Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng aminoacyl tRNA at peptidyl tRNA ay ang aminoacyl tRNA ay isang tRNA molecule na nakagapos sa A site ng ribosome habang ang peptidyl tRNA ay isang tRNA molecule na nakagapos sa P site ng ribosome.
Ang Transfer RNA (tRNA) ay isang RNA molecule na tumutulong sa pag-decode ng messenger RNA (mRNA) sequence sa isang protina. Sa synthesis ng protina, ang molekula ng tRNA ay gumagawa ng mga pares ng base kasama ang komplementaryong pagkakasunud-sunod nito sa mRNA (messenger RNA). Tinitiyak nito na ang naaangkop na amino acid ay ipinasok sa lumalaking polypeptide chain (protein molecule). Samakatuwid, ang tRNA ay isang mahalagang sangkap para sa hakbang ng pagsasalin ng synthesis ng protina. Ang Aminoacyl tRNA at peptidyl tRNA ay dalawang uri ng mga molekula ng tRNA na lumalahok sa hakbang ng pagsasalin ng synthesis ng protina.
Ano ang Aminoacyl tRNA?
Ang Aminoacyl tRNA ay isang tRNA molecule na nagdadala ng isang amino acid sa dulo. Karaniwan itong nagbubuklod sa katabing A site ng ribosome. Ang aminoacyl tRNA, kasama ang partikular na mga salik ng pagpahaba, ay naghahatid ng tiyak na amino acid sa ribosome para isama sa polypeptide chain sa panahon ng pagsasalin. Ang bawat amino acid ay may sariling partikular na aminoacyl tRNA synthetase enzyme. Ang enzyme na ito ay ginagamit ng mga amino acid upang chemically bound sa tiyak na tRNA. Ang pagbubuklod ng isang tRNA sa cognate amino acid nito ay mahalaga. Tinitiyak nito na tanging ang partikular na amino acid na tumutugma sa anticodon ng tRNA ang ginagamit sa panahon ng synthesis ng protina. Upang maiwasan ang mga error sa pagsasalin, ang aminoacyl tRNA synthetase enzyme ay may kakayahang mag-proofread. Ang mga amino acid na na-miscylated sa tamang tRNA molecule ay karaniwang sumasailalim sa hydrolysis. Ito ay isinasagawa ng mekanismo ng deacylation ng aminoacyl tRNA synthetase enzyme. Higit pa rito, ang maling pagkarga ng tRNA ay dapat na ma-hydrolyzed upang maiwasan ang maling synthesis ng protina.
Figure 01: Aminoacyl tRNA
Bilang karagdagan sa paggana sa synthesis ng protina, ang aminoacyl tRNA ay maaari ding gumana bilang isang donor ng mga amino acid na kinakailangan para sa pagbabago ng mga lipid at biosynthesis ng mga antibiotic. Bukod dito, nauunawaan din na ang mga kumpol ng gene ay maaaring gumamit ng aminoacyl tRNA upang i-regulate ang synthesis ng mga naka-encode na polypeptides.
Ano ang Peptidyl tRNA?
Ang Peptidyl tRNA ay isang tRNA molecule na nakagapos sa P site ng ribosome. Matapos mabuo nang maayos ang initiation complex, ang pagsasalin ay nagpapatuloy sa pamamagitan ng pagpahaba ng polypeptide. Ang ribosome ay may tatlong site para sa tRNA binding: P (peptidyl), A (aminoacyl) at E (umiiral).
Figure 02: Peptidyl tRNA
Ang initiator na methionyl tRNA ay palaging nakatali sa P site. Ang susunod na aminoacyl tRNA ay nagbubuklod sa A site sa tulong ng isang elongation factor (EF-Tu sa prokaryotes at eEf-1α sa eukaryotes) at GTP. Pagkatapos ng pagbubuklod, ang molekula ng GDP (hydrolyzed GTP) ay inilabas. Nang maglaon, nabuo ang isang peptide bond sa pagitan ng methionyl tRNA sa P site at ang pangalawang aminoacyl tRNA sa A site. Ang reaksyong ito ay na-catalyzed ng peptidyl transferase enzyme. Ang reaksyong ito ay naglilipat ng methionine sa aminoacyl tRNA sa A site, kaya bumubuo ng isang peptidyl tRNA. Bukod dito, sa yugto ng pagsasalin, ang peptidyl tRNA ay gumagalaw sa P site ng ribosome sa tulong ng mga kadahilanan ng pagpahaba (EFG sa prokaryotes at eEf-2 sa eukaryotes) at GTP hydrolysis. Bilang karagdagan, ang hindi naka-charge na tRNA ay unang lumilipat sa E site ng ribosome pagkatapos ay umalis sa E site sa pagtatapos ng proseso.
Ano ang Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng Aminoacyl tRNA at Peptidyl tRNA?
- Ang Aminoacyl tRNA at peptidyl tRNA ay dalawang uri ng tRNA molecules na lumalahok sa pagsasalin.
- Parehong mga molekula ng tRNA na binubuo ng mga base ng ribonucleotide: adenine, cytosine, guanine, at uracil.
- Ang mga amino acid ay nauugnay sa parehong molekula.
- Mahahalagang papel ang ginagampanan nila sa synthesis ng protina.
- Parehong lumahok sa pagpapahaba ng hakbang ng pagsasalin.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Aminoacyl tRNA at Peptidyl tRNA?
Ang Aminoacyl tRNA ay isang tRNA molecule na nakatali sa A site ng ribosome, habang ang peptidyl tRNA ay isang tRNA molecule na nakagapos sa P site ng ribosome. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng aminoacyl tRNA at peptidyl tRNA. Higit pa rito, ang aminoacyl tRNA ay may iisang amino acid sa terminal habang ang peptidyl tRNA ay may peptide chain sa terminal.
Inililista ng infographic sa ibaba ang mga pagkakaiba sa pagitan ng aminoacyl tRNA at peptidyl tRNA sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – Aminoacyl tRNA vs Peptidyl tRNA
Ang tRNA ay isang molekula na tumutulong sa pag-decode ng isang mRNA sequence sa isang protina. Ang Aminoacyl tRNA at peptidyl tRNA ay dalawang uri ng mga molekula ng tRNA na lumalahok sa proseso ng pagsasalin. Ang Aminoacyl tRNA ay nakatali sa A site ng ribosome sa panahon ng proseso ng pagsasalin, habang ang peptidyl tRNA ay nakatali sa P site ng ribosome sa panahon ng proseso ng pagsasalin. Kaya, ito ay nagbubuod sa pagkakaiba sa pagitan ng aminoacyl tRNA at peptidyl tRNA.