Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng serine at tyrosine recombinase ay na sa serine recombinase, ang serine ay ang nucleophilic amino acid na ginagamit ng enzyme para atakehin ang DNA sa panahon ng recombination na partikular sa site, habang sa tyrosine recombinase, ang tyrosine ay ang nucleophilic amino acid na ginamit. ng enzyme para atakehin ang DNA sa panahon ng recombination na partikular sa site.
Ang Site-specific recombination (conservative site-specific recombination) ay isang uri ng genetic recombination technique kung saan nagaganap ang DNA strand exchange sa pagitan ng mga segment na may partikular na antas ng sequence homology. Kinokontrol ng mga recombinase na partikular sa site ang proseso ng recombination na tukoy sa site. Ang mga enzyme na ito ay nakapangkat sa dalawang pamilya bilang pamilya ng serine recombinase at pamilya ng tyrosine recombinase. Ang mga pangalan ay nagmula sa conserved nucleophilic amino acid residue na nasa itaas ng dalawang klase ng recombinases na ginagamit para atakehin ang DNA at nagiging covalently linked dito sa panahon ng strand exchange sa site-specific recombination.
Ano ang Serine Recombinase?
Sa paraan ng recombination na tukoy sa site, dalawang maiikling DNA sequence ('target na mga site') ang pinuputol sa mga partikular na punto sa magkabilang strand, at ang mga dulo ng cut ay muling pinagsama sa mga bagong partner. Ang mga teknolohiya ng recombination na tukoy sa site ay mga genomic na tool sa genetic engineering na umaasa sa mga recombinase enzyme upang palitan ang target na seksyon ng DNA. Maraming mga site-specific na recombination system ang natagpuan upang maisagawa ang mga pagbabagong ito ng DNA para sa iba't ibang layunin. Ngunit ang lahat ng mga recombinase enzyme na ito ay nabibilang sa dalawang pamilya. Ang Serine recombinase ay isa sa kanila. Maaari silang mamagitan hanggang sa tatlong uri ng muling pagsasaayos ng DNA: pagsasama, pagtanggal at pagbabaligtad.
Figure 01: Serine Recombinase
Ang mga recombinase na partikular sa site tulad ng serine recombinase ay nagsasagawa ng muling pagsasaayos ng DNA sa pamamagitan ng pagkilala at pagbubuklod sa isang maikling DNA sequence (target na site), kung saan hinihiwa nila ang DNA backbone. Nang maglaon, ang pagpapalitan ng dalawang DNA helice ay nangyayari at ang muling pagsasanib ng mga DNA strands ay nagaganap. Sa serine recombinase, ang serine ay ang amino acid na ginagamit ng enzyme para atakehin ang DNA sa panahon ng recombination na partikular sa site. Sa panahon ng cleavage ng DNA, ang protina-DNA bond ay nabuo sa pamamagitan ng isang transesterification reaction. Ang phosphodiester bond ay pinapalitan ng phosphoserine bond sa pagitan ng 5'phosphate group sa cleavage site at ng hydroxyl group ng isang conserved serine residue. Ang bagong bono ay nag-iimbak ng enerhiya na gumugugol sa pag-clear ng DNA sa target na lugar. Ang enerhiya na ito ay ginamit sa ibang pagkakataon para sa muling pagsasama ng DNA sa katumbas na deoxyribose hydroxyl group sa kabilang site. Ang mga halimbawa ng serine recombinases ay serine resolvases/invertases at serine integrases.
Ano ang Tyrosine Recombinase?
Ang Tyrosine recombinase ay ang iba pang klase ng enzyme na kumokontrol sa konserbatibong recombination na tukoy sa site. Tulad ng inilarawan dati, ang tyrosine recombinase ay nagsasagawa rin ng muling pagsasaayos ng DNA sa parehong paraan sa pamamagitan ng pagkilala at pagbubuklod sa isang maikling DNA sequence (target na site), kung saan sila ay nag-cleave ng DNA backbone. Mamaya, ang pagpapalitan ng dalawang DNA helice at muling pagsasama ng mga DNA strand ay magaganap.
Figure 02: Tyrosine Recombinase
Ngunit sa tyrosine recombinase, ang tyrosine ay ang amino acid na ginagamit ng enzyme para atakehin ang DNA sa panahon ng recombination na partikular sa site. Ang karaniwang tampok ng klase na ito ay isang conserved nucleophilic tyrosine residue na umaatake sa scissile DNA-phosphate upang bumuo ng isang 3′-phosphotyrosine linkage. Ang Tyrosine recombinases (A1) at tyrosine integrases (A2) ay ang mga kilalang grupo ng enzymes sa tyrosine recombinase enzyme family.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Serine at Tyrosine Recombinase?
- Sila ay isang klase ng recombinase enzymes.
- Parehong kinokontrol ang recombination na tukoy sa site.
- Mga protina sila.
- Ang pangunahing kemikal na reaksyon ay pareho para sa pareho.
- Parehong nagpapagana ng mga reaksyon ng transesterification.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Serine at Tyrosine Recombinase?
Sa serine recombinase, ang serine ay ang nucleophilic amino acid na ginagamit ng enzyme para atakehin ang DNA sa panahon ng recombination na partikular sa site. Sa kabilang banda, sa tyrosine recombinase, ang tyrosine ay ang nucleophilic amino acid na ginagamit ng enzyme para atakehin ang DNA sa panahon ng recombination na partikular sa site. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng serine at tyrosine recombinase. Ang karaniwang katangian ng serine recombinase ay ang pagbuo nito ng phosphoserine bond sa DNA, habang ang tyrosine recombinase ay bumubuo ng phosphotyrosine bond sa DNA sa panahon ng proseso ng recombination na partikular sa site.
Inililista ng infographic sa ibaba ang mga pagkakaiba sa pagitan ng serine at tyrosine recombinase sa tabular form.
-
Pagkakaiba sa pagitan ng Serine at Tyrosine Recombinase sa Tabular Form
Buod – Serine vs Tyrosine Recombinase
Maaaring maganap ang recombination sa pagitan ng magkatulad na molecule ng DNA tulad ng sa homologues recombination o dissimilar molecules gaya sa non-homologues recombination. Ang recombination na tukoy sa site ay isang uri ng genetic recombination kung saan nagaganap ang pagpapalitan ng strand ng DNA sa pagitan ng mga segment na may hindi bababa sa isang partikular na antas ng sequence homology. Ito ay catalysed sa pamamagitan ng recombinases. Karamihan sa mga recombinase ay nakapangkat sa dalawang pamilya: serine recombinase at tyrosine recombinase. Gumagamit ang Serine recombinase ng serine bilang nucleophilic amino acid upang atakehin ang DNA sa panahon ng proseso ng recombination na partikular sa site. Gumagamit ang Tyrosine recombinase ng tyrosine bilang nucleophilic amino acid upang atakehin ang DNA sa panahon ng proseso ng recombination na partikular sa site. Samakatuwid, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng serine at tyrosine recombinase.
