Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng EcoRI at HindIII restriction enzymes ay ang EcoRI ay isang type II restriction enzyme na nakahiwalay sa E. coli, habang ang HindIII ay isang type II restriction enzyme na nakahiwalay sa Haemophilus influenza.
Restriction enzyme o restriction endonuclease ay isang enzyme na humahati sa DNA sa mga fragment sa mga partikular na lugar ng pagkilala (restriction site) sa loob ng DNA molecule. Ang mga restriction enzymes na ito ay matatagpuan sa bacteria at archaea. Nagbibigay sila ng mekanismo ng pagtatanggol laban sa mga invading virus. Ang mga restriction enzyme ay karaniwang inuri sa limang magkakaibang uri: uri I, uri II, uri III, IV, at uri V. Ang EcoRI at HindIII ay dalawang restriction enzymes na kabilang sa pangkat ng type II restriction enzymes.
Ano ang EcoRI Restriction Enzymes?
Ang EcoRI ay isang type II restriction enzyme na nakahiwalay sa E.coli species. Ito ay isang restriction enzyme na naghahati sa mga double helice ng DNA sa mga fragment sa mga partikular na site. Ang EcoRI ay bahagi din ng restriction-modification system. Ang EcoRI ay ang unang enzyme na orihinal na nahiwalay sa RY13 strain ng E. coli species. Ito ay ginagamit bilang restriction enzyme sa molecular biology. Lumilikha ang EcoRI ng 4 na malagkit na dulo ng nucleotide na may 5' dulong overhang ng AATT. Pinutol ng EcoRI ang DNA sa partikular na pagkakasunud-sunod ng pagkilala G↓AATTC. Mayroon itong palindromic na pantulong na pagkakasunud-sunod ng CTTAA↓G. Bukod dito, ang enzyme ng paghihigpit na ito ay kabilang sa subclass ng uri II P (palindromic specificity). Sa pangunahing istruktura nito, naglalaman ang EcoRI ng PD. D/EXK na motif sa loob ng aktibong site nito, tulad ng maraming iba pang restriction enzymes.
Figure 01: EcoRI
Ang EcoRI restriction enzyme ay isang homodimer ng isang 31 kDa. Naglalaman ito ng isang globular domain ng α/β architecture. Ang bawat subunit ay naglalaman ng isang loop na lumalabas mula sa globular domain at bumabalot sa DNA kapag nakatali. Ang enzyme na ito ay maaaring i-cocrystallize sa pagkakasunud-sunod na karaniwan nitong pinuputol. Higit pa rito, ang EcoRI restriction enzyme ay ginagamit sa isang malawak na iba't ibang mga molecular genetic technique, kabilang ang cloning, DNA screening, at mga seksyon ng pagtanggal ng DNA in-vitro na mga kondisyon.
Ano ang HindIII Restriction Enzymes?
Ang
HindIII ay isang type II restriction enzyme na nakahiwalay sa Haemophilus influenza species. Tinatanggal nito ang DNA palindromic sequence AACCTT sa pagkakaroon ng cofactor Mg2+ sa pamamagitan ng hydrolysis. Ang cleavage ng partikular na sequence na ito sa pagitan ng AA'S (5'A↓ACCTT3' at 3'TTCGA↓A5') ay nagreresulta sa 5' overhang sa DNA molecule na tinatawag na sticky ends. Ang enzyme na ito ay matatagpuan sa mga prokaryotic na organismo tulad ng bacteria. Ginagamit ng bakterya ang enzyme na ito bilang mekanismo ng pagtatanggol laban sa mga virus gaya ng mga bacteriophage.
Figure 02: HindIII
Sa istruktura, si HindIII ay isang homodimer. Naglalaman ito ng isang karaniwang structural core na binubuo ng apat na β sheet at isang solong α helice, tulad ng iba pang mga uri ng II restriction enzymes. Ang molecular mass ng enzyme na ito ay 34.9 kDa. Higit pa rito, ang HindIII ay lubhang kapaki-pakinabang sa modernong molekular na biological science na mga eksperimento gaya ng DNA sequencing at pagmamapa.
Ano ang Mga Pagkakatulad sa pagitan ng EcoRI at HindIII Restriction Enzymes?
- Ang EcoRI at HindIII ay dalawang restriction enzymes na kabilang sa type II restriction enzyme group.
- EcoRI at HindIII ay natagpuan noong unang bahagi ng 1970s.
- EcoRI at HindIII ay parehong naglalaman ng PD.. D/EXK amino acid sequence motif.
- Ang parehong restriction enzymes ay gumaganap ng napakaespesipikong paghahati ng DNA.
- Ang mga restriction enzyme na ito ay nangangailangan ng Mg2+ bilang cofactor para sa kanilang partikular na aktibidad.
- Nagbubunga sila ng malagkit na dulo pagkatapos putulin ang DNA.
- Sila ay lubhang kapaki-pakinabang na mga bahagi sa modernong molekular na biological na pananaliksik.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng EcoRI at HindIII Restriction Enzymes?
Ang EcoRI ay isang type II restriction enzyme na nakahiwalay sa E.coli species, habang ang HindIII ay isang type II restriction enzyme na nakahiwalay sa Haemophilus influenza species. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng EcoRI at HindIII. Higit pa rito, pinuputol ng EcoRI ang DNA sa partikular na pagkakasunud-sunod ng pagkilala na G↓AATTC, habang pinuputol ng HindIII ang DNA sa partikular na pagkakasunud-sunod ng pagkilala na A↓ACCTT.
Ang infographic sa ibaba ay nagpapakita ng mga pagkakaiba sa pagitan ng EcoRI at HindIII sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – EcoRI vs HindIII Restriction Enzymes
Ang EcoRI at HindIII ay dalawang restriction enzymes na kabilang sa type II p subclass. Nagsasagawa sila ng napaka-espesipikong pag-cleaving ng DNA. Ang EcoRI ay isang type II restriction enzyme na nakahiwalay sa E.coli species, habang ang HindIII ay isang type II restriction enzyme na nakahiwalay sa Haemophilus influenza species. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng EcoRI at HindIII.
