Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng motif at domain ay ang motif ay hindi independently stable habang ang domain ay independent stable.
Ang mga protina ay mahalagang biological macromolecules na nasa ating katawan. Sa kabilang banda, ang genetic code ng isang gene ang magpapasya sa pagkakasunud-sunod ng amino acid ng isang protina. Bukod dito, ang mga protina ay may pangunahin, pangalawa at tersiyaryong istruktura. Ang pangunahing istraktura ay ang pagkakasunud-sunod ng amino acid ng polypeptide chain. Kapag ang mga polypeptide chain ay nakatiklop sa isa't isa, ito ay bumubuo ng pangalawang istraktura ng protina. Ang mga alpha helice, beta sheet at super-secondary na istruktura ay kabilang sa mga pangalawang istruktura. Ang ilang partikular na pagpapangkat ng mga super-secondary na elemento ay kilala bilang mga motif ng protina. Ang tertiary na istraktura ng isang protina ay tumutukoy sa tatlong-dimensional na istraktura nito na nagpapasya sa paggana ng protina. Ang domain ay isang nakatiklop na seksyon ng isang molekula ng protina, na globular at may discrete function. Ito ang pangunahing functional at three-dimensional na istraktura ng protina.
Ano ang Motif?
Ang Motif ay isang partikular na pagpapangkat ng mga sobrang pangalawang elemento ng mga protina gaya ng mga alpha helice at beta structure. Ang mga ito ay ilang uri ng mga pattern na naroroon sa iba't ibang mga protina. Inilalarawan ng mga motif ang mga natitiklop na pattern ng pangalawang istrukturang elemento at ang kanilang mga pakikipag-ugnayan. Ang mga natitiklop na pattern na ito ay nagpapatatag sa pamamagitan ng mga katulad na ugnayan na naroroon sa mga tertiary na istruktura. Gayunpaman, ang mga ito ay hindi kasing kumplikado ng mga tertiary structure.
Figure 01: Motif
Sila ay mga simpleng kumbinasyon ng pangalawang istruktura ng mga protina. Ang motif ay hindi stable nang mag-isa. Higit pa rito, ipinapaliwanag ng mga motif ang istruktura ng isang protina ngunit hindi hinuhulaan ang paggana ng isang protina. Ang mga halimbawa ng mga motif ng protina ay isang beta-alpha-beta motif, Greek key motif, Beta barrel, Beta-meander motif, atbp.
Ano ang Domain?
Ang Domain ay isang pundamental, functional at tatlong dimensional na unit ng isang protina. Gumaganap ito ng isang partikular na function. Ang isang protina ay maaaring magkaroon ng ilang natatanging domain. Ang bawat domain ay isang independiyenteng yunit. Ito ay isang globular na istraktura. Ito ay responsable para sa isang partikular na function o pakikipag-ugnayan. Maaaring gamitin ang mga domain upang i-hypothesize ang paggana ng isang hindi naka-characterized na protina. Kapag nagsusuri ng protina, mahalagang isaalang-alang dahil ang mga domain ay ang functional unit ng protina.
Figure 02: Tatlong Iba't ibang Domain ng Pyruvate Kinase
Ang mga domain ay napaka-stable at mga compact na istruktura. Madali silang makilala sa ibang mga rehiyon. Ang Pyruvate kinase ay may tatlong natatanging domain tulad ng ipinapakita sa figure 02. Ang haba ng domain ay maaaring mag-iba, at ang average na haba ay 100 amino acids. Ang bawat domain ay naglalaman ng hydrophobic core na binuo mula sa mga pangalawang istrukturang unit. Maraming domain ang sama-samang gumagawa ng tertiary structure ng isang protina.
Ano ang Pagkakatulad sa Pagitan ng Motif at Domain?
- Ang motif at domain ay mga unit na nasa mismong mga molekula ng protina.
- Kapaki-pakinabang ang mga ito sa pag-uuri ng mga pamilya ng protina.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Motif at Domain?
Ang Motif ay isang partikular na pagpapangkat ng mga sobrang pangalawang elemento ng mga protina gaya ng mga alpha helice at beta structure habang ang domain ay ang functional unit ng isang protina. Higit pa rito, ang motif ay isang pangalawang istraktura habang ang domain ay responsable para sa tertiary na istraktura ng protina. Bukod dito, ang domain ay isang independiyenteng yunit, hindi katulad ng isang motif. Gayundin, inilalarawan ng domain ang paggana ng isang protina habang ang motif ay hindi. Ito ang mga pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng motif at domain. Ang infographic sa ibaba ay nagpapakita ng pagkakaiba sa pagitan ng motif at domain sa tabular form.
Buod – Motif vs Domain
Ang Motif ay isang pagsasaayos ng mga pangalawang istruktura ng molekula ng protina. Ito ay karaniwang hindi stable nang mag-isa, hindi katulad ng isang domain. Ang domain ay isang independiyenteng matatag na istraktura ng isang protina. Samakatuwid, maaari itong maging isang bahagi o buong molekula ng protina. Ito ay isang three-dimensional na pangunahing functional unit ng protina. Bukod dito, mayroon itong isang function, at ito ay isang independiyenteng yunit. Maaaring maging bahagi ng domain ang motif. Ngunit ang domain ay hindi maaaring maging bahagi ng isang motif. Ito ang pagkakaiba sa pagitan ng motif at domain.
