Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng nakatiklop at naka-unfold na protina ay ang nakatiklop na protina ay isang biologically active na istraktura habang ang naka-unfold na protina ay isang biologically inactive na istraktura.
Translation ay gumagawa ng linear chain ng amino acid sequence na hindi nagtataglay ng stable na 3D structure. Samakatuwid, ang mga sequence ng amino acid ay nakikipag-ugnayan sa isa't isa at nakatiklop sa pamamagitan ng isang kumplikadong proseso na tinatawag na protein folding. Ito ay isang mahalagang proseso na ginagawang biologically active ang isang protina. Ang tamang katutubong istraktura ng isang protina ay napakahalaga para sa paggana nito. Ang mga polypeptide chain ay nakatiklop upang maging isang biologically active na protina sa 3D na istraktura nito. Ang mga nakatiklop na protina ay pinagsasama-sama ng iba't ibang molekular na pakikipag-ugnayan. Mayroon silang matatag na 3D na istraktura; samakatuwid, ang mga ito ay biologically active, hindi tulad ng mga unfolded protein.
Ano ang Folded Protein?
Ang folded protein ay isang biologically active protein na nakamit ang matatag nitong 3D na istraktura. Ang pagtitiklop ng protina ay ang proseso na nagreresulta sa mga nakatiklop na protina, at nangyayari ito sa endoplasmic reticulum. Ang proseso ng pagtitiklop ng protina ay thermodynamically paborable. Ito ay nangyayari bilang isang kusang reaksyon. Ang unang hakbang ng pagtitiklop ng protina ay ang pagbuo ng mga pangalawang istruktura tulad ng mga alpha helice o beta sheet mula sa pangunahing istraktura ng isang protina. Ang mga pangalawang istruktura ay nagbibigay daan sa mga istrukturang tersiyaryo. Ang mga α-helice at β-sheet ay nakatiklop sa isang three-dimensional na istraktura. Ang mga tertiary na istruktura ay higit pang tumiklop at bumubuo ng quaternary na istraktura ng isang protina.
Maraming salik ang nakakaimpluwensya sa kakayahan ng mga protina na matiklop sa mga tamang functional form ng mga ito. Ang ilan sa mga salik ay ang mga electric at magnetic field, temperatura, pH, mga kemikal, limitasyon sa espasyo at molecular crowding. Ang maling pagtitiklop ay maaaring humantong sa iba't ibang kondisyon ng sakit. Ang Alzheimer's disease at Cystic fibrosis ay dalawang karaniwang sakit na dulot ng maling pagkalat ng protina.
Figure 01: Protein Folding
Sa panahon ng pagtitiklop, nakikipag-ugnayan ang mga polypeptide chain sa pamamagitan ng covalent at noncovalent na pakikipag-ugnayan. Ang mga hydrophobic na pakikipag-ugnayan at mga pakikipag-ugnayan ng van der Waals ay dalawang uri ng mga noncovalent na pakikipag-ugnayan na tumutulong sa pagtitiklop ng protina. Ang mga noncovalent na pakikipag-ugnayan ay mahina at maikling mga pakikipag-ugnayan. Gayunpaman, nagbibigay sila ng mga pangunahing puwersa sa pagmamaneho. Ang mga covalent na pakikipag-ugnayan tulad ng disulfide bond at ionic bond ay nakakatulong din sa pagtitiklop ng protina, at sila ay malakas na pakikipag-ugnayan. Nagaganap ang pagtitiklop ng protina sa isang may tubig na kapaligiran.
Ano ang Unfolded Protein?
Ang Unfolded protein ay isang linear na amino acid sequence. Ito ay umiiral sa pangunahing istraktura, na isang polypeptide chain. Ang mga hindi nakatiklop na protina ay biologically inactive. Bukod dito, ito ay isang hindi maayos na bukas na istraktura na may maluwag na nakaimpake na mga side chain. Sa madaling salita, ang mga nakabukas na protina ay kulang sa isang nakaayos na istraktura. Ang mga hindi nakatiklop na protina ay nakakatulong sa patolohiya ng maraming sakit.
Figure 02: Unfolded Protein Response
Upang maging isang functional na protina, ang mga naka-unfold na protina ay dapat na nakatiklop sa stable na three-dimensional na mga conform. Sa maraming mga kaso, maraming polypeptide chain ang dapat mag-assemble sa isang functional complex. Bilang karagdagan sa na, karamihan sa mga protina ay sumasailalim sa mga pagbabago tulad ng cleavage o covalent attachment na may carbohydrates at lipids.
Ano ang Pagkakatulad sa Pagitan ng Nakatupi at Naka-unfold na Protein?
- Ang matinding temperatura, matinding pH, mga puwersang mekanikal, at mga kemikal na denaturant ay maaaring magtago ng nakatiklop na protina sa isang nakabukang protina.
- Ang denaturation ng mga protina ay isang proseso ng paglipat mula sa nakatiklop patungo sa nakabukang estado.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Nakatupi at Naka-unfold na Protein?
Ang folded protein ay isang ordered, globular protein na may mahigpit na nakaimpake na hydrophobic core habang ang unfolded protein ay isang hindi maayos at bukas na istraktura na may maluwag na naka-pack na mga side chain. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng nakatiklop at nakabukas na protina. Higit pa rito, ang mga nakatiklop na protina ay biologically active at gumagana nang tama, habang ang mga unfolded na protina ay biologically inactive at hindi gumagana nang tama.
Sa ibaba ng infographic ay nagpapakita ng isang detalyadong paghahambing ng parehong mga protina upang malinaw na makita ang pagkakaiba sa pagitan ng nakatiklop at nakabukang protina.
Buod – Nakatupi vs Unfolded Protein
Sa pangkalahatan, ang mga protina ay dapat na nakatiklop nang tama sa mga tiyak, matatag, tatlong-dimensional na mga konpormasyon upang gumana nang tama. Ang mga hindi nakatiklop na protina ay biologically inactive habang ang mga nakatiklop na protina ay biologically active. Ang mga naka-fold na protina ay may 3D na istraktura habang ang mga naka-unfold na protina ay hindi maayos, bukas na mga istraktura na may maluwag na naka-pack na mga side chain. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng nakatiklop at nakabukas na protina.
