Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng mga isoschizomer at neoschizomer ay ang mga isoschizomer ay mga restriction enzyme na may parehong pagkakasunud-sunod ng pagkilala at pinaghiwa-hiwalay ang DNA sa parehong mga posisyon, habang ang mga neoschizomer ay mga restriction enzyme na may parehong pagkakasunud-sunod ng pagkilala ngunit pinuputol ang DNA sa iba't ibang posisyon.
Ang mga restriction enzymes o restriction endonucleases ay mga enzyme na humahati sa DNA sa mga fragment sa o malapit sa mga partikular na lugar ng pagkilala. Pinutol nila ang DNA sa mga lugar ng paghihigpit. Ang mga restriction enzyme ay karaniwang inuuri sa limang grupo batay sa istraktura, kung pinutol nila ang kanilang DNA substrate sa kanilang site ng pagkilala, at kung ang mga site ng pagkilala at cleavage ay hiwalay sa isa't isa. Mahigit sa 3600 restriction endonucleases ang natukoy na. Humigit-kumulang 800 restriction enzymes ang available sa komersyo. Ang isoschizomer at neoschizomer ay dalawang uri ng restriction enzymes batay sa recognition site at cleavage specificity.
Ano ang Isoschizomer?
Ang Isoschizomer ay mga restriction enzymes na may parehong pagkakasunud-sunod ng pagkilala at hinahati ang DNA sa parehong mga posisyon. Ang mga restriction enzymes na ito ay may parehong pagtitiyak. Ang unang natuklasang restriction enzyme na kumikilala sa isang ibinigay na sequence ay kilala bilang isang prototype, habang ang lahat ng kasunod na natukoy na restriction enzymes na kumikilala sa parehong sequence ay tinatawag na isoschizomer. Gayunpaman, maaaring magkaiba ang mga isoschizomer sa mga kagustuhan sa site, kondisyon ng reaksyon, sensitivity ng methylation, at aktibidad ng bituin. Ang mga isoschizomer ay nakahiwalay sa iba't ibang strain ng bacteria. Samakatuwid, maaaring mangailangan sila ng iba't ibang kondisyon ng reaksyon. Sa ilang pagkakataon, isa lang sa isang pares ng isoschizomer ang makakakilala sa parehong methylated at unmethylated na anyo ng mga restriction site. Sa kabilang banda, ang ibang restriction enzyme ay makikilala lamang ang unmethylated form ng restriction site. Ang partikular na tampok na ito ng mga isoschizomer ay tumutulong sa pagtukoy ng estado ng methylation ng lugar ng paghihigpit habang inihihiwalay ito mula sa isang bacterial state.
Halimbawa, kinikilala at pinuputol ng AgeI at BshT1 ang 5’-A↓CCGGT sa parehong pattern. Ang HpaII at MSPI ay iba pang mga pares ng isoschizomer. Pareho nilang kinikilala ang pagkakasunud-sunod na 5'-C↓CGG-3' kapag ito ay unmethylated. Ngunit kapag na-methylated ang pangalawang C ng sequence, ang MSPI lang ang makakakilala sa sequence na ito habang hindi ito makikilala ng HpaII.
Ano ang mga Neoschizomer?
Ang Neoschizomer ay mga restriction enzyme na may parehong pagkakasunud-sunod ng pagkilala ngunit pinuputol ang DNA sa iba't ibang posisyon. Sa ilang espesyal na molecular biological application, ito ay isang napaka-kapaki-pakinabang na tampok. Ang mga neoschizomer ay isang subset ng mga isoschizomer. Ang mga kilalang halimbawa para sa mga neoschizomer ay ang SmaI (5'-CCC↓GGG-3') at XmaI (5'-C↓CCGGG-3'); parehong kinikilala ang 5'-CCCGGG-3' sequence ngunit hinahati ang mga ito sa ibang posisyon. Kaya, ang dalawang restriction enzymes na ito ay bumubuo ng iba't ibang uri ng mga dulo. Sa kasong ito, ang SmaI ay gumagawa ng mga blunt na dulo, at ang XmaI ay gumagawa ng 5' na nakausli na dulo.
Figure 01: Neoschizomer
Ang isa pang halimbawa ay ang MaeII at Tail restriction enzymes pair. Ang Prototype MaeII (A↓CGT) ay gumagawa ng mga fragment ng DNA na may 2-base 5'extension, at ang neoschizomer Tail (ACGT↓) ay gumagawa ng mga fragment ng DNA na may 4-base3' extension.
Ano ang Pagkakatulad sa Pagitan ng Isoschizomer at Neoschizomer?
- Isoschizomer at neoschizomer ay dalawang uri ng restriction enzymes.
- Ang mga ito ay higit na matatagpuan sa mga prokaryote.
- Bahagi sila ng restriction-modification (RM) system na matatagpuan sa bacteria at archaea.
- Parehong mga molekula ng protina.
- Parehong hinahati ang DNA sa mga fragment.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Isoschizomer at Neoschizomer?
Ang Isoschizomer ay mga restriction enzymes na may parehong pagkakasunud-sunod ng pagkilala at hinahati ang DNA sa parehong mga posisyon, habang ang mga neoschizomer ay mga restriction enzyme na may parehong pagkakasunud-sunod ng pagkilala ngunit hinahati ang DNA sa magkaibang posisyon. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng mga isoschizomer at neoschizomer. Higit pa rito, ang mga isoschizomer ay may parehong mga detalye habang ang mga neoschizomer ay may iba't ibang mga detalye.
Inililista ng sumusunod na infographic ang mga pagkakaiba sa pagitan ng isoschizomer at neoschizomer sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – Isoschizomers vs Neoschizomers
Restriction enzymes ay DNA cutting enzymes. Ang mga ito ay tinatawag ding molecular scissors. Mayroong iba't ibang uri ng restriction enzymes. Batay sa site ng pagkilala at sa pagtitiyak ng cleavage, ang mga restriction enzyme ay dalawang uri bilang isoschizomer at neoschizomer. Ang mga isoschizomer ay may parehong pagkakasunud-sunod ng pagkilala at pinuputol ang DNA sa parehong mga posisyon habang ang mga neoschizomer ay may parehong pagkakasunud-sunod ng pagkilala ngunit pinuputol ang DNA sa iba't ibang mga posisyon. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng mga isoschizomer at neoschizomer.
