Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng Cosmid at Phagemid ay nasa uri ng mga sequence na nilalaman nito. Ang isang Cosmid ay naglalaman ng isang cos site at isang plasmid. Samakatuwid, isa itong hybrid vector habang ang Phagemid ay isang plasmid na naglalaman ng F1 na pinagmulan ng pagtitiklop ng F1 phage.
Cosmids at Phagemids ay ginagamit para sa mga layunin ng pag-clone, lalo na upang i-clone ang mas malalaking fragment ng DNA. Ang mga ito ay malawakang ginagamit lalo na sa pag-clone ng mga gene na responsable para sa paggawa ng iba't ibang mga protina. Ang Cosmids at Phagemids ay maaaring ginagaya nang nag-iisa bilang mga plasmid o naka-package sa mga viral particle at pagkatapos ay ginagaya.
Ano ang Cosmid?
A Cosmid, na tinutukoy bilang isang hybrid na plasmid, ay binubuo ng mga site na kinuha mula sa Lambda phage particle at isang plasmid. Ang mga cos site na ito ay mahabang fragment ng DNA na may 200 basepairs. Samakatuwid, mayroon silang magkakaugnay o malagkit na mga dulo na nagpapahintulot sa plasmid na magkasya sa viral DNA. Samakatuwid, ang cos site ay mahalaga para sa packaging ng DNA.
May tatlong cos site;
- cosN site – kasangkot sa pag-nick ng DNA strand sa pamamagitan ng aktibidad ng pagwawakas
- cosB site – nakikibahagi sa pagdaraos ng pagtatapos.
- cosQ site – kasangkot sa pagpigil sa pagkasira ng DNA ng DNases.
Figure 01: Cosmid
Gayundin, maaaring kopyahin ng Cosmids ang single-stranded DNA o double-stranded DNA gamit ang angkop na pinagmulan ng replikasyon. Karaniwang naglalaman ang Cosmid ng mga antibiotic resistance genes bilang mga marker para sa pagpili ng mga transformant. Kaya, ang paggamit ng cosmid bilang vector ay maaaring mapadali ang pag-clone, at ang restriction enzyme digestion ng vector ay maaaring mag-extract ng mga fragment na ito.
Ano ang Phagemid (Phasmid)?
Ang Phagemid, na tinatawag ding Phasmid, ay isang uri din ng hybrid na vector. Ang Phagemid ay naglalaman ng isang espesyal na pinagmulan ng pagtitiklop na tinatawag na f1 pinagmulan ng pagtitiklop. Ang f1 na pinagmulan ng replication extracts mula sa isang f1 phage.
Phagemid ay maaaring kopyahin ang parehong single-stranded at double-stranded DNA. Maaaring maganap ang pagtitiklop bilang isang plasmid habang sumasailalim sa independiyenteng pagtitiklop o maaaring ma-package sa mga particle ng phage at sa wakas ay makahawa sa bacterial host na E coli. Kapag nahawahan ang mga selulang E coli, ang f1 phage ay nangangailangan ng pagkakaroon ng isang pilus. Kaya naman, mahalaga ang sex pili sa panahon ng in vitro packaging ng Phagemids.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Cosmid at Phagemid?
- Ang Cosmid at Phagemid ay mga cloning vector na ginagamit sa recombinant DNA technology.
- Maaaring kopyahin ng Cosmid at Phagemid ang single-stranded at double-stranded na DNA.
- Ang dalawa ay maaaring sumailalim sa independiyenteng pagtitiklop na katulad ng mga plasmid.
- Cosmid at Phagemid ay maaaring sumailalim sa in vitro packaging at makahawa ng bacterial cells.
- Ang Cosmid at Phagemid ay nangangailangan ng angkop na pinagmulan ng pagtitiklop para sa pag-clone.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Cosmid at Phagemid?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Ang Cosmid ay isang hybrid vector na naglalaman ng cos site at isang plasmid. | Ang Phagemid ay isang plasmid na naglalaman ng F1 na pinagmulan ng pagtitiklop ng F1 phage. |
| Presence of Cos Sites | |
| Cos site ay nasa cosmid at kinakailangan para sa in vitro packaging. | Dahil wala ang mga site sa phagemid. |
| Presensya ng F1 Origin of Replication | |
| Sa cosmid, ang pinagmulan ng pagtitiklop ay maaaring ipakita o hindi. | F1 na pinagmulan ng replikasyon ay nasa phagemid. |
| Presence of Antibiotic Resistant Genes | |
| Ang mga gene na lumalaban sa antibiotic ay naroroon sa mga cosmid upang matukoy ang mga transformant mula sa mga hindi – transformant. | Ang mga gene na lumalaban sa antibiotic ay wala sa mga phagemid. |
| Kailangan ng In Vitro Packaging | |
| Nangangailangan ng cos site. | Nangangailangan ng sex pilus. |
Buod – Cosmid vs Phagemid
Ang Cosmid at Phagemid ay mga cloning vector na ginagamit sa recombinant DNA technology. Ang mga Cosmid ay mga hybrid na vector na naglalaman ng mga espesyal na malagkit na dulo na kilala bilang mga site ng cos. Ang in-vitro packaging ay nangangailangan ng mga cos site na ito. Habang ang mga phagemid ay mga plasmid na naglalaman ng f1 na pinagmulan ng replikasyon na nakuha mula sa f1 phage. Ang parehong cosmid at phagemid ay maaaring sumailalim sa independiyenteng pagtitiklop o in vitro packaging sa mga bacterial cell. Ito ang mahahalagang pagkakaiba sa pagitan ng cosmid at phagemid.
