Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng cis at trans splicing ay ang cis splicing ay isang intramolecular na mekanismo na nag-aalis ng mga intron at nagsasama sa mga exon na nasa loob ng parehong RNA transcript, habang ang trans-splicing ay isang intermolecular na mekanismo na nag-aalis ng mga intron o outron at sumasali sa mga exon na wala sa parehong RNA transcript.
Ang RNA splicing ay isang paraan ng pagproseso ng RNA bago ang synthesis ng protina. Sa prosesong ito, ang isang bagong ginawang pre-messenger RNA transcript ay binago sa isang mature na messenger RNA. Tumutulong ang mature messenger RNA na makagawa ng molekula ng protina. Sa panahon ng RNA splicing, ang mga intron (non-coding region) ay aalisin, at ang mga exon (coding regions) ay pinagsama-sama upang makagawa ng mature na mRNA. Ang Cis at trans splicing ay dalawang uri ng RNA splicing mechanism.
Ano ang Cis Splicing?
Ang Cis splicing ay isang intramolecular mechanism na nag-aalis ng mga intron at nagsasama sa mga exon na nasa loob ng parehong RNA transcript. Ang normal na cis splicing ay nagpoproseso ng isang molekula ng RNA. Ang Cis splicing ay ang tipikal na proseso ng splicing ng pre mRNA na isinasagawa ng spliceosomes. Sa intron, ang isang donor site (5' dulo ng intron), isang branch site (malapit sa 3' dulo ng intron) at isang acceptor site (3' dulo ng intron) ay lubos na mahalaga para sa splicing. Ang splice donor site ay may kasamang invariant sequence na GU sa 5’ dulo ng intron. Ang site ng splice acceptor sa 3’ dulo ng intron ay may invariant AG sequence. Upstream mula sa AG sequence, mayroong isang rehiyon na tinatawag na pyrimidine region (polypyrimidine tract). Karagdagang upstream mula sa polypyrimidine tract, mayroong isang branch point na kinabibilangan ng adenosine nucleotide. Ang nucleotide na ito ay kasangkot sa pagbuo ng lariat.
Figure 01: Cis at Trans Splicing
Ang mga pangunahing spliceosomes ay U1, U2, U4, U5 at U6. Kabilang sa mga ito, ang U1 at U2 ay napakahalaga. Sa cis splicing, ang U1 ay nagbubuklod sa 5' splice site, at ang U2 ay nagbubuklod sa branch point na malapit sa 3' splice site. Ang U5/U4/U6 ay nagbibigkis ng mga exon sa 5’ site, na may U6 na nagbubuklod sa U2. Mamaya, inilabas ang U1. Ang U5 ay lumilipat mula sa exon patungo sa intron, at ang U6 ay nagbubuklod sa 5' splice site. Higit pa rito, inilabas din ang U4. U6/U2 catalyzes transesterification, ginagawa ang 5' dulo ng intron ligate sa A nucleotide sa intron. Nag-trigger ito ng lariat formation. Sa pagbuo ng isang lariat, ang U5 ay nagbibigkis ng exon sa 3' splice site, at ang 5' site ay nahati. Sa huling yugto ng pag-splice, ang U2/U5/U6 ay mananatiling nakatali sa lariat, at ang 3’ site ay na-cleaved. Bilang karagdagan sa iyon, ang mga exon ay pinagsama gamit ang ATP hydrolysis sa yugtong ito.
Ano ang Trans Splicing?
Ang Trans splicing ay isang intermolecular na mekanismo na nag-aalis ng mga intron o outron at pinagsasama ang mga exon na wala sa parehong RNA transcript. Sa trans-splicing, walang 5' splice site sa pre mRNA molecule para magbigkis ang U1 protein. Sa halip, ang naka-cap na splice leader (SL) na RNA ay ini-trans-spliced sa sequence sa outron.
Figure 02: Trans Splicing
Ang Outron ay isang rehiyon ng pre mRNA sa pagitan ng 5’ cap at ng trans splice site. Gayunpaman, kadalasang nagbubuklod ang U2 protein sa 3' splice site. Pagkatapos tanggalin ang outron, ang splice leader (SL) exon ay pinagdugtong sa unang exon sa pre mRNA. Higit pa rito, ang trans-splicing ay isang mekanismo na sinusunod sa ilang mga microorganism tulad ng mga protista ng klase ng Kinetoplastae upang ipahayag ang mga gene.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Cis at Trans Splicing?
- Cis at trans splicing ay dalawang uri ng RNA splicing mechanism.
- Sa parehong mekanismo, inalis ang mga intron.
- Gayundin, sa parehong mekanismo, pinagsasama ang mga exon upang bumuo ng mature na mRNA.
- Ang parehong mekanismo ay matatagpuan sa mga eukaryote.
- Wala ang mga mekanismong ito sa mga prokaryote.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Cis at Trans Splicing?
Ang Cis splicing ay isang intramolecular na mekanismo na nag-aalis ng mga intron at nagsasama sa mga exon na nasa loob ng parehong RNA transcript, habang ang trans-splicing ay isang intermolecular na mekanismo na nag-aalis ng mga intron o outron at nagsasama sa mga exon na wala sa parehong RNA transcript. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng cis at trans splicing. Higit pa rito, sa cis splicing, ang mga intron ay inalis upang bumuo ng mature na mRNA. Sa kabilang banda, sa trans splicing introns o outrons ay inalis upang bumuo ng mature mRNA.
Inililista ng sumusunod na infographic ang mga pagkakaiba sa pagitan ng cis at trans splicing sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – Cis vs Trans Splicing
Ang RNA splicing ay isang paraan ng pagproseso ng RNA bago ang proseso ng synthesis ng protina. Ang Cis at trans splicing ay dalawang uri ng mga mekanismo ng RNA splicing na matatagpuan sa mga eukaryote. Ang Cis splicing ay isang intramolecular na mekanismo na nag-aalis ng mga intron at sumasali sa mga exon na nasa loob ng parehong RNA transcript, habang ang trans-splicing ay isang intermolecular na mekanismo na nag-aalis ng mga intron o outron at nagsasama sa mga exon na wala sa parehong RNA transcript. Kaya, tinatapos nito ang pagtalakay sa pagkakaiba ng cis at trans splicing.
