Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng aktibong site at binding site ay ang aktibong site ay tumutulong sa catalysis ng isang kemikal na reaksyon samantalang ang isang binding site ay tumutulong sa pagbubuklod ng isang ligand sa isang malaking molekula.
Ang binding site ay isang rehiyon sa isang protina, DNA o RNA, kung saan maaaring magbigkis ang isang ligand. Ang mga enzyme ay mga protina. Ang isang aktibong site ay isang rehiyon sa isang enzyme kung saan ang mga substrate ay maaaring magbigkis upang sumailalim sa isang kemikal na reaksyon. Ang partikular na rehiyon na ito ay mayroon ding binding site kasama ng isang catalytic site. Samakatuwid, ang mga nagbibigkis na site ay tumutulong lamang sa pagbubuklod ng isang ligand sa isang malaking molekula samantalang ang mga aktibong site ay tumutulong sa parehong pagbigkis ng isang ligand sa isang malaking molekula habang hinahayaan itong sumailalim sa isang catalyzed na reaksyong kemikal.
Ano ang Active Site?
Ang aktibong site ay isang rehiyon sa isang enzyme kung saan ang mga substrate ng isang kemikal na reaksyon ay nagbubuklod upang sumailalim sa isang catalyzed na kemikal na reaksyon. ang rehiyong ito ay binubuo ng dalawang sub-rehiyon bilang isang binding site at catalytic site. Ang binding site ay naglalaman ng ilang residues na makakatulong sa pagbubuklod ng substrate (reactants) sa enzyme. Ang catalytic site ay tumutulong sa catalyzing ng kemikal na reaksyon. Bukod dito, ang rehiyong ito ay napakaliit kung ihahambing sa buong dami ng enzyme; humigit-kumulang 10-20% ng buong dami ng enzyme.
Figure 01: Ang Binding Site at Catalytic Site ng isang Aktibong Site
Karaniwan, ang aktibong site ay naglalaman ng 3-4 amino acid. ang natitirang mga amino acid sa enzyme na kasangkot sa pagpapanatili ng tertiary na istraktura ng enzyme. Higit sa lahat, ang isang aktibong site ay may partikular na disenyo na maaaring magkasya sa isang partikular na substrate. Samakatuwid, ang mga enzyme na ito ay tumutugon sa mga partikular na substrate lamang. Ngunit kung minsan, ang mga enzyme ay nangangailangan ng mga cofactor para sa kanilang paggana. Ang pangunahing pag-andar ng aktibong site ay upang bawasan ang activation energy ng isang kemikal na reaksyon, sa gayon, upang mapataas ang rate ng reaksyon.
Ano ang Binding Site?
Ang Binding site ay isang rehiyon sa isang protina, DNA o RNA kung saan maaaring magbigkis ang mga ligand. Doon, ang ligand ay maaaring bumuo ng isang kemikal na bono sa site na ito. Ang mga rehiyong ito ay nagpapakita ng pagtitiyak; ang isang partikular na ligand ay magbubuklod sa isang partikular na lugar na nagbubuklod. Samakatuwid, ang site na ito ay isang sukatan ng mga uri ng ligand na maaaring magbigkis sa isang molekula.
Higit pa rito, madalas naming ginagamit ang mga rehiyong ito para sa functional characterization ng biomolecules. Halimbawa, mailalarawan natin ang functionality ng isang aktibong site sa pamamagitan ng umiiral na site nito. Bukod dito, sa kaso ng DNA, ang tiyak na uri ng binding site ay ang transcription factor binding site na naroroon sa DNA.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Active Site at Binding Site?
Ang aktibong site ay isang rehiyon sa isang enzyme kung saan ang mga substrate ng isang kemikal na reaksyon ay nagbubuklod upang sumailalim sa isang catalyzed na kemikal na reaksyon samantalang ang binding site ay isang rehiyon sa isang protina, DNA o RNA, kung saan ang mga ligand ay maaaring magbigkis. Ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng aktibong site at nagbubuklod na site. Bukod dito, ang mga aktibong site ay naroroon sa mga enzyme, at nakakatulong sila upang mapataas ang rate ng reaksyon ng isang partikular na reaksyong kemikal sa pamamagitan ng pagpapababa ng activation energy barrier ng reaksyong iyon. Ang mga nagbubuklod na site, sa kabilang banda, ay responsable para sa pagbubuklod ng isang partikular na ligand na may partikular na molekula.
Ang infographic sa ibaba ay nagpapakita ng pagkakaiba sa pagitan ng aktibong site at binding site sa tabular form.
Buod – Aktibong Site vs Nagbubuklod na Site
Ang mga aktibong site ay mga rehiyon sa mga enzyme na maaaring tumaas ang rate ng reaksyon ng isang kemikal na reaksyon sa pamamagitan ng pagbabawas sa activation energy barrier ng reaksyong iyon. Ang binding site ay anumang rehiyon kung saan maaaring magbigkis ang ligand. Ang aktibong site ay naglalaman din ng isang umiiral na site. Ang pagkakaiba sa pagitan ng aktibong site at mga umiiral na site ay nakasalalay sa pagkakaroon at pagpapagana. Samakatuwid, ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng aktibong site at binding site ay ang aktibong site ay tumutulong sa catalysis ng isang kemikal na reaksyon samantalang ang isang binding site ay tumutulong sa pagbubuklod ng isang ligand sa isang malaking molekula.