Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng 1D at 2D gel electrophoresis ay ang mga katangiang ginagamit para sa paghihiwalay ng mga protina sa gel electrophoresis. Ang 1D gel electrophoresis ay naghihiwalay lamang ng mga protina batay sa molecular weight habang ang 2D gel electrophoresis ay naghihiwalay ng mga protina batay sa iso-electric point at molecular weight nito.
Ang paghihiwalay ng protina sa pamamagitan ng gel electrophoresis ay isang mahalagang pamamaraan upang makilala ang mga protina. Ang mga protina ay may iba't ibang katangian; samakatuwid, ang paghihiwalay ay mas kumplikado kumpara sa paghihiwalay ng DNA sa pamamagitan ng Agarose gel electrophoresis.
Ano ang 1D Gel Electrophoresis?
Ang 1D Gel Electrophoresis, na kilala rin bilang one dimension gel electrophoresis, ay isang paraan ng paghihiwalay ng protina batay sa molecular weight. Pangunahing nagaganap ang paghihiwalay ng protina gamit ang polyacrylamide gel electrophoresis. Batay sa konsepto ng gel electrophoresis, ang mga molekula ay naghihiwalay sa kanilang katangian ng molekular na timbang at singil.
Samakatuwid, upang magbigay ng pare-parehong singil sa mga protina, ang paggamot sa Sodium dodecyl sulfate (SDS) ay ginagawa bago ang gel electrophoresis. SDS denatures protina at nagbibigay ng isang pare-pareho negatibong singil sa protina; kapag naganap ang paggamit ng electric field, ang mga protina ay lumilipat sa positibong terminal batay sa kanilang molekular na timbang. Kaya, sa paghihiwalay, isang ari-arian lamang ang isinasaalang-alang. Ito ang dahilan kung bakit ang paraang ito ay tinatawag na 1D gel electrophoresis.
Figure 01: 1D Gel Electrophoresis
Sa panahon ng 1D gel electrophoresis, ang mga protina ay pinaghihiwalay batay sa kanilang molekular na timbang. Sa pagsasaalang-alang na ito, ang mas mababang timbang na mga molekula ay lumilipat nang mas mabilis sa gel kumpara sa mataas na molekular na timbang na mga protina. Kaya, ang mga high weight na protina ay nananatiling malapit sa mga balon.
Ano ang 2D Gel Electrophoresis?
Ang 2D gel electrophoresis o two-dimensional gel electrophoresis ay naghihiwalay sa mga protina batay sa dalawang katangian. Ang dalawang katangian ay ang iso-electric point ng protina at molecular weight. Ang pamamaraang ito ng paghihiwalay ng protina ay nagpapataas ng resolusyon ng paghihiwalay ng protina. Ang iso-electric point ng protina ay depende sa pH kung saan neutral ang protina.
Figure 02: 2D Gel Electrophoresis
Kaya, sa 2D gel electrophoresis, pinapayagang tumakbo ang protina sa isang nakapirming pH gradient sa unang dimensyon. Sa pangalawang dimensyon, ang mga protina ay pinaghihiwalay gamit ang vertical o horizontal polyacrylamide gel electrophoresis. Kaya, ang mga protina ay naghihiwalay ayon sa kanilang molekular na timbang sa pangalawang dimensyon.
Bukod dito, pinapataas ng pamamaraang ito ng gel electrophoresis ang resolusyon ng paghihiwalay ng protina. Samakatuwid, ang mga pinaghiwalay na protina ay mas dalisay. Gayunpaman, ang halaga ng pamamaraan ay mas mataas kaysa sa isang dimensyon na gel electrophoresis.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng 1D at 2D Gel Electrophoresis?
- Ang parehong mga diskarte ay naghihiwalay ng mga protina.
- Kaya, mahalaga ang mga ito sa pagkilala sa mga protina.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng 1D at 2D Gel Electrophoresis?
Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng 1D at 2D gel electrophoresis ay ang 1D gel electrophoresis ay naghihiwalay ng mga protina batay lamang sa molecular weight habang ang 2D gel electrophoresis ay naghihiwalay ng mga protina batay sa parehong iso-electric point at molecular weight. Dahil sa pangunahing pagkakaiba na ito sa pagitan ng 1D at 2D gel electrophoresis, ang paglutas ng paghihiwalay ng mga protina at ang halaga ng dalawang pamamaraan ay nag-iiba din. Ang 2D gel electrophoresis ay nagpapakita ng mataas na resolution kaysa sa 1D gel electrophoresis. Gayunpaman, ang 2D gel electrophoresis ay mas mahal kaysa sa 1D gel electrophoresis.
Sa ibaba ng infographic ay nagbubuod sa pagkakaiba sa pagitan ng 1D at 2D gel electrophoresis.
Buod – 1D vs 2D Gel Electrophoresis
Ang paghihiwalay ng mga protina ay umaasa sa maraming salik. Ang 1D gel electrophoresis ay naghihiwalay ng mga protina batay lamang sa bigat ng molekular. Gayunpaman, ang dalawang dimensional o 2D gel electrophoresis ay nagpapataas ng resolusyon ng paghihiwalay ng protina. Dagdag pa, ang 2D gel electrophoresis ay naghihiwalay sa mga protina batay sa iso-electric point at ang molekular na timbang. Samakatuwid, ang mga data na ito ay mahalaga para sa downstream na pagproseso ng mga protina at sa larangan ng proteomics. Kaya, ito ang buod ng pagkakaiba sa pagitan ng 1D at 2D gel electrophoresis.
