Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng Rho dependent at Rho independent termination ay na sa Rho dependent termination, ang Rho factor ay nagbubuklod sa transcript at tinatapos ang transkripsyon sa pamamagitan ng pagsira ng hydrogen bond sa pagitan ng template at ng transcript, habang ang Rho independent termination ay nagwawakas sa transkripsyon sa pamamagitan ng paggawa ng hairpin loop structure at pagkatapos ay U rich region sa transcript.
Ang Transcription ay isa sa dalawang yugto ng pagpapahayag ng gene. Ito ay ang proseso na gumagawa ng isang mRNA sequence mula sa genetic na impormasyon na nakatago sa DNA sequence ng gene. Nagaganap ang transkripsyon sa pamamagitan ng tatlong hakbang: pagsisimula, pagpahaba at pagwawakas. Ang RNA polymerase enzyme ay nagbubuklod sa promoter sequence ng gene at nagsisimulang mag-catalyze ng synthesis ng RNA strand. Hanggang sa matagpuan ang pagkakasunud-sunod ng terminator, ang RNA polymerase ay nagdaragdag ng mga nucleotide at bubuo ng RNA strand. Sa mga prokaryote, ang pagwawakas ay nangyayari sa pamamagitan ng dalawang pangunahing diskarte sa pagwawakas: Rho dependent termination at Rho independent termination. Ang Rho factor ay isang protina na may helicase activity.
Ano ang Rho Dependent Termination?
Ang Rho dependent termination ay isa sa dalawang uri ng transcription termination strategy na nagaganap sa mga prokaryote. Ang Rho factor ay isang protina na may helicase activity.
Figure 01: Rho Dependent Termination
Ang Rho protein ay nagbubuklod sa RNA transcript at gumagalaw sa kahabaan ng RNA polymerase sa 5'-3' na direksyon, na naghihikayat sa paghihiwalay ng mga hydrogen bond sa pagitan ng DNA template at RNA transcript. Kapag naabot ng Rho factor ang transcription bubble, hinihila nito ang DNA/RNA hybrid at ilalabas ang transcript mula sa transcription bubble. Kapag nangyari ito, wawakasan nito ang transkripsyon.
Ano ang Rho Independent Termination?
Ang Rho independent termination ay ang pangalawang diskarte na nagwawakas sa prokaryotic transcription. Karaniwan, ang rehiyon ng terminator ay may baligtad na pagkakasunod-sunod ng pag-uulit. Kaagad pagkatapos ng inverted repeat sequence, mayroong Adenine rich region (AAAA). Kapag ang RNA polymerase ay umuusad, ito ay gumagawa ng isang mRNA sequence. Dahil ang dalawang rehiyon ay komplementaryo sa inverted repeat sequence region, ito ay bumubuo ng hairpin loop structure dahil sa hydrogen bonding. Ang susunod na rehiyon ay ang U rich region. Ang istraktura ng hairpin ay humihinto sa aktibidad ng RNA polymerase.
Figure 02: Rho Independent Termination
Higit pa rito, sa mga mayayamang rehiyon ng U, may mahinang pakikipag-ugnayan sa pagitan ng U base ng transcript at A base ng template. Ang mga mahihinang Adenine-Uracil bond na ito ay nagpapahina sa template ng DNA at ang transcript ng RNA at naghihiwalay sa isa't isa. Sa huli, lalabas ang transcript mula sa site ng transkripsyon.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Rho Dependent at Rho Independent Termination?
- Rho dependent at Rho independent termination ay dalawang pangunahing diskarte sa pagwawakas na matatagpuan sa mga prokaryote.
- Ang parehong form ay naglalabas ng transcript mula sa DNA template upang wakasan ang transkripsyon.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Rho Dependent at Rho Independent Termination?
Ang Rho dependent termination ay pinapamagitan ng isang Rho protein habang ang Rho independent termination ay nangyayari sa pamamagitan ng pagbuo ng hairpin loop structure. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng Rho dependent at Rho independent termination. Higit pa rito, ang Rho protein ay gumagamit ng ATP energy habang ang Rho independent termination ay hindi nagsasangkot ng Rho protein at hindi gumagamit ng ATP energy. Samakatuwid, isa rin itong makabuluhang pagkakaiba sa pagitan ng Rho dependent at Rho independent termination.
Ang infographic sa ibaba ay nagpapakita ng higit pang mga paghahambing na nauugnay sa pagkakaiba sa pagitan ng Rho dependent at Rho independent termination.
Buod – Rho Dependent vs Rho Independent Termination
Ang Rho dependent at Rho independent termination ay ang dalawang pangunahing transcription termination mechanism na nagaganap sa mga prokaryote. Ang isang Rho protein ay responsable para sa pagwawakas ng transkripsyon sa pagwawakas na umaasa sa Rho. Sa kaibahan, ang Rho independent termination ay nangyayari sa pamamagitan ng pagbuo ng hairpin loop structure. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng Rho dependent at Rho independent termination.
