Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng replicative transposition at cut and paste transposition ay na sa replicative transposition, ang transposon ay kinokopya sa isang bagong lokasyon, habang sa cut at paste transposition, ang transposon ay inilipat sa isang bagong lokasyon.
Ang Transposable elements o jumping genes ay mga DNA sequence na maaaring magbago ng kanilang posisyon sa loob ng genome. Ito ay tinutukoy bilang transposisyon. Kung minsan ang transposisyon ay maaaring lumikha o mag-reverse ng mga mutasyon, at baguhin ang genetic na pagkakakilanlan at laki ng genome ng cell. Ang transposisyon ay natuklasan ni Barbara McClintock noong 1983. Maaaring maganap ang transposisyon sa pamamagitan ng dalawang pamamaraan bilang duplication at cut and paste.
Ano ang Replicative Transposition?
Ang Replicative transposition ay isang uri ng transposition mechanism na tumutulong sa transposon excision mula sa native na lokasyon patungo sa isa pa sa pamamagitan ng replicated o duplicated technique. Ang mekanismong ito ay unang natagpuan ni James A Shapiro noong 1979. Sa mekanismong ito, ang transposable na elemento ay nadodoble sa panahon ng transposition reaction upang ang transposing entity ay isang kopya ng orihinal na elemento. Bukod dito, sa mekanismong ito, ang donor at receptor na mga sequence ng DNA ay bumubuo ng isang katangian na intermediate na pagsasaayos ng "theta" na tinatawag na Shapiro intermediate (cointegrate). Ang replicative transposition ay isang katangiang retrotransposon. Ang mekanismong ito ay karaniwang nangyayari sa class I transposon.
Figure 01: Replicative Transposition
Ang isang magandang halimbawa ng replicative transposition ay makikita sa E. coli TN3 transposon. Ang TN3 transposon ay maaaring lumipat mula sa orihinal na plasmid patungo sa isa pang target na plasmid sa pamamagitan ng kinopya o dobleng pamamaraan. Ang buong kaganapang ito ay pinamagitan ng dalawang mahalagang enzyme na tinatawag na transposase at resolvase. Bukod dito, ang replicative transposition ay maaaring maobserbahan sa parehong DNA transposon at retroposon. Ang pinakamahusay na pinag-aralan na transposable bacterial virus ay ang bacteriophage Mu.
Ano ang Cut and Paste Transposition?
Ang Cut and paste transposition ay isang uri ng transposition mechanism na tumutulong sa transposon excision mula sa native na lokasyon patungo sa isa pa sa pamamagitan ng cut and paste technique. Ang mekanismong ito ay kilala rin bilang konserbatibong modelo ng transposisyon. Sa non-replicative transposition na ito, ang pagtanggal at pagsasama ng isang transposon mula sa isang genomic na lokasyon patungo sa isa pa ay nagaganap nang hindi nag-iiwan ng kopya.
Figure 02: Gupitin at Idikit ang Transposisyon
Sa mekanismong ito, ang transposase enzyme ay unang nagbubuklod sa terminal na umuulit na karaniwang nasa magkabilang dulo ng mga transposon at pagkatapos ay bumubuo ito ng isang istraktura na tinatawag na synaptic complex (transpososome). Tinatanggal ng synaptic complex ang transposon mula sa orihinal nitong genomic na lokasyon at isinasama ito sa bagong target na lokasyon. Pagkatapos nito, ang mga transposases ay umalis mula sa magkabilang dulo ng transposon. Sa sandaling umalis ang transposase enzyme sa transposon, ang mga puwang ay pupunan ng host polymerase enzyme. Pinapayagan nito ang kumpletong pagsali ng transposon sa bagong lokasyon ng genomic. Ang mekanismong ito ay karaniwang nangyayari sa class II transposon. Higit pa rito, ang TN5 bacterial transposon ay isang kilalang halimbawa na nagpapakita ng konserbatibo o cut and paste na mekanismo ng transposisyon.
Ano ang Mga Pagkakatulad sa pagitan ng Replicative Transposition at Cut and Paste Transposition?
- Ang replicative transposition at cut and paste transposition ay dalawang uri ng transposition mechanism.
- Sa parehong mekanismo, ang mga naililipat na elemento ay lumilipat mula sa isang genomic na lokasyon patungo sa isa pang bagong genomic na lokasyon.
- Ang parehong mekanismo ay maaaring lumikha o baligtarin ang mga mutasyon at baguhin ang genetic na pagkakakilanlan ng cell.
- Ipinapakita ng mga bacterial transposon ang parehong mekanismo.
- Sila ay napakahalagang mga kaganapan para sa ebolusyon.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Replicative Transposition at Cut and Paste Transposition?
Replicative transposition ay isang uri ng transposition mechanism kung saan ang transposon ay kinokopya sa isang bagong lokasyon, habang ang cut and paste transposition ay isang uri ng transposition mechanism kung saan ang transposon ay inililipat sa isang bagong lokasyon. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng replicative transposition at cut and paste transposition. Higit pa rito, karaniwang nangyayari ang replicative transposition sa class I transposon, habang ang cut and paste transposition ay karaniwang nangyayari sa class II transposon.
Ipinapakita ng infographic sa ibaba ang mga pagkakaiba sa pagitan ng replicative transposition at cut and paste transposition sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – Replicative Transposition vs Cut and Paste Transposition
Replicative transposition at cut and paste transposition ay dalawang uri ng transposition mechanism. Ang replicative transposition ay isang uri ng transposition mechanism kung saan ang transposon ay kinokopya sa isang bagong lokasyon, habang ang cut and paste transposition ay isang uri ng transposition mechanism kung saan ang transposon ay inililipat sa isang bagong lokasyon. Kaya, ito ay nagbubuod sa pagkakaiba sa pagitan ng replicative transposition at cut and paste transposition.
