Transposon vs Retrotransposon
Ang mga transposon at retrotransposon ay mga genetic na bahagi ng DNA, at may malaking pagkakaiba sa pagitan ng mga ito. Ang porsyento ng presensya ng mga genetic na materyales na ito ay nag-iiba-iba sa mga species, at ang kanilang mga pag-andar ay tumutukoy sa mga kapalaran ng organismo na may mga mutasyon at iba pang phenotypically mahahalagang pagbabago. Ang mga transposon at retrotransposon ay mga gene o koleksyon ng ilang partikular na gene na matatagpuan sa mga strand ng DNA, at ang mga pagbabago sa kanilang mga lokasyon ang naging pangunahing dahilan ng mga kahihinatnan na ito. Gayunpaman, ang artikulong ito ay naglalayon na talakayin ang mga pag-andar ng mga gene na ito nang maikli at nagpapakita ng paghahambing sa pagitan ng mga transposon at retrotransposon.
Ano ang Transposon?
Ang Transposon ay mga kawili-wiling fragment o segment ng DNA na may kakayahang baguhin ang lokasyon ng DNA strand sa anyo ng cut and paste na mekanismo. Dahil sa likas na mobile na ito ng mga transposon, ang mga ito ay kilala bilang mga jumping genes. Ang mga transposon ay may dalawang pangunahing uri na kilala bilang Class I Transposon at Class II Transposon. Karaniwan, ang uri ng Class II ay tinutukoy bilang mga transposon at ang uri ng Class I ay tinutukoy bilang mga retrotransposon. Ang mga proseso ng pagputol at pag-paste ng mga mobile na segment ng DNA ay kinokontrol ng enzyme transposase. Ang enzyme ay nagbubuklod sa magkabilang dulo ng transposon at pinuputol ang mga phosphodiester bond ng DNA strand, ihiwalay ang transposon, ilipat ito sa target na site, at itali sa bagong lokasyon. Gayunpaman, ang prosesong ito ay kagiliw-giliw na maunawaan, dahil ang ilang mga transposon ay maaari lamang lumipat sa ilang mga lokasyon lamang dahil sa hindi pagkakatugma ng mga base sequence sa target na site. Ang mga gene na may isang dulo ng isang strand ay may parehong base sequence sa kabilang dulo ng isa pang single strand ay mga transposon na may malagkit na mga gilid, dahil ang mga iyon ay maaaring magbigkis sa mga site ng target na DNA strand na may parehong base sequence tulad ng sa malagkit na mga dulo.. Gayunpaman, ang kadaliang ito ng mga gene ay maaaring magdulot ng mga pagbabago sa genotype gayundin sa phenotype ng organismo. Ang mga siyentipiko ay nag-imbento tungkol sa mga transposon at genetically modified na pagkain at mga organismo ayon sa ginustong mga pagpapasadya ay ginawang magagamit. Ang mataas na produktibong mga pananim na pang-agrikultura, mga antibiotic na may mga nakapagpapagaling na katangian, mga hayop na hayop ay ilan sa mga pinakinabangang produkto matapos ang pag-imbento ng mga transposon ni Barbara McClintock noong 1940s.
Ano ang Retrotransposon?
Ang Retrotransposon ay ang Class I transposon, at ang mga ito ay gumagalaw sa genome sa pamamagitan ng mekanismo ng pagkopya at pag-paste. Ang mekanismo ng mobility ng retrotransposons ay nagsasangkot ng ilang pangunahing hakbang tulad ng pagkopya ng gene segment ng DNA strand sa RNA, paglipat ng kopya ng RNA sa target na site, transkripsyon ng RNA sequence pabalik sa DNA gamit ang reverse transcriptase, at pagpasok ng gene sa bagong lokasyon ng DNA strand ng genome. Ang dalawang dulo ng mga retrotransposon na ito ay karaniwang may mahabang terminal na umuulit na may humigit-kumulang 1000 base pairs, at ang mga iyon ay ginagamit bilang mga tampok sa pagkakakilanlan ng mga gene na ito. Ang mga gene na ito ay madaling pinalaki sa loob ng genome, at ang porsyento ng mga retrotransposon sa genome ng tao ay halos 50%. Ang mga ito ay maaaring maging lubhang mapanganib dahil ang causative virus ng AIDS, HIV, at T-cell leukemia virus ay mayroong mga retrotransposon sa kanilang RNA genome. Sa katunayan, ang mga virus na ito ay maaaring magbigkis sa mga retrotransposon sa anumang site ng mga DNA strands ng tao sa paggamit ng reverse transcriptase at integrase. Ang integrase enzyme ay gumagana sa parehong paraan tulad ng transposase sa Class II transposon.
Ano ang pagkakaiba ng Transposon at Retrotransposon?
• Ang mga transposon ay Class II jumping genes habang ang mga retrotransposon ay nasa kategorya ng Class I.
• Ang mga transposon ay gumagana sa transposase enzyme samantalang ang mga retrotransposon ay gumagana sa paggamit ng dalawang pangunahing enzyme na kilala bilang reverse transcriptase at integrase.
• Ang mga dulo ng terminal ay mas mahaba sa mga retrotransposon kaysa sa mga transposon.
• Ang mga transposon ay pinuputol mula sa pinanggalingan at idinidikit sa target; sa kabaligtaran, ang mga retrotransposon ay kinokopya mula sa pinanggalingan sa RNA at na-transcribe sa target.
• Ang paglipat ng mga retrotransposon ay nagsasangkot ng RNA ngunit hindi sa mga transposon.
