Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng restriction endonuclease at exonuclease ay ang restriction endonuclease ay isang nuclease enzyme na kumikilala sa isang partikular na sequence ng DNA at naghihiwa sa DNA sa loob o katabi ng sequence na iyon, habang ang exonuclease ay isang nuclease enzyme na humihiwalay sa mga nucleotide sa isang polynucleotide mula sa alinman sa 5' dulo o 3' dulo nang paisa-isa.
Ang mga nucleases ay ang mga enzyme na pumuputol sa mga bono ng phosphodiester sa pagitan ng mga nucleotide ng mga nucleic acid. Sa mga buhay na organismo, ang mga ito ay mahahalagang kasangkapan para sa maraming aspeto ng pag-aayos ng DNA sa cell. Ang mga depekto ng mga enzyme na ito ay maaaring magdulot ng genetic instability at immunodeficiency. Ang restriction nucleases ay mga partikular na nucleases na ang paggana ay nakadepende sa isang partikular na nucleotide sequence. Ang isang halimbawa ay restriction endonuclease. Mayroong pangunahing pag-uuri para sa mga nucleases batay sa locus ng aktibidad, tulad ng endonuclease at exonuclease. Tinutunaw ng Endonuclease ang mga rehiyon sa gitna ng target na molekula ng DNA. Tinutunaw ng Exonuclease ang mga nucleic acid mula sa mga dulo. Kaya, ang restriction endonuclease at exonuclease ay dalawang uri ng nuclease enzymes.
Ano ang Restriction Endonuclease?
Ang Restriction endonuclease ay isang nuclease enzyme na kumikilala sa isang partikular na sequence ng DNA at hinahati ang DNA sa loob o katabi ng sequence na iyon. Ang tiyak na pagkakasunud-sunod ng DNA ay kilala bilang ang lugar ng paghihigpit. Tinatawag din itong restriction enzyme o restrictase. Ang restriction endonuclease ay isang napaka tiyak na enzyme. Ito ay isang klase ng mas malawak na pangkat ng endonuclease ng mga enzyme. Ang mga restriction endonucleases ay karaniwang inuri sa limang uri, na naiiba sa kanilang istraktura at kakayahang putulin ang DNA substrate sa lugar ng pagkilala. Ang limang uri ay type I, type II, type III, type IV at type V.
Figure 01: Restriction Endonuclease
Restriction endonucleases ay karaniwang matatagpuan sa bacteria at archaea. Nagbibigay sila ng mekanismo ng pagtatanggol para sa bakterya laban sa mga virus. Mayroong higit sa 3600 kilalang restriction endonucleases. Kinakatawan nila ang higit sa 250 iba't ibang mga detalye. Higit sa 3000 sa mga ito ay pinag-aralan nang detalyado. Higit pa rito, higit sa 800 sa mga ito ay available sa komersyo.
Ano ang Exonuclease?
Ang Exonuclease ay isang nuclease enzyme na naghihiwalay sa mga nucleotide sa isang polynucleotide mula sa alinman sa 5’ dulo o 3’ dulo nang paisa-isa. Nangyayari ito sa pamamagitan ng isang hydrolysing reaction na sumisira sa mga phosphodiester bond sa pagitan ng mga nucleotide sa dulo. Ang mga eukaryote at prokaryote ay may tatlong uri ng exonucleases. Ang mga exonucleases na ito ay kasangkot sa normal na turnover ng mRNA. Ang mga ito ay 5' hanggang 3' exonuclease (Xrn1), 3' hanggang 5' exonuclease, at poly-A na partikular na 3' hanggang 5' exonuclease. Ang 5' hanggang 3' exonuclease ay isang dependent decapping protein. Ang 3' hanggang 5' exonuclease ay isang independiyenteng protina. Poly A specific 3' to 5' exonuclease ay kilala rin bilang poly-A specific ribonuclease na kasangkot sa exonucleolytic degradation ng poly-A tail.
Figure 02: Exonuclease
Sa parehong archaea at eukaryotes, ang RNA degradation ay ginagawa ng multi-protein exosome complex na binubuo ng 3’ hanggang 5’ exoribonucleases.
Ano ang Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng Restriction Endonuclease at Exonuclease?
- Ang restriction endonuclease at exonuclease ay dalawang uri ng nuclease enzymes.
- Ang parehong mga enzyme ay pinuputol ang mga molekula ng DNA.
- Ang mga enzyme na ito ay matatagpuan sa mga prokaryote.
- Mga protina sila.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Restriction Endonuclease at Exonuclease?
Ang Restriction endonuclease ay isang nuclease enzyme na kumikilala ng isang partikular na sequence ng DNA at pinuputol ang DNA sa loob o katabi ng sequence na iyon, habang ang exonuclease ay isang nuclease enzyme na naghihiwalay sa mga nucleotide sa isang polynucleotide mula sa 5' dulo o 3' dulo paisa-isa. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng restriction endonuclease at exonuclease. Bukod dito, ang restriction endonuclease ay matatagpuan lamang sa mga prokaryote, habang ang exonuclease ay matatagpuan sa parehong mga prokaryote at eukaryotes.
Inililista ng sumusunod na infographic ang mga pagkakaiba sa pagitan ng restriction endonuclease at exonuclease sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – Restriction Endonuclease vs Exonuclease
Ang Nucleases ay ang mga enzyme na sumisira sa mga phosphodiester bond sa pagitan ng mga nucleotide ng nucleic acid. Ang restriction endonuclease at exonuclease ay dalawang uri ng nuclease enzymes. Ang restriction endonuclease ay isang nuclease enzyme na kumikilala sa isang partikular na sequence ng DNA at pinuputol ang DNA sa loob o katabi ng sequence na iyon. Ang Exonuclease ay isang nuclease enzyme na naghihiwalay sa mga nucleotide sa isang polynucleotide mula sa alinman sa kanilang 5' dulo o 3' dulo nang paisa-isa. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng restriction endonuclease at exonuclease.
