Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng mga DNA transposon at retrotransposon ay ang DNA transposon ay mga mobile genetic na elemento na lumilipat mula sa isang lugar patungo sa isa pa sa genome sa pamamagitan ng paggamit ng cut and paste na mekanismo, habang ang mga retrotransposon ay mga mobile genetic na elemento na lumilipat mula sa isang lugar sa isa pa sa genome sa pamamagitan ng paggamit ng copy at paste na mekanismo.
Ang Mobile genetic elements (MGEs) ay mga segment ng DNA na nag-encode ng mga partikular na enzyme at protina na namamagitan sa paggalaw ng mga ito sa loob ng genome, o maaaring ilipat mula sa isang species patungo sa isa pa. Ang mga ito ay kilala rin bilang makasariling mga genetic na elemento. Ang mga transposable na elemento ay kumakatawan sa isa sa ilang uri ng mga mobile genetic na elemento. Mayroong dalawang pangunahing uri ng mga transposable na elemento: DNA transposon at retrotransposon. Samakatuwid, ang mga transposon at retrotransposon ng DNA ay mga mobile genetic na elemento na maaaring lumipat sa bawat lugar sa genome.
Ano ang DNA Transposon?
Ang DNA transposon ay mga mobile genetic na elemento na lumilipat mula sa isang lugar patungo sa isa pa sa genome sa pamamagitan ng paggamit ng cut and paste na mekanismo. Nabibilang sila sa class II transposable elements na gumagalaw sa isang DNA intermediate. Salungat ito sa class I transposable elements (retrotransposons) na gumagalaw sa isang RNA intermediate. Karaniwan, ang mga transposon ng DNA ay gumagalaw sa genome sa pamamagitan ng paggamit ng cut and paste na paraan. Ang pamamaraang ito ay nangangailangan ng transposase enzyme na nagpapagana sa paggalaw ng DNA mula sa kasalukuyang lokasyon nito sa genome at pagpasok sa bagong lokasyon.
Figure 01: Mga Transposon ng DNA
Ang transposisyong ito ay nangangailangan ng tatlong DNA site sa transposon (dalawa sa bawat dulo ng transposon na tinatawag na terminal inverted repeats at isa sa target na site). Ang transposase enzyme ay magbubuklod sa terminal inverted repeats ng transposon at mamagitan sa synapsis ng mga dulo ng transposon. Pagkatapos ay dinidiskonekta ng transposase enzyme ang elemento mula sa gilid ng DNA ng orihinal na donor site at namamagitan sa pagsali ng transposon sa bagong insertion site sa genome. Ang pagdaragdag ng transposon sa bagong lokasyon ay nagdudulot ng maiikling gaps sa magkabilang panig ng ipinasok na segment. Inaayos ng mga host system ang mga puwang na ito, na nagreresulta sa target sequence duplication (TSD), na katangian ng transposisyon.
Ano ang Retrotransposon?
Ang Retrotransposon ay mga mobile genetic na elemento na lumilipat mula sa isang lugar patungo sa isa pa sa genome sa pamamagitan ng paggamit ng mekanismo ng pagkopya at pag-paste. Nabibilang sila sa class I transposable elements. Ang Class I transposable elements (retrotransposons) ay gumagalaw sa isang RNA intermediate sa genome. Ang mga ito ay isang uri ng genetic component na kinokopya at i-paste ang kanilang mga sarili sa iba't ibang genomic na lokasyon.
Figure 02: Retrotransposon
Una, na-transcribe ang mga ito mula sa DNA patungo sa RNA. Pagkatapos ang RNA na ginawa ay reverse transcribe sa DNA. Ang kinopyang DNA na ito ay ipinasok muli sa genome sa isang bagong lokasyon. Ang reverse transcription ay na-catalyze ng reverse transcriptase. Ang reverse transcriptase ay madalas na naka-encode ng retrotransposon mismo. Ang pagsasama ay isinasagawa ng isang enzyme na tinatawag na integrase. Higit pa rito, karaniwang tatlong uri: long terminal repeats (LTR), long interspersed nuclear elements (LINE), at short interspersed nuclear elements (SINE).
Ano ang Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng DNA Transposon at Retrotransposon?
- Ang DNA transposon at retrotransposon ay mga mobile genetic na elemento.
- Parehong inuri sa ilalim ng mga transposable na elemento.
- Kilala ang dalawa bilang jumping genes.
- Maaari silang lumipat sa bawat lugar sa genome.
- Napakahalaga ng ebolusyonaryo.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng DNA Transposon at Retrotransposon?
Ang DNA transposon ay mga mobile genetic na elemento na lumilipat mula sa isang lugar patungo sa isa pa sa genome sa pamamagitan ng paggamit ng cut and paste na mekanismo, habang ang retrotransposon ay mga mobile genetic na elemento na lumilipat mula sa isang lugar patungo sa isa pa sa genome sa pamamagitan ng paggamit ng kopya at mekanismo ng pag-paste. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng mga transposon ng DNA at retrotransposon. Higit pa rito, ang mga transposon ng DNA ay nabibilang sa class II na mga transposable na elemento, habang ang mga retrotransposon ay kabilang sa class I na mga transposable na elemento.
Ang infographic sa ibaba ay nagpapakita ng mga pagkakaiba sa pagitan ng DNA transposon at retrotransposon sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – DNA Transposon vs Retrotransposon
Ang DNA transposon at retrotransposon ay mga mobile genetic na elemento. Ang mga transposon ng DNA ay lumilipat mula sa isang lugar patungo sa isa pa sa genome sa pamamagitan ng paggamit ng mekanismo ng cut paste. Ang mga retrotransposon ay lumilipat mula sa isang lugar patungo sa isa pa sa genome sa pamamagitan ng paggamit ng mekanismo ng pagkopya at pag-paste. Kaya, ito ay nagbubuod sa pagkakaiba sa pagitan ng DNA transposon at retrotransposon.
