Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng cell free DNA at circulating tumor DNA ay ang cell free DNA ay iba't ibang anyo ng DNA na malayang umiikot sa dugo habang ang circulating tumor DNA ay ang fragmented tumor-derived DNA na umiikot sa dugo.
Cell free DNA at circulating tumor DNA ay dalawang uri ng circulating nucleic acids. Ang mga umiikot na nucleic acid ay natuklasan ng Mandel at Metal noong 1948. Nang maglaon, natuklasan na ang dami ng nagpapalipat-lipat na nucleic acid sa mga pasyenteng may sakit ay lubhang mataas. Ang pagtuklas na ito ay unang ginawa kaugnay sa mga pasyenteng lupus. Bukod dito, ang mga nagpapalipat-lipat na nucleic acid ay may mas mataas na halaga ng prognostic at maaaring magamit bilang isang biomarker para sa pag-detect ng iba't ibang mga sakit.
Ano ang Cell Free DNA?
Ang Cell free DNA (Cf DNA) ay tumutukoy sa iba't ibang anyo ng DNA gaya ng circulating tumor DNA, cell free mitochondrial DNA, at cell free fetal DNA, atbp., na malayang umiikot sa dugo. Ang mga mataas na antas ng cell free DNA ay sinusunod sa mga advanced na sakit tulad ng cancer, trauma, sepsis, myocardial infarction, diabetes, stroke, sickle cell disease, atbp. Bilang karagdagan sa cancer at fetal medicine, ang cell free DNA ay isang kapaki-pakinabang na biomarker para sa isang ang daming karamdaman. Magagamit din ang DNA na ito para makita ang pagtanggi sa transplant graft. Ginagamit din ang mga ito sa pagtukoy ng ordinaryong stress, pagkilala sa kasarian bago manganak, at sa paternity testing.
Figure 01: Cell Free DNA
Ang cell free DNA ay karaniwang isang double-stranded extracellular molecule ng DNA. Binubuo ito ng maliliit na fragment (50 hanggang 200 bp) at mas malalaking fragment (21 kb). Higit pa rito, nakilala na ito bilang isang maaasahang biomarker para sa pagsusuri ng prostate at kanser sa suso. Ang cell free DNA ay pangunahing umiikot sa daloy ng dugo bilang mga nucleosome. Ang mga nucleosome ay mga nuclear complex ng mga histone at DNA. Maaaring ma-quantify ang Cf DNA gamit ang iba't ibang mga diskarte tulad ng PCR, massively parallel sequencing, ultraviolet spectrometry, PicoGreen staining, at ELISA. Dahil ang Cf DNA detection sa bloodstream ay isang mabilis, madali, hindi nagsasalakay, paulit-ulit na paraan, sa hinaharap, ito ay magiging potensyal na biomarker para sa pag-diagnose ng maraming sakit tulad ng autoimmune rheumatic disease at tumor.
Ano ang Circulating Tumor DNA?
Ang Circulating tumor DNA (Ct DNA) ay ang fragmented tumor-derived DNA na umiikot sa dugo. Ito ay may pinagmulan ng tumor. Bilang isang nagpapalipat-lipat na tumor ay maaaring sumasalamin sa buong genome ng tumor, ito ay nakakuha ng malawak na atraksyon para sa potensyal na utility nito sa mga klinikal na pag-setup. Ang mga likidong biopsy, na kumukuha ng dugo, ay maaaring gamitin upang masuri ang mga nagpapalipat-lipat na tumor.
Figure 02: Circulating Tumor DNA
Ang mga biological na proseso na malamang na kasangkot sa pagpapalabas ng Ct DNA ay kinabibilangan ng apoptosis at nekrosis mula sa namamatay na mga cell o aktibong paglabas mula sa mga tumor cells. Sa malusog na mga tisyu, ang mga infiltrating phagocytes ay maaaring mag-clear ng Ct DNA. Higit pa rito, maaaring gamitin ang iba't ibang diskarte sa pagsusuri ng circulating tumor DNA gaya ng droplet digital PCR, BEAMing, CAPP-Seq (deep sequencing), Safe-sequencing, at duplex sequencing.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Cell Free DNA at Circulating Tumor DNA?
- Cell free DNA at circulating tumor DNA ay dalawang uri ng circulating nucleic acids.
- Binubuo sila ng mga nucleotide.
- Ang parehong mga uri ay maaaring gamitin bilang mga potensyal na marker upang masuri ang iba't ibang sakit sa mga klinikal na setup.
- Matatagpuan ang mga ito sa daluyan ng dugo.
- Parehong mga extracellular na anyo ng mga molekula ng DNA.
- Pareho silang nalilinis sa pamamagitan ng pagpasok ng mga phagocyte.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Cell Free DNA at Circulating Tumor DNA?
Ang cell free DNA ay iba't ibang anyo ng DNA gaya ng circulating tumor DNA, cell free mitochondrial DNA at cell free fetal DNA, atbp., na malayang umiikot sa dugo, habang ang circulating tumor DNA ay ang fragmented tumor-derived DNA. na umiikot sa dugo. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng cell free DNA at circulating tumor DNA. Higit pa rito, ang cell free DNA ay umiikot sa mga fragment na mula 50-220 bp habang ang nagpapalipat-lipat na tumor DNA ay umiikot sa mga fragment mula 134-144 bp.
Ang sumusunod na infographic ay nagpapakita ng pagkakaiba sa pagitan ng cell free DNA at circulating tumor DNA sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – Cell Free DNA vs Circulating Tumor DNA
Ang mga nagpapaikot na nucleic acid ay itinatapon sa daloy ng dugo sa pamamagitan ng mga regulated o fortuitous na mekanismo. Ang cell free DNA at circulating tumor DNA ay dalawang uri ng circulating nucleic acids. Ang cell free DNA ay iba't ibang anyo ng DNA tulad ng circulating tumor DNA, cell free mitochondrial DNA, cell free fetal DNA na malayang umiikot sa dugo habang ang circulating tumor DNA ay ang fragmented tumor derived DNA na umiikot sa dugo. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng cell free DNA at circulating tumor DNA.
