Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng TATA at CAAT box ay ang TATA box ay isang conserved nucleotide region na may consensus sequence ng TATAWAW habang ang CAAT box ay isang conserved nucleotide region na may consensus sequence ng GGCCAATCT.
Ang TATA box at CAAT box ay dalawang rehiyon ng mga nucleotide na nakakaimpluwensya sa transkripsyon ng mga eukaryotic genes. Ang mga ito ay mga non-coding na sequence ng DNA na matatagpuan sa itaas ng transcription initiation site. Sa katunayan, matatagpuan ang mga ito sa rehiyon ng regulasyon, na kilala bilang tagataguyod. Ang parehong TATA box at CAAT box ay responsable para sa kahusayan ng transkripsyon. Ang mga ito ay mga pagkakasunud-sunod na pinagkasunduan na hindi nagbago sa buong proseso ng ebolusyon.
Ano ang TATA Box?
Ang TATA box o Goldberg-Hogness box ay isang consensus sequence na matatagpuan sa promoter region ng eukaryotic genes. Ang TATA box ay isang pangunahing elemento ng promoter. Matatagpuan ito ng 25 base pairs upstream ng transcription initiation site. Ito ay pinananatili sa buong proseso ng ebolusyon. Ang consensus sequence ng TATA box ay TATAWAW, kung saan ang W ay alinman sa A o T. Ito ay isang non-coding DNA sequence. Gayunpaman, ang TATA box ay mahalaga para sa transkripsyon ng gene. Ito ang binding site ng TATA-binding protein (TBP) at iba pang transcription factor. Kapag nagbigkis na sila sa TATA box, ang recruitment ng RNA polymerase II at tamang regulasyon ng transkripsyon ay nagaganap sa mga eukaryotic genes.
Figure 01: TATA Box
Dahil ang TATA box ay kasangkot sa regulasyon ng transkripsyon, ang mga mutasyon ng TATA box ay maaaring magresulta sa mga phenotypic na pagbabago na humahantong sa mga sakit tulad ng gastric cancer, spinocerebellar ataxia, Huntington's disease, pagkabulag, β-thalassemia, immunosuppression, Gilbert's syndrome, at HIV-1, atbp.
Ano ang CAAT Box?
Ang CAAT box ay isang rehiyon ng mga nucleotide na may consensus sequence ng GGCCAATCT. Katulad ng TATA box, ang CAAT box ay matatagpuan din sa promoter region ng gene. Samakatuwid, matatagpuan ito ng humigit-kumulang 75-80 base pairs upstream patungo sa transcription site.
Figure 02: CAAT Box
Ang mga partikular na salik ng transkripsyon ay nagbubuklod sa kahon ng CAAT. Ang pagbubuklod na ito ay nagpapatatag sa preinitiation complex para sa mas madaling pagbubuklod ng enzyme RNA polymerase. Gayundin, gumagana ang kahon ng CAAT bilang isang pagkakasunod-sunod ng regulasyon. Ang mga mutasyon sa rehiyon ng CAAT box ay lubos na nakakaapekto sa tugon ng promoter at regulasyon ng transkripsyon.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng TATA at CAAT Box?
- Ang TATA at CAAT ay dalawang rehiyon ng mga nucleotide na matatagpuan sa regulatory sequence ng eukaryotic genes.
- Matatagpuan ang mga ito sa itaas ng agos patungo sa site ng pagsisimula ng transkripsyon.
- Pareho ay consensus DNA sequence.
- Mahalaga ang mga ito para sa regulasyon ng transkripsyon, kaya mga regulatory sequence ang mga ito.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng TATA at CAAT Box?
Ang TATA box ay isang conserved nucleotide region na matatagpuan mga 25-30 base pairs upstream patungo sa transcription initiation site. Sa kabilang banda, ang kahon ng CAAT ay isang conserved na rehiyon ng mga nucleotide na natagpuan tungkol sa 75-80 base pairs upstream patungo sa transcription initiation site. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng TATA at CAAT box. Bukod dito, ang TATA box ay may consensus sequence ng TATAWAW habang ang GGCCAATCT ay ang consensus sequence ng CAAT box.
Higit pa rito, isa pang makabuluhang pagkakaiba sa pagitan ng TATA at CAAT box ay ang TATA box ay nagbibigay ng binding site para sa TBP at transcription factor at nakikilahok sa transcription regulation habang ang CAAT box ay nagse-signal ng binding site para sa RNA transcription factor.
Sa ibaba ng infographic ay nagbubuod ng mga pagkakaiba sa pagitan ng TATA at CAAT box.
Buod – TATA vs CAAT Box
Ang TATA box at CAAT box ay dalawang bahagi ng conserved region ng eukaryotic gene promoters. Matatagpuan ang mga ito sa itaas ng agos patungo sa site ng pagsisimula ng transkripsyon. Parehong nakakaimpluwensya sa transkripsyon ng mga gene sa pamamagitan ng pagbibigay ng mga site para sa pagbubuklod ng mga protina na nagbubuklod ng TATA at mga kadahilanan sa pagsisimula ng transkripsyon. Ang TATA box ay matatagpuan 25-35 base pairs upstream ng transcription initiation site habang ang CAAT box ay matatagpuan 75-80 base pairs upstream sa transcription initiation site. Ang consensus sequence ng TATA box ay TATAWAW habang ang consensus sequence ng CAAT box ay GGCCAATCT. Kaya, ito ang buod ng pagkakaiba sa pagitan ng TATA at CAAT box.
