Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng DNA at protein microarray ay ang DNA microarray ay isang koleksyon ng mga mikroskopikong DNA spot na nakakabit sa isang solidong surface tulad ng glass slide, habang ang protein microarray ay isang arrangement ng purified proteins sa solid surface tulad ng salamin slide.
Ang Microarray ay isang lab on a chip (LOC) device. Ito ay isang miniature, multiplex, parallel processing at detection device. Isa rin itong two-dimensional array sa isang solidong ibabaw tulad ng glass slide o silicon thin-film cell. Sinusuri ng microarray ang isang malaking halaga ng biological na materyal gamit ang high-throughput screening. Ang unang microarray ay ang antibody chip na ipinakilala ni Tse Wen Chang noong 1983. Ang unang gene chip ay ipinakilala noong 1995 nina Ron Davis at Pat Brown sa Stanford University. Samakatuwid, ang DNA at protein microarray ay dalawang uri ng microarray device.
Ano ang DNA Microarray?
Ang DNA microarray ay isang koleksyon ng mga mikroskopiko na DNA spot na nakakabit sa isang solidong ibabaw tulad ng isang glass slide. Ginagamit ng mga siyentipiko ang DNA microarray upang sukatin ang pagpapahayag ng isang malaking bilang ng mga gene nang sabay-sabay. Ginagamit din ito sa genotype ng maraming rehiyon ng isang genome. Ang DNA microarray ay inihanda gamit ang mga robotic machine. Inaayos ng mga makinang ito ang daan-daan o libu-libong gene sequence (probes) sa isang mikroskopikong slide.
Figure 01: DNA Microarray
Sa isang DNA microarray, ang bawat DNA spot ay naglalaman ng mga picomoles (10−12 moles) ng isang partikular na DNA sequence. Ang mga DNA sequence na ito ay kilala rin bilang probes o reporter. Ang mga probe na ito ay isang maikling segment ng DNA ng isang gene o iba pang elemento ng DNA. Maaari silang mag-hybrid sa cDNA o CRNA sa isang sample sa ilalim ng mataas na stringency na mga kondisyon. Ang mga fluorescently label na sample sequence na nagbubuklod sa mga probe ay bumubuo ng mga signal na nakadepende sa mga kondisyon ng hybridization gaya ng temperatura. Samakatuwid, ang pamamaraang ito ay maaaring gamitin upang matukoy ang kamag-anak na kasaganaan ng mga pagkakasunud-sunod ng nucleic acid sa sample. Bukod dito, malawakang ginagamit ang DNA microarray technique sa mga pag-aaral ng expression ng gene, comparative genomic na pag-aaral, pagsuri sa kontaminasyon ng pagkain o mga cell culture ng mga pathogen, pagsusuri ng mga mutation ng gene, pagtukoy ng mga kandidato sa droga, genetic linkage analysis, atbp.
Ano ang Protein Microarray?
Ang Protein microarray ay isang pag-aayos ng mga na-purified na protina sa isang solidong ibabaw tulad ng glass slide. Ito ay isang paraan na ginagamit upang makita ang mga pakikipag-ugnayan at aktibidad ng mga protina. Ginagamit din ito upang matukoy ang mga function ng mga protina sa isang malaking sukat. Ang pangunahing bentahe ng microarray ng protina ay ang isang malaking bilang ng mga protina ay maaaring masubaybayan nang magkatulad. Ang microarray ng protina ay isang chip na binubuo ng isang support surface tulad ng glass slide, nitrocellulose membrane, bead o microtitre plate. Ang mga nakuhang protina (antibodies, antigens) ay nakatali sa solidong ibabaw na ito. Ang mga molekula ng probe na karaniwang may label na fluorescent dye ay idinaragdag mamaya sa array. Ang hybridization sa pagitan ng probe at immobilized na mga protina ay naglalabas ng fluorescent signal na maaaring makita ng isang laser scanner.
Figure 02: Protein Microarray
Ang unang hanay ng protina ay isang antibody microarray (antibody matrix) na ipinakilala noong 1983. Ang mga microarray ng protina ay mabilis, awtomatiko, napakasensitibo, at matipid. Kumokonsumo din sila ng kaunting sample at reagents. Higit pa rito, malawakang inilalapat ang mga microarray ng protina sa diagnosis ng sakit, pagsusuri sa functional na protina, pagtukoy sa antibody, at pag-unlad ng paggamot.
Ano ang Pagkakatulad sa Pagitan ng DNA at Protein Microarray?
- Ang DNA at protein microarray ay dalawang uri ng microarray device.
- Ang parehong device ay nakabatay sa prinsipyo ng hybridization.
- Ang parehong device ay gumagamit ng mga probe.
- Gumagamit din sila ng mga fluorescence signal para sa pag-detect ng hybridization.
- Sila ay parehong napakalaking tulong sa pagsusuri ng sakit sa medisina.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng DNA at Protein Microarray?
Ang DNA microarray ay isang koleksyon ng mga mikroskopiko na DNA spot na nakakabit sa isang solidong ibabaw tulad ng isang glass slide. Sa kabaligtaran, ang microarray ng protina ay isang pag-aayos ng mga purified na protina sa isang solidong ibabaw tulad ng isang glass slide. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng DNA at protina microarray. Higit pa rito, sa isang microarray ng DNA, ang sample at probe ay mga sequence ng DNA. Sa kabilang banda, sa microarray ng protina, ang sample at probe ay mga protina.
Ang sumusunod na infographic ay nagpapakita ng mga pagkakaiba sa pagitan ng DNA at protina microarray sa tabular form.
Buod – DNA vs Protein Microarray
Ang microarray ay isang high-throughput at multiplex lab-on-a-chip. Ito ay ginawa batay sa prinsipyo ng hybridization. Ang DNA at protein microarray ay dalawang uri ng microarray device. Ang DNA microarray ay isang koleksyon ng mga mikroskopikong DNA spot na nakakabit sa isang solidong ibabaw tulad ng isang glass slide. Sa kabilang banda, ang microarray ng protina ay isang pag-aayos ng mga purified na protina sa isang solidong ibabaw tulad ng isang glass slide. Kaya, ito ang buod ng pagkakaiba sa pagitan ng DNA at protina microarray.
