Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng plasmid at cosmid ay ang plasmid ay isang double-stranded, circular at closed extra-chromosomal DNA na nasa bacteria at archaea habang ang cosmid ay isang hybrid vector system na nabuo dahil sa pagsasama ng cos sequence ng lambda phage at plasmid DNA ng bacteria.
Ang Genetic engineering ay isang advanced na pag-aaral sa ilalim ng Biotechnology. Maaaring baguhin o baguhin ng genetic engineering technique ang genome ng mga buhay na organismo. Higit pa rito, nakakatulong ang genetic engineering sa gene therapy at paggamot sa mga genetic disorder. Bago ipasok ang mga gene sa genome ng isa pang organismo, kinakailangan na gumawa ng isang recombinant na molekula ng DNA na maaaring magdala ng nais na fragment ng DNA at maghatid sa host organism. Samakatuwid, sa panahon ng teknolohiyang recombinant DNA, ginagawa ito ng isang vector system. Samakatuwid, ang isang vector ay gumagana bilang isang sasakyan o isang tagapamagitan sa pagitan ng donor at host organism. Ang plasmid at cosmid ay dalawang uri ng mga vector na karaniwang ginagamit sa recombinant na teknolohiya ng DNA at genetic engineering. Ang ilan ay mga natural na vector habang ang ilan ay mga artipisyal na vector. Ang plasmid ay isang natural na vector habang ang cosmid ay isang artipisyal na binuong vector. Ang parehong uri ay may mga kalamangan at kahinaan.
Ano ang Plasmid?
Ang plasmid ay isang maliit, pabilog, double-stranded na DNA na naroroon sa mga prokaryotic na organismo pangunahin sa bacteria at archaea. Umiiral sila bilang mga saradong bilog sa loob ng bakterya. Gayundin, ang mga plasmid ay hindi genomic DNA. Samakatuwid, ang pagkakaroon o kawalan ng mga plasmid sa mga prokaryotic na selula ay hindi nakakaapekto sa kaligtasan ng mga selulang iyon. Ang mga plasmid ay extrachromosomal DNA. Gayunpaman, ang mga plasmid ay nagbibigay ng karagdagang mga pakinabang sa bakterya at archaea. Naglalaman ang mga ito ng mga espesyal na gene tulad ng antibiotic resistance, paglaban sa iba't ibang mabibigat na metal, pagkasira ng macromolecule atbp.
Higit pa rito, ang mga plasmid ay may kakayahang mag-replika ng sarili nang hindi nag-uugnay sa mga chromosome. Nagdadala ito ng mga gene o impormasyong kailangan para sa sarili nitong pagtitiklop at pagpapanatili. Bukod dito, sila ay independiyenteng DNA. Dahil sa mga espesyal na tampok na ito, ang mga plasmid ay may napakalaking paggamit sa Molecular Biology bilang mga vector.
Figure 01: Plasmid
Ang double-stranded na katangian ng DNA, antibiotic resistance genes, self-replicating ability at special restriction sites ay ang mahahalagang katangian na ginagawang mas angkop ang mga plasmid bilang vector molecule sa recombinant DNA technology. At gayundin ang mga plasmid ay madaling ihiwalay at nagiging host bacteria.
Ano ang Cosmid?
Ang Cosmid ay isang hybrid na vector system. Ito ay isang artipisyal na vector na binuo sa pamamagitan ng pagsasama-sama ng mga cos sequence ng Lambda phage particle at isang plasmid. Ang mga cos site o sequence na ito ay mahabang DNA fragment na binubuo ng 200 base pairs. Mayroon silang magkakaugnay o malagkit na dulo na nagpapahintulot sa plasmid na magkasya sa viral DNA. Samakatuwid, ang mga site ng cos ay mahalaga para sa packaging ng DNA. May tatlong cos site na cosN site, cosB site at cosQ site. Kasama sa mga site na ito ang pag-nick sa DNA strand sa pamamagitan ng aktibidad ng terminase, sa paghawak sa terminase at sa pagpigil sa pagkasira ng DNA ng mga DNases ayon sa pagkakabanggit.
Figure 02: Cosmid
Ang Cosmids ay maaaring kopyahin ang single-stranded DNA o double-stranded DNA gamit ang angkop na pinagmulan ng replikasyon. Naglalaman din ang mga ito ng mga antibiotic resistance genes na maaaring maging kapaki-pakinabang bilang mga marker sa pagpili ng mga nabagong selula. Kaya, katulad ng mga plasmid, ang mga cosmid ay mahusay ding mga vector sa teknolohiyang recombinant na DNA.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Plasmid at Cosmid?
- Ang plasmid at cosmid ay mga vector na karaniwang ginagamit sa recombinant DNA technology.
- Parehong nagagawang mag-self-replicate.
- Mayroon silang pinagmulan ng pagtitiklop.
- Higit pa rito, mayroon silang maraming cloning site.
- Gayundin, naglalaman ang mga ito ng mga gene na lumalaban sa antibiotic na kapaki-pakinabang bilang mga marker.
- Maaaring ipasok ang dayuhang DNA sa parehong uri at gumawa ng mga recombinant na molekula.
- Ang mga madaling paraan ng pag-screen ay available para sa parehong mga vector.
- Kapaki-pakinabang ang dalawa sa pagbuo ng mga genomic na library.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Plasmid at Cosmid?
Ang Plasmid at cosmid ay dalawang uri ng cloning vectors na ginagamit sa genetic engineering. Ang mga plasmid ay maliit, pabilog na double-stranded na mga molekula ng extrachromosomal na DNA na nasa bacteria at archaea. Sa kabilang banda, ang cosmid ay isang hybrid vector na itinayo mula sa cos sequence ng lambda phage DNA at plasmid DNA. Ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng plasmid at cosmid. Higit pa rito, ang mga plasmid ay maaaring magdala ng hanggang 25 kb ng mga fragment ng DNA habang ang mga comsid ay may kakayahang maglaman ng hanggang 45 kb na mga fragment. Kaya, ito ay isa pang pagkakaiba sa pagitan ng plasmid at cosmid.
Higit pang mga detalye ang ibinibigay sa infographic ng pagkakaiba ng plasmid at cosmid.
Buod – Plasmid vs Cosmid
Ang plasmid ay isang natural na nagaganap na extrachromosomal DNA habang ang cosmid ay isang hybrid na vector ng phage DNA at plasmid DNA. Parehong mga cloning vector na ginagamit sa recombinant na teknolohiya ng DNA. Ang mga Cosmid ay naglalaman ng mga espesyal na malagkit na dulo na kilala bilang mga cos site na kinakailangan para sa in vitro packaging. Sa kabilang banda, ang mga plasmid ay naglalaman ng ilang mga tampok na ginagawa silang perpektong mga vector sa genetic engineering. Parehong maaaring sumailalim sa independiyenteng pagtitiklop o in vitro packaging sa mga bacterial cell. Ang mga plasmid ay may kakayahang maglaman ng dayuhang DNA fragment na 25 kb ang haba habang ang cosmids ay may kakayahang maglaman ng dayuhang DNA fragment na 45 kb. Samakatuwid, ang mga cosmid ay kapaki-pakinabang sa mga layunin ng pag-clone upang mai-clone ang mas malalaking fragment ng DNA dahil ang mga plasmid vector ay hindi maaaring mag-clone ng mas malalaking fragment. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng plasmid at cosmid.
