Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng mga isoschizomer at isocaudomer ay ang mga isoschizomer ay kinikilala at pinuputol ang parehong restriction o recognition site habang ang mga isocaudomer ay kumikilala ng bahagyang magkaibang mga restriction site at humihiwalay sa parehong site.
Ang mga restriction enzymes o restriction endonucleases ay isang uri ng mga nucleases na pumuputol sa double-stranded na DNA. Nagagawa nilang makilala ang mga partikular na sequence na tinatawag na mga restriction site, na palindromic ang pinagmulan. Ang mga bakterya ay gumagawa ng mga restriction enzymes laban sa mga dayuhang pathogen, lalo na laban sa mga virus. Ito ay isang paraan ng mekanismo ng pagtatanggol na ipinapakita ng bakterya. Depende sa istraktura ng enzyme at likas na katangian ng mga hiwa, mayroong tatlong uri ng mga restriction enzyme bilang mga type I restriction enzymes, type II restriction enzymes, at type II restriction enzymes. Bukod dito, depende sa aktibidad ng biochemical at pinagmumulan ng paghihiwalay, mayroong tatlong uri ng restriction enzymes bilang isoschizomer, neoschizomer, at isocaudomer.
Ano ang Isoschizomer?
Ang Isoschizomer ay isang uri ng restriction enzyme na nagmumula sa iba't ibang pinagmulan ngunit kinikilala at pinuputol ang parehong restriction site sa DNA. Samakatuwid, ang dalawang isoschizomer ay may parehong site ng pagkilala. Nag-cleave sila sa parehong site, kaya partikular sila sa parehong pagkakasunud-sunod ng pagkilala. Halimbawa, ang mga restriction enzymes na SphI at BbuI ay dalawang isoschizomer na kumikilala at humihiwalay sa CGTAC/G.
Figure 01: Restriction Enzyme
Ang isa pang pares ng isoschizomer ay HpaII at MspI. Pareho nilang kinikilala ang pagkakasunud-sunod na 5′-CCGG-3′ at pinutol ang DNA. Bukod dito, ang Bsp EI at Acc III ay mga isoschizomer din na mula sa isang species ng Bacillus at Acinetobacter calcoaceticus, ayon sa pagkakabanggit. Ang paghihiwalay ng mga isoschizomer ay maaaring gawin mula sa iba't ibang bakterya. Dahil ang mga ito ay nagmula sa iba't ibang bacteria, ang kanilang mga kundisyon sa paghihigpit ay maaaring iba sa isa't isa.
Ano ang Isocaudomer?
Ang Isocaudomer ay isang uri ng restriction enzyme na kumikilala ng bahagyang magkakaibang pagkakasunud-sunod, ngunit sila ay dumidikit sa parehong site upang makagawa ng parehong mga dulo. Ang mga isocaudomer ay nagmula rin sa iba't ibang bakterya. Ang Sau3a at BamHI ay isang pares ng isocaudomer. Gumagawa sila ng 5'-GATC-3' na malagkit na dulo pagkatapos ng cleavage ng parehong site. Ang isa pang pares ng isocaudomer ay ang NcoI mula sa Nocardia corallina at PagI mula sa Pseudomonas alcaligenes. Ang dalawang enzyme na ito ay nagbubuklod din sa magkakaibang pagkakasunud-sunod ng pagkilala ngunit pinuputol sa parehong lugar at gumagawa ng parehong malagkit na dulo. Samakatuwid, ang paggawa ng mga dulo ng pagputol ay magkatugma sa isa't isa, at maaari silang itali sa isa't isa. Ang XhoI, PspXI at SalI ay mga isocaudomer din.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Isoschizomer at Isocaudomer?
- Isoschizomer at isocaudomer ay dalawang uri ng restriction enzymes.
- Dalawang isoschizomer ang may parehong digestion site, katulad ng dalawang isocaudomer na may parehong digestion site.
- Prokaryotic ang pinagmulan nila.
- Parehong may restriction recognition site pati na rin ang digestion site.
- Nagbubunga sila ng mga dulo na magkatugma sa isa't isa.
- Bukod dito, ang mga enzyme na ito ay mga kapaki-pakinabang na tool sa recombinant DNA technology.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Isoschizomer at Isocaudomer?
Ang Isoschizomer ay mga restriction enzymes na kumikilala sa parehong DNA sequence at nag-cleave sa parehong restriction site, habang ang isocaudomer ay mga restriction enzymes na kumikilala ng bahagyang magkakaibang DNA sequence ngunit gumagawa ng parehong sticky ends sa pamamagitan ng pagputol sa parehong site. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng mga isoschizomer at isocaudomer.
Itinatala ng infographic sa ibaba ang pagkakaiba sa pagitan ng isoschizomer at isocaudomer.
Buod – Isoschizomers vs Isocaudomers
Ang Isoschizomer ay mga restriction enzymes na kumikilala sa parehong pagkakasunud-sunod ng DNA at nag-cleave sa parehong site. Sa kabilang banda, ang mga isocaudomer ay mga restriction enzymes na kinikilala ang bahagyang magkakaibang mga pagkakasunud-sunod at nag-cleave sa parehong site na gumagawa ng parehong mga dulo. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng mga isoschizomer at isocaudomer. Ang SphI, BbuI, HpaII at MspI ay ilang halimbawa ng isoschizomer habang ang Sau3a at BamHI ay dalawang halimbawa ng isocaudomer. Ang parehong isoschizomer at isocaudomer ay natural na ginawa ng bacteria.