Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng group I at group II intron ay na sa group I introns, ang splicing reaction ay pinasimulan ng guanosine cofactor, habang sa group II introns, ang splicing reaction ay pinasimulan ng internal adenosine.
Ang Pre-mRNA ay ang pangunahing transcript na may parehong mga intron at exon. Ang pre-mRNA ay dapat ma-convert sa mRNA bago ang pagsasalin. Ang RNA splicing o pre-mRNA splicing ay isa sa mga post-transcriptional modification. Sa RNA splicing, ang mga intron ay tinanggal mula sa pre-mRNA molecule, at ang mga exon ay pinagsama-sama. Ang Group I at Group II introns ay self-splicing introns. Nag-splice sila mula sa pre-mRNA molecule nang walang tulong ng anumang iba pang enzyme. Samakatuwid, ang mga ito ay RNA enzymes o ribozymes na nag-catalyze ng kanilang sariling splicing mula sa pre-mRNA. Bukod dito, mayroon silang kakayahang gumana bilang mga elemento ng mobile. Sa panahon ng splicing, isang serye ng mga trans-esterification na reaksyon ang nagaganap upang ma-excise ang intron at i-ligate ang mga exon. Ang mga ribozyme na ito ay nasa lahat ng tatlong domain, kabilang ang bacteria, archaea at eukaryotes.
Ano ang Group I Introns?
Ang Group I introns ay isang uri ng self-splicing ribozymes na makikita sa bacteria, bacteriophage at eukaryotes (organellar at nuclear genome). Ang mga ito ay matatagpuan sa mahahalagang gene. Nagagawa nilang i-catalyze ang kanilang sariling splicing mula sa pre-mRNA molecule. Ang mga intron ng Group I ay maaaring may ilang daan hanggang tatlong libong nucleotides. Bukod dito, nagpapakita sila ng kaunting pagkakatulad ng pagkakasunud-sunod sa mga organismo.
Figure 01: Group I Introns
Ang mga pangalawang istruktura ay lubos na pinangangalagaan sa apat na maikling rehiyon. Mayroong dalawang mga hakbang sa reaksyon ng transesterification ng splicing. Ang mga intron ng Group I ay nagpapasimula ng mekanismo ng splicing sa pamamagitan ng nucleophilic attack ng 3’ hydroxyl ng isang Guanosine cofactor sa 5P splice site.
Ano ang Group II Introns?
Ang Group II intron ay isang uri ng self-splicing intron na matatagpuan sa mga organismo na kabilang sa lahat ng tatlong domain. Ang mga ito ay ribozymes na catalyze kanilang sariling splicing reaksyon mula sa pre-mRNA. Ang mga ito ay matatagpuan sa rRNA, tRNA at protina-coding genes. Ngunit hindi sila matatagpuan sa mga nuclear genome, hindi tulad ng group I introns.
Figure 02: Group II Introns
Group II introns catalyze splicing sa pamamagitan ng dalawang transesterification step na katulad ng group I introns. Ang mga enzyme na ito ay nagpapasimula ng splicing reaction sa pamamagitan ng nucleophilic attack ng 2′ OH ng branch site adenosine sa 5′ splice junction. Sa panahon ng splicing reactions, ang group II introns ay bumubuo ng isang lariat like structure. Bukod dito, nagaganap ang intron splicing kapag walang GTP.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Group I at Group II Introns?
- Ang Group I at group II intron ay dalawang uri ng RNA enzymes, mga ribozyme na nagpapagana ng sarili nilang splicing sa pamamagitan ng magkakaibang mekanismo.
- Sila ay malalaking ribozymes.
- Parehong matatagpuan sa lahat ng tatlong domain.
- Mga elemento ng mobile ang mga ito.
- Bukod dito, matatagpuan ang mga ito sa rRNA, tRNA at mga gene na nagko-code ng protina.
- Ang parehong mga enzyme ay ginagamit bilang mga tool sa biotechnology at molecular medicine para sa target na gene knock-out/knock-down, gene delivery o gene therapy system.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Group I at Group II Introns?
Ang Group I introns ay mga ribozymes na matatagpuan sa bacteria, bacteriophage at eukaryotic organellar at nuclear genome. Ang Group II introns ay ribozymes na matatagpuan sa bacteria, archaea, at eukaryotic organelles. Bukod dito, ang grupo I introns ay nagpasimula ng splicing reaction sa pamamagitan ng nucleophilic attack ng 3′ hydroxyl ng isang guanosine cofactor sa 5P splice site habang ang group II introns ay nagpapasimula ng splicing reaction sa pamamagitan ng nucleophilic attack ng 2′ OH ng branch site adenosine sa 5′ splice junction. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng group I at group II introns.
Higit pa rito, ang group II introns ay bumubuo ng isang lariat like structure sa panahon ng splicing habang ang group I introns ay hindi bumubuo. Kaya, ito ay isa pang makabuluhang pagkakaiba sa pagitan ng pangkat I at pangkat II na mga intron. Bukod pa rito, ang group I intron ay matatagpuan sa eukaryotic nuclear genome habang ang group II introns ay hindi matatagpuan sa eukaryotic nuclear genome.
Inililista sa ibaba ng infographic ang mga pagkakaiba sa pagitan ng mga intron ng pangkat I at pangkat II sa anyong tabular para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – Group I vs Group II Introns
Ang Group I at II introns ay malalaking ribozyme na nagpapagana ng transesterification reaction upang pagdugtungin ang mga intron mula sa pangunahing transcript. Matatagpuan ang mga ito sa lahat ng tatlong domain. Pareho silang mga mobile genetic na elemento. Bukod dito, ginagamit ang mga ito bilang mga tool sa biotechnology at molecular medicine. Gayunpaman, ang grupong I intron ay nagpasimula ng splicing reaction sa pamamagitan ng nucleophilic attack ng 3′ OH ng isang guanosine cofactor sa 5P splice site. Ngunit, ang pangkat II introns ay nagpasimula ng splicing reaction sa pamamagitan ng nucleophilic attack ng 2′ OH ng branch site adenosine sa 5′ splice junction. Bukod dito, ang mga pangkat II na intron ay bumubuo ng isang istraktura na tulad ng lariat sa panahon ng pag-splice habang ang mga intron ng pangkat I ay hindi bumubuo ng isang istraktura na tulad ng isang lariat. Kaya, ito ang buod ng pagkakaiba sa pagitan ng pangkat I at pangkat II na mga intron.
