vector system. Sa ngayon, mas pinipili ang BAC kaysa sa YAC sa mga lab.
