Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng sigma factor at rho factor ay ang sigma factor ay isang protina na kailangan para sa pagsisimula ng transkripsyon sa bacteria habang ang rho factor ay isang protina na kailangan para sa pagwawakas ng transcription sa bacteria.
Ang Sigma factor at rho factor ay dalawang mahalagang salik para sa bacterial transcription. Ang bacterial transcription ay isang proseso kung saan ang isang piraso ng bacterial DNA ay kinopya sa isang bagong gawang strand ng mRNA (messenger RNA). Ang prosesong ito ay na-catalyze ng isang enzyme na kilala bilang RNA polymerase. Ang mga bakterya ay lubos na umaasa sa transkripsyon at pagsasalin upang tumugon nang maayos sa kanilang kapaligiran. Ang bacterial RNA polymerase ay binubuo ng isang core at isang holoenzyme na istraktura. Ang core ay naglalaman ng mga subunit na β, β′, α at 2ω habang ang holoenzyme ay naglalaman ng sigma factor. Bukod dito, napakahalaga rin ng isang ancillary factor sa RNA polymerase na kilala bilang rho factor para sa bacterial transcription.
Ano ang Sigma Factor?
Ang Sigma factor o specificity factor ay isang protina na kailangan para sa pagsisimula ng transkripsyon sa bacteria. Ito ay isang bacterial transcription initiation factor. Ang kadahilanan na ito ay nagbibigay-daan sa pagbubuklod ng RNA polymerase enzyme sa isang partikular na rehiyon ng DNA na tinatawag na rehiyon ng promoter sa panahon ng transkripsyon. Ang Sigma factor ay karaniwang homologous sa archaeal transcription factor B at sa eukaryotic transcription factor na TF11B. Bukod dito, ang tiyak na kadahilanan ng sigma ng isang naibigay na gene ay nag-iiba depende sa gene at mga signal sa kapaligiran. Ang mga promoter ay pinipili ng RNA polymerase depende sa sigma factor na nauugnay dito.
Figure 01: Sigma Factor
Ang sigma factor ay matatagpuan din sa chloroplast ng mga halaman bilang bahagi ng plastid-encoded polymerase (PEP). Ang sigma factor at RNA polymerase sa kabuuan ay kilala bilang RNA polymerase holoenzyme. Ang molekular na bigat ng sigma factor ay nasa paligid ng 70 kDa. Matapos ang pagsisimula ng transkripsyon, ang sigma factor ay naghihiwalay mula sa complex. Pagkatapos ay magpapatuloy ang pagpapahaba ng RNA polymerase hanggang sa matapos ang transkripsyon.
Ano ang Rho Factor?
Ang Rho factor ay isang prokaryotic na protina na kasangkot sa pagwawakas ng transkripsyon. Ang Rho factor ay karaniwang nagbubuklod sa transcription terminator pause site. Ang site na ito ay isang nakalantad na rehiyon ng single-stranded RNA malapit sa open reading frame sa cytosine rich guanine poor sequence. Ito ay isang mahalagang transcription protein sa prokaryotes. Sa Escherichia coli, ang rho factor ay humigit-kumulang 274.6 kDa hexamer ng magkaparehong mga subunit. Ang bawat subunit ay may RNA binding domain at ATP hydrolysis domain. Bukod dito, ang function ng rho factor ay helicase activity.
Figure 02: Rho Factor
Ang Rho factor ay nagbubuklod sa RNA molecule at pagkatapos ay ginagamit ang ATPase activity nito upang magbigay ng enerhiya upang i-translocate ang mga RNA molecule. Ang Rho factor ay nagsasagawa ng translokasyon hanggang sa maabot nito ang RNA-DNA helical region, kung saan na-unwind nito ang hybrid (RNA-DNA) duplex na istraktura. Pino-pause ng prosesong ito ang RNA polymerase sa lugar ng pagwawakas na nagtatapos sa proseso ng transkripsyon.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Sigma Factor at Rho Factor?
- Ang Sigma factor at rho factor ay dalawang mahalagang salik para sa bacterial transcription.
- Ang dalawa ay nasa prokaryote lamang.
- Ang mga ito ay mga protina na binubuo ng mga amino acid.
- Parehong mga nucleic acid na nagbubuklod ng mga protina.
- Ang mga prokaryote ay lubos na umaasa sa mga salik na ito upang makabuo ng mRNA na maaaring gumawa ng mga kakaibang protina at tulungan silang tumugon sa kanilang kapaligiran partikular.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Sigma Factor at Rho Factor?
Ang Sigma factor ay isang protina na kailangan para sa pagsisimula ng transkripsyon sa bacteria, habang ang rho factor ay isang protina na kailangan para sa pagwawakas ng transkripsyon sa bacteria. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng sigma factor at rho factor. Higit pa rito, ang sigma factor ay isang DNA binding protein, habang ang rho factor ay isang RNA binding protein.
Ang infographic sa ibaba ay nagpapakita ng mga pagkakaiba sa pagitan ng sigma factor at rho factor sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – Sigma Factor vs Rho Factor
Ang Transcription ay ang proseso kung saan ang impormasyon sa DNA ay kinopya sa isang bagong molekula na tinatawag na mRNA (messenger RNA). Ang m-RNA na ito sa huli ay kasangkot sa paggawa ng isang tiyak na protina. Ang Sigma factor at rho factor ay dalawang mahalagang salik para sa bacterial transcription. Ang mga ito ay mga protina. Ang kadahilanan ng Sigma ay nakikilahok sa pagsisimula ng transkripsyon sa bakterya. Ang Rho factor ay responsable para sa pagwawakas ng transkripsyon sa bakterya. Kaya, ito ang buod ng pagkakaiba sa pagitan ng sigma factor at rho factor.
