Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng gene knockout at knockdown ay ang gene knockout ay isang pamamaraan kung saan ang gene ng interes ay ganap na tinanggal (inoperative state) upang pag-aralan ang mga function ng gene habang ang gene knockdown ay isa pang pamamaraan kung saan ang gene ng ang interes ay pinatahimik upang siyasatin ang papel ng partikular na gene sa isang biological system.
Iba't ibang genetic technique ang gumagana upang siyasatin ang paggana ng mga gene sa loob ng mga buhay na biological system. Ang gene knockout at knockdown ay dalawang ganoong pamamaraan. Ang mga pamamaraan na ito ay tumutulong sa mga siyentipiko na matukoy ang mga functional na aspeto ng iba't ibang mga gene sa mga buhay na organismo.
Ano ang Gene Knockout?
Ang Gene knockout ay isang genetic technique na ginagawang hindi gumagana ang isa o higit pang mga gene sa mga buhay na organismo. Isa rin itong proseso ng pagpapasara o pagtanggal ng gene ng isang organismo. Ang pangunahing aplikasyon ng pamamaraang ito ay pag-aralan ang function ng gene. Sinusuri ng proseso ang epekto ng nawala o inalis na gene. Kasama rin sa proseso ng knockout ang ilang partikular na enzyme at mga diskarte sa pag-splice.
Figure 01: Gene Knockout
May ilang mga variation sa gene knockout technique batay sa bilang ng mga gene na kasangkot. Ang mga ito ay double knockout (knockout ng dalawang genes), triple knockout (knockout ng tatlong genes) at quadruple knockout (knockout ng apat na genes). Ang gene knockout ay higit na inuri sa dalawang grupo; heterozygous knockout at homozygous knockout.
Ano ang Gene Knockdown?
Ang Gene knockdown ay isang eksperimental na pamamaraan kung saan pinipigilan o binabawasan ng pamamaraang ito ang pagpapahayag ng isang partikular na gene o mga gene ng isang organismo. Gene silencing ay ang karaniwang kahulugan para sa gene knockdown. Sa panahon ng pamamaraang ito, ang pag-activate o pagkasira ng ginawang mRNA ay kinabibilangan ng RNA interference (RNAi), small interfering RNA (siRNA) at short hairpin RNA (shRNA).
Figure 02: Gene Silencing
Ang pangunahing paggamit ng gene knockdown ay upang siyasatin ang papel ng partikular na gene sa biological system. Samakatuwid, nagagawa ng diskarteng ito ang pag-aaral ng mga oncogenes (Bcl-2 at P53) at mga gene na nagdudulot ng mga sakit sa neurological, mga impeksyon sa viral at mga namamana na sakit.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Gene Knockout at Knockdown?
- Parehong gene knockout at gene knockdown ay mga genetic technique.
- Maaaring pigilan ng dalawang diskarteng ito ang pagpapahayag ng gene.
- Ang pangunahing paggamit ng parehong mga diskarte ay upang siyasatin ang function ng gene ng interes.
- Parehong may kakayahang tumukoy ng iba't ibang kondisyon ng sakit (genetical).
- Maaaring magamit ang mga ito para sa isa o higit pang mga gene ng interes.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Gene Knockout at Knockdown?
Gene Knockout vs Knockdown |
|
| Ang gene knockout ay in-operation ng mga gene (pagtanggal ng mga gene mula sa DNA) ng isang organismo sa pamamagitan ng iba't ibang genetic technique. | Ang gene knockdown ay isang eksperimental na pamamaraan upang sugpuin (bawasan o patahimikin) ang pagpapahayag ng isang partikular na gene o mga gene ng isang organismo. |
| Function | |
| Pinapadali ang pag-aaral ng mga function ng mga gene sa pamamagitan ng pagsusuri sa mga resulta ng nawawalang gene. | Pinapadali ang pag-aaral ng mga oncogene, mga gene na nagdudulot ng mga sakit sa neurological, mga impeksyon sa viral, at mga namamana na sakit. |
| Paglahok ng RNA Agents | |
| Ang paglahok ng mga ahente ng RNA ay hindi gaanong mahalaga sa pamamaraang ito. | Ang proseso ay nagsasangkot ng mga ahente gaya ng siRNA, shRNA, at RNAi upang i-inactivate ang mRNA. |
| Paggamit ng mga Ahente ng Kemikal | |
| Ginagamit ang mga enzymatic agent. | Walang ginagamit na mga kemikal na ahente. |
| Epekto sa Gene | |
| Ganap na inaalis ang gene sa DNA. | Pigilan o patahimikin ang gene. |
| Pag-uuri | |
| Double knockout, triple knockout at quadruple knockout at heterozygous at homozygous knockout ay iba't ibang uri ng gene knockout. | Walang available na ganitong classification system para sa gene silencing. |
Buod – Gene Knockout vs Gene Knockdown
Ang dalawang technique na tinalakay natin dito; ang gene knockout at knockdown, ay mga paraan upang siyasatin ang mga function ng iba't ibang mga gene. Ang gene knockout ay ganap na ginagawang hindi gumagana ang gene habang ang gene knockdown ay nagpapatahimik sa gene ng interes. Gayunpaman, pinipigilan ng parehong mga pamamaraan ang pagpapahayag ng gene. Ang iba't ibang mga ahente ay may kakayahang magawa ang dalawang prosesong ito. Ang gene knock out ay isang uri ng pagtanggal habang ang gene knockdown ay isang uri ng inactivation. Ito ang pagkakaiba ng gene knock out at knockdown.
