Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng PARP1 at PARP2 ay ang halaman at hayop na PARP1 ay may Zn-finger DNA binding motifs habang ang plant PARP2 ay may N-terminal SAP DNA binding motifs.
Ang Poly ADP ribose polymerase (PARP) ay isang pamilya ng mga protina na mga nuclear enzyme. Mayroong 17 iba't ibang uri ng PARP enzymes sa PARP family. Ang PARP1 at PARP2 ay dalawang enzyme na mahalaga sa normal na mga aktibidad sa pag-aayos ng DNA.
Ano ang PARP?
Ang PARP (Poly ADP ribose polymerase) ay isang pamilya ng mga protina na nagsisilbi sa maraming proseso ng cellular tulad ng DNA repair, genomic stability, at programmed cell death. Pinapagana nila ang isang prosesong tinatawag na ADP-ribosylation. Ang ADP-ribosylation ay tumutukoy sa pagdaragdag ng ADP-ribose units mula sa nicotinamide adenine dinucleotide (NAD) sa mga target na substrate para maayos ang DNA strand break.
Ang
PARP enzymes ay mga DNA-binding proteins. Ang mga ito ay isinaaktibo ng mga nicks na naroroon sa mga molekula ng DNA. Sa sandaling magbigkis sila sa mga break ng DNA, i-hydrolyze nila ang NAD+ sa nicotinamide at itinataguyod ang polymerization ng ADP-ribose. Samakatuwid, ang PARP nuclear enzymes ay lumahok sa pag-aayos ng DNA. Bukod dito, ang poly-ADP-ribosylation ay gumagana bilang isang post-translational modification na gumaganap ng isang mahalagang papel sa pagtitiklop, regulasyon ng transkripsyon, pagpapanatili ng telomere at pagkasira ng protina. Nakikilahok din ang mga enzyme ng PARP sa pagpapanatili ng katatagan ng genome, regulasyon ng istruktura ng chromatin, paglaganap ng cell, at apoptosis.
Ano ang PARP1?
Ang PARP1 ay isang miyembro ng PARP protein family. Ito ang una at pinakamahusay na nailalarawan na protina sa pamilyang ito. Ito ay gumaganap bilang isang unang tumugon na nakakakita ng mga pinsala sa DNA at pagkatapos ay pinapadali ang pagpili ng mekanismo ng pag-aayos. Bukod dito, kinokontrol ng PARP1 ang pag-aayos ng mga single-strand na pinsala sa DNA.
Figure 01: PARP1
Bilang karagdagan sa pag-aayos ng mga single-strand na DNA break, kinokontrol ng PARP1 ang pag-usad ng replication fork at muling simulan. Higit pa rito, nagpo-promote ito ng alternatibong non-homologous end-joining.
Ano ang PARP2?
Ang PARP2 ay isa pang miyembrong protina sa PARP protein family. Ito ay malapit na nauugnay sa PARP1 enzyme. Ang gene na PARP2 code para sa PARP2 na protina sa mga tao. Ang PARP2 ay may catalytic domain ngunit walang N terminal DNA binding domain. Ang mga gamot na anti-cancer inhibitor ng PARP ay maaaring makapigil sa PARP2, katulad ng PARP1.
Figure 02: PARP2
Sa mga halaman, lalo na sa Arabidopsis thaliana, gumaganap ng malaking papel ang PARP2 sa mga proteksiyon na tugon sa pagkasira ng DNA at bacterial pathogenesis kaysa sa PARP1.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng PARP1 at PARP2?
- Ang PARP1 at PARP2 ay dalawang uri ng nuclear enzymes.
- Ginagamit nila ang NAD+ bilang kanilang substrate para i-catalyze ang poly ADP ribosylation.
- Parehong na-activate ng DNA single-strand break.
- Mammalian PARP1 at PARP2 ay matatagpuan sa nucleus.
- Parehong nakikipag-ugnayan ang PARP1 at PARP2 sa chromatin.
- Nag-aayos sila ng mga pinsala sa DNA.
- Ang ilang PARP inhibitor anti-cancer na gamot na naglalayong PARP1 ay humahadlang din sa PARP2.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng PARP1 at PARP2?
Ang PARP1 ay miyembro ng PARP protein family na mayroong catalytic domain at N-terminal DNA binding domain habang ang PARP2 ay miyembro ng PARP family na walang N-terminal DNA binding domain. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng PARP1 at PARP2 ay ang PARP1 ng halaman at hayop ay may Zn-finger DNA binding motifs habang ang plant PARP2 ay may N-terminal SAP DNA binding motifs.
Ang sumusunod na infographic ay nagbubuod sa pagkakaiba sa pagitan ng PARP1 at PARP2.
Buod – PARP1 vs PARP2
Ang
PARPs ay mga nuclear enzyme na nakakaramdam ng mga pinsala sa DNA at nagkukumpuni ng mga ito. Ang PARP1 at PARP2 ay dalawa sa kanila na malapit na magkaugnay. Ang parehong mga enzyme ay may catalytic domain. Ngunit ang PARP2 ay walang N-terminal DNA binding domain na naroroon sa PARP1. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng PARP1 at PARP2. Ang parehong uri ng enzyme ay gumagamit ng NAD+ bilang kanilang substrate.
