Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng T4 DNA ligase at E. coli DNA ligase ay ang T4 DNA ligase ay isang enzyme na nakahiwalay sa bacteriophage T4 habang ang E. coli DNA ligase ay isang enzyme na nakahiwalay sa bacterium E. coli.
Ang DNA ligase ay isang partikular na uri ng enzyme na nagpapadali sa pagsasama-sama ng mga DNA strands sa pamamagitan ng pagbuo ng isang phosphodiester bond. Ito ay gumaganap ng isang mahalagang papel sa pamamagitan ng pag-aayos ng mga single-strand break at double-strand break sa DNA ng mga buhay na organismo. Bukod dito, ang DNA ligase ay ginagamit sa parehong pag-aayos ng DNA at pagtitiklop ng DNA. Bukod sa mga gamit sa itaas, ang DNA ligase ay mayroon ding malawak na paggamit sa mga eksperimento sa molecular biology tulad ng recombinant DNA technology. Ang T4 DNA ligase at E. coli DNA ligase ay dalawang uri ng DNA ligase enzymes.
Ano ang T4 DNA Ligase?
Ang T4 ligase ay isang DNA na sumasali sa enzyme na nakahiwalay sa bacteriophage T4. Ang T4 bacteriophage ay isang virus na nakakahawa sa Escherichia coli. Ang T4 ligase enzyme ay ang pinakakaraniwang ginagamit na DNA ligase sa molecular biological laboratory research. Karaniwan, pinapagana ng T4 ligase ang pagsasama ng dalawang magkakaugnay o blunt-ended strand ng double-strand na DNA sa pagitan ng 5' phosphate at 3' hydroxyl na grupo ng mga katabing nucleotides. Maaari din nitong gawing catalyze ang pagsasama ng RNA sa alinman sa isang DNA o RNA strand sa isang duplex molecule. Gayunpaman, ang enzyme na ito ay hindi sasali sa mga single-stranded na nucleic acid. Bukod dito, maaari din nitong i-ligate ang blunt-ended DNA na may higit na kahusayan kaysa sa E. coli DNA ligase.
Figure 01: T4 DNA Ligase
Ang enzyme na ito ay nangangailangan ng ATP bilang isang cofactor. Ang ilang mga eksperimento sa pananaliksik sa genetic engineering ay nakagawa na ng mas aktibong DNA ligase enzymes kaysa sa wild-type na T4 DNA ligase. Sa isa sa mga diskarte, lumikha sila ng isang fusion enzyme molecule sa pamamagitan ng pagsusuklay ng T4 DNA ligase sa alinman sa p50 o NF-kB molecule. Ang bagong T4 ligase enzyme na ito ay 160% na mas aktibo sa blunt-end ligations para sa mga layunin ng pag-clone kaysa sa wild-type na T4 DNA ligase. Higit pa rito, ang pinakamainam na temperatura para sa T4 DNA ligase upang gawing mas tumpak ang reaksyon ng ligation ay 16 °C.
Ano ang E Coli DNA Ligase?
E. coli Ang DNA ligase ay isang enzyme na nakahiwalay sa E. coli bacteria. Ang gene na responsable sa paggawa ng E. coli DNA ligase ay lig gene. Ang E. coli DNA, ligase pati na rin ang karamihan sa prokaryotes DNA ligases, ay gumagamit ng enerhiya na nakukuha ng NAD (nicotinamide adenine dinucleotide) upang lumikha ng phosphodiester bond.
Figure 02: E. Coli DNA Ligase
E. coli DNA ligase ay isang ligation enzyme na maaaring sumali sa mga fragment ng DNA sa pamamagitan ng pag-catalyze sa pagbuo ng mga phosphodiester bond sa pagitan ng double-stranded na mga fragment ng DNA na naglalaman ng 5' phosphate termini at 3' hydroxyl termini. Bukod dito, hindi ito nag-ligate ng blunt-ended DNA maliban sa ilalim ng mga espesyal na kondisyon tulad ng molecular crowding na may polyethylene glycol. Hindi rin nito maiugnay ang RNA sa DNA nang mahusay. Higit pa rito, ang aktibidad ng E. coli DNA ligase ay maaaring mapahusay sa pamamagitan ng pagkakaroon ng DNA polymerase 1 sa tamang konsentrasyon. Gayunpaman, kapag mas mataas ang konsentrasyon ng DNA polymerase 1 enzyme, mayroon itong masamang epekto sa aktibidad ng E. coli DNA ligase.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng T4 DNA Ligase at E Coli DNA Ligase?
- Ang T4 DNA ligase at E-coli DNA ligase ay dalawang uri ng DNA ligase enzymes.
- Parehong mga protina na binubuo ng mga amino acid.
- Ang mga enzyme na ito ay nagpapagana sa pagbuo ng isang phosphodiester bond sa pagitan ng pinagsamang 5’ phosphate at 3’ hydroxyl termini sa duplex DNA.
- Mayroon silang malawak na paggamit sa mga eksperimento sa molecular biology gaya ng recombinant DNA technology.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng T4 DNA Ligase at E Coli DNA Ligase?
T4 Ang DNA ligase ay isang enzyme na nakahiwalay sa bacteriophage T4 habang ang E. coli DNA ligase ay isang enzyme na nakahiwalay sa E. coli bacteria. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng T4 DNA ligase at E. coli DNA ligase. Higit pa rito, ang pinagmumulan ng enerhiya para sa T4 DNA ligase ay ATP. Sa kabilang banda, ang pinagmumulan ng enerhiya para sa E. coli DNA ligase ay NAD.
Ipinapakita ng infographic sa ibaba ang mga pagkakaiba sa pagitan ng T4 DNA ligase at E coli DNA ligase sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – T4 DNA Ligase vs E Coli DNA Ligase
Ang T4 DNA ligase at E. coli DNA ligase ay dalawang enzyme na nagpapagana sa pagbuo ng isang phosphodiester bond sa pagitan ng pinagsamang 5’ phosphate at 3’ hydroxyl termini sa duplex DNA. Ang T4 ligase ay isang enzyme na nakahiwalay sa bacteriophage T4 habang ang E. coli DNA ligase ay isang enzyme na nakahiwalay sa E. coli bacteria. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng T4 DNA ligase at E coli DNA ligase.
