Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng wobble at degeneracy ay ang wobble ay tumutukoy sa hypothesis na nagpapaliwanag sa non-Watson at crick na pagpapares sa panahon ng codon at anticodon binding sa pagitan ng mRNA at tRNA. Samantala, ang pagkabulok ng codon ay ang kakayahang makagawa ng isang amino acid mula sa maraming codon.
Ang sentral na dogma ng molecular biology ay nagpapaliwanag sa proseso kung saan nagaganap ang pagpapahayag ng mga functional na protina. At, ang prosesong ito ay isang pagkakasunud-sunod ng iba't ibang mga hakbang, kabilang ang pagtitiklop ng genetic na materyal na sinusundan ng transkripsyon ng pagkakasunud-sunod ng DNA sa pagkakasunud-sunod ng mRNA at pagsasalin ng pagkakasunud-sunod ng mRNA sa isang pagkakasunud-sunod ng amino acid.
Sa pagsasalin, ang mga konsepto ng wobble hypothesis at ang pagkabulok ng codon ay gumaganap ng mahahalagang tungkulin. Ang wobble ay tumutukoy sa kakayahan ng solong tRNA na makilala ang higit sa isang codon. Nagbibigay ito ng pagkabulok ng mga codon. Ang pagkabulok ay ang phenomenon kung saan ang isang amino acid ay maaaring tukuyin ng higit sa isang codon. Sa simpleng salita, ang degeneracy ay tumutukoy sa pagkakaroon ng maraming code para sa iisang amino acid.
Ano ang Wobble?
Ang wobble hypothesis ay isang mahalagang hypothesis na nagpapaliwanag sa non-Watson Crick base pairing na nagaganap sa panahon ng proseso ng pagsasalin. Dito, ang pagsasalin ay ang molekular na proseso na nagko-convert sa mRNA codon sa isang amino acid sequence. Ayon sa hypothesis na ito, ang unang base ng tRNA anticodon ay may kakayahang ipares sa ikatlong base ng codon sa mRNA strand sa pamamagitan ng pattern ng pagpapares na hindi Watson at Crick. Kaya, hindi nila sinusunod ang maginoo na adenine-uracil binding o cytosine-guanine binding pattern. Kilala ito bilang wobbling pattern ng base 1 ng anticodon at base 3 ng codon.
Figure 01: Wobble Base Pairing
Ang mga wobble pairing ay kinabibilangan ng Adenine at inosine na pagpapares sa halip na uracil. Ang Uracil ay pares sa Adenine, Guanine at Inosine. Gayundin, ang Guanine at cytosine ay may kakayahang ipares din sa inosine. Kaya, ang inosine sa tRNA ay isa sa mga hindi pangkaraniwang base na sumasailalim sa wobble base pairing.
Ang wobble base pair binding ay hindi gaanong malakas dahil hindi ito kinakailangang sumunod sa Watson at Crick complementary binding. Higit pa rito, ang konseptong ito ay nagbubunga ng prinsipyo ng pagkabulok ng genetic code.
Ano ang Degeneracy?
Ang Degeneracy ng genetic code ay tumutukoy sa redundancy ng genetic code. Kaya, maaaring mayroong maraming mga kumbinasyon ng pares ng base na tumutukoy sa isang solong amino acid. Sa pangkalahatan, ang codon ng mga organismo ay binubuo ng tatlong nucleotide base. Sa konsepto ng pagkabulok, ang tatlong base na kumbinasyong ito ay maaaring magbago kahit na sila ay nagbibigay ng parehong amino acid. Bukod dito, mayroong higit sa 20 codon kahit na mayroon lamang 20 amino acid sa kalikasan. Kaya naman, ipinapaliwanag ng degeneracy ang pagkakaroon ng maraming codon para sa isang partikular na amino acid.
Figure 02: Degeneracy
Sa pagkabulok, ang ikatlong base ay maaaring magbago sa pagitan ng dalawang codon. Kaya, ang glutamic acid ay tinukoy ng parehong mga codon na GAA at GAG, habang ang leucine ay tinukoy ng mga codon na UUA, UUG, CUU, CUC, CUA at CUG.
Samakatuwid, ang konsepto ng pagkabulok ay napakahalaga sa mga rate ng mutation. Dahil dito, ang mga point mutations na nagaganap sa genome ay maaaring tiisin at lumilitaw pa rin na pinatahimik. Kaya, ang ganitong uri ng point mutations ay hindi nagreresulta sa isang mutation o pagbabago ng sequence ng amino acid. Gayunpaman, kung ang mga point mutations ay humahantong sa isang paghalili ng amino acid na naka-encode, maaari itong magdulot ng malubhang genotypic at phenotypic na pagbabago.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Wobble at Degeneracy?
- Ang dalawa ay mahalagang hypotheses na iniharap upang ipaliwanag ang pangunahing dogma ng buhay kaugnay ng proseso ng pagsasalin.
- Bukod dito, ang parehong proseso ay may mahalagang papel sa pagsasalin ng tatlong base na pares ng codon na wika sa 20 amino acid sequence.
- Nakakatulong din ang mga prosesong ito sa mga evolutionary pattern ng mga organismo.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Wobble at Degeneracy?
Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng wobble at degeneracy ay pangunahing ang katotohanan na ang pag-uurong-sulong ay nagreresulta sa pagkabulok ng genetic code. Ang wobbling ay tumutukoy sa pagsunod sa hindi-Watson at Crick na pagpapares sa pagitan ng 3rd base ng codon at 1st base ng anticodon. Sa kabaligtaran, ang degeneracy ay ang kakayahan ng maraming kumbinasyon ng triplet codon na mag-encode ng isang amino acid.
Ibinubuod ng infographic sa ibaba ang pagkakaiba sa pagitan ng wobble at degeneracy.
Buod – Wobble vs Degeneracy
Wobble hypothesis at degeneracy ng genetic code ay dalawang mahalagang konsepto sa phenomenon ng pagsasalin. Dito, ang pagsasalin ay ang proseso ng pag-convert ng triplet codons sa mga amino acid. Sa pagbubuklod ng codon sa anticodon, ang pagtuklas ng non-Watson at Crick base pairing ay tumutukoy sa wobble hypothesis. Ang pag-alog ng mga base sa pagitan ng codon at ng anticodon ay inilalarawan nito. Sa kabaligtaran, ang pagkabulok ng genetic code na nagreresulta sa proseso ng pag-alog ay ang phenomenon kung saan ang isang amino acid ay na-encode ng maraming iba't ibang mga codon. Kaya, ito ang buod ng pagkakaiba ng wobble at degeneracy.
