Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng CDS at cDNA ay ang CDS o coding sequence ay bahagi ng isang transcript na aktwal na isinalin sa protina habang ang cDNA sequence ay isang DNA sequence na hinango mula sa mRNA sa pamamagitan ng reverse transcription.
Ang gene ay isang nucleotide sequence na nagko-code para sa isang protina. Binubuo ito ng iba't ibang rehiyon bilang promoter region, transcription initiation site, exon, start codon, introns at stop codon. Samakatuwid, ang isang gene ay may parehong coding at noncoding sequence. Ang mga pagkakasunud-sunod ng coding o CDS ay tumutukoy sa mga exon at dalawang codon, na kung saan ay start codon at stop codon. Ito ay ang pagkakasunud-sunod na aktwal na isinalin sa isang protina. Sa kabaligtaran, ang cDNA ay isang DNA sequence na nagmula sa mRNA sa pamamagitan ng reverse transcription.
Ano ang CDS?
Ang CDS o coding sequence ay isang bahagi ng isang gene na aktwal na isinalin sa isang protina. Binubuo ito ng mga exon at dalawang codon bilang AUG codon at stop codon. Hindi tulad ng cDNA, ang CDS ay hindi naglalaman ng dalawang hindi na-translate na rehiyon: 5’ UTR at 3” UTR. Bukod dito, ang mga intron ay hindi kasama sa CDS.
Figure 01: Coding Sequence
Kung ihahambing sa buong genome at isang indibidwal, ang coding sequence ay isang maliit na bahagi. Binubuo ang coding sequence ng kinakailangang nucleotide sequence para gawin ang amino acid sequence ng protina.
Ano ang cDNA?
Ang cDNA o complementary DNA ay isang DNA sequence na nabuo mula sa mRNA sequence. Ito ay na-synthesize ng prosesong tinatawag na reverse transcription. Ang enzyme reverse transcriptase ay nag-catalyze ng cDNA synthesis, at ang pagkakasunud-sunod ng mRNA ay nagsisilbing template para sa cDNA synthesis. Karaniwan, ang mRNA ng mga eukaryotic cell ay maaaring makuha at linisin upang makagawa ng cDNA. Pagkatapos makabuo ng cDNA mula sa mRNA, maaari silang mai-clone sa isang bacterial cell upang makagawa ng mga aklatan ng cDNA. Mahalaga ang mga library ng cDNA para sa pagsusuri ng mga rehiyon ng coding, mga function ng gene at pagpapahayag ng mga gene, atbp.
Figure 02: cDNA
Hindi tulad ng coding sequence, ang cDNA ay naglalaman ng dalawang UTR, na 3’ UTR at 5’ UTR. Katulad ng coding sequence, ang cDNA ay hindi naglalaman ng mga intron.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng CDS at cDNA?
- Ang CDS at cDNA ay mga nucleic acid.
- Gawa sila mula sa deoxyribonucleotides.
- Ang parehong CDS at CDNA ay hindi naglalaman ng mga intron, na mga noncoding na rehiyon.
- Parehong naglalaman ng genetic code o impormasyon upang makagawa ng protina.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng CDS at cDNA?
Ang CDS o coding sequence ay ang bahagi ng isang gene na aktwal na isinalin sa isang protina. Sa kabilang banda, ang pagkakasunud-sunod ng cDNA ay isang pagkakasunud-sunod ng DNA na nagmula sa mRNA sa pamamagitan ng reverse transcription. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng CDS at cDNA. Bukod pa rito, ang CDS ay binubuo ng mga exon at dalawang codon, na kung saan ay start codon at stop codon. Sa kabaligtaran, ang cDNA ay binubuo ng kumpletong mRNA sequence at dalawang UTR.
Bukod dito, artipisyal na ginagawa ang cDNA synthesis mula sa mRNA sa pamamagitan ng reverse transcription habang ang CDS ay matatagpuan sa genomic DNA.
Sa ibaba ng infographic ay nagpapakita ng higit pang mga paghahambing upang makita ang pagkakaiba sa pagitan ng CDS at cDNA.
Buod – CDS vs cDNA
Ang Coding sequence at cDNA ay dalawang uri ng nucleotide sequence. Ang pagkakasunud-sunod ng coding ay nasa loob ng isang gene habang ang cDNA ay artipisyal na na-synthesize. Ang pagkakasunud-sunod ng coding ay may mga exon at dalawang codon habang ang cDNA ay may pagkakasunud-sunod ng mRNA at dalawang UTR. Ang parehong CDS at cDNA ay mayroon lamang mga nucleotide sequence na aktwal na isinasalin sa isang protina. Hindi sila naglalaman ng mga intron. Hindi tulad ng CDS, ang proseso ng synthesis ng cDNA ay nangangailangan ng reverse transcriptase enzyme. Gayundin, maaaring mag-convert ang cDNA sa mga aklatan ng cDNA. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng CDS at cDNA.
