Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng snRNA at snoRNA ay ang snRNA ay kinabibilangan ng alternatibong splicing ng pre-mRNA habang ang snoRNA ay kinabibilangan ng pagbabago ng rRNA at tRNA, mRNA editing, at genome imprinting.
Ang Small RNA ay mga polymeric RNA molecule na binubuo ng mas mababa sa 200 nucleotides. Karaniwan silang hindi coding. Umiiral sila sa mga messenger RNA upang magdala ng mga signal. Ang mga maliliit na RNA ay nagmula sa perpektong double-stranded na RNA, na ginawa ng pagkilos ng RNA-dependant na RNA polymerase. Ang mga maliliit na RNA ay may mahalagang papel sa pagkakaiba-iba ng cell, paglaki at paglaganap, apoptosis, metabolismo, paglipat, at pagtatanggol. Samakatuwid, ang mga maliliit na RNA ay mahalaga at kritikal na mga regulator ng pag-unlad at pisyolohiya. Ang maliit na nuclear RNA at maliit na nucleolar RNA ay dalawang klase ng maliliit na RNA molecule.
Ano ang snRNA?
Ang Small nuclear RNA o snRNA ay isang klase ng maliliit na RNA molecule na matatagpuan sa nucleus ng eukaryotic cells. Ang average na haba ng isang snRNA ay humigit-kumulang 150 nucleotides. RNA polymerase II o RNA polymerase III transcribe snRNA. Ang pangunahing pag-andar ng snRNA ay ang pagproseso ng pre-messenger RNA sa nucleus. Nakakatulong din ang mga ito sa pag-regulate ng mga transcription factor o RNA polymerase II at pagpapanatili ng mga telomere.
Figure 01: Mekanismo ng Pagkilos ng Maliit na RNA
Mayroong dalawang klase ng snRNA batay sa mga karaniwang sequence na feature at nauugnay na mga salik ng protina gaya ng RNA binding LSm protein. Ang dalawang klase ay Sm-class snRNA at Lsm-class snRNA. Ang Sm-class na snRNA ay binubuo ng mataas na uridine content ng U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11, at U12. Ang RNA polymerase II ay nag-transcribe ng SM-class na snRNA. Pagkatapos ng transkripsyon ng pre-snRNA, kadalasan ay tumatanggap sila ng 7-methylguanosine 5' cap sa nucleus. Pagkatapos ay ini-export sila sa cytoplasm sa pamamagitan ng mga nuclear pores para sa karagdagang pagproseso. Ang Lsm-class na snRNA ay may mataas na uridine content ng U6 at U6atac. Ang RNA polymerase III ay nagsasalin ng Lsm-class na snRNA, at hindi ito umaalis sa nucleus. Ang pinakakaraniwang bahagi ng snRNA ng tao ay ang U1 spliceosomal RNA, U2 spliceosomal RNA, U4 spliceosomal RNA, U5 spliceosomal RNA, at U6 spliceosomal RNA.
Ano ang snoRNA?
Ang Small nucleolar RNA o snoRNA ay isang klase ng maliliit na RNA molecule na gumagabay sa mga kemikal na pagbabago sa ibang RNA gaya ng ribosomal RNA, transfer RNA, at maliit na nuclear RNA. Ang bawat molekula ng snoRNA ay nauugnay sa halos apat na pangunahing protina sa RNA/protein complex sa panahon ng proseso ng pagbabago. Ang snoRNA ay naglalaman ng isang antisense na elemento na nasa 10-20 nucleotides. Ang mga base na ito ay komplimentaryo sa sequence na nakapalibot sa mga nucleotide na nagta-target sa pagbabago sa pre-RNA molecule.
Figure 02: Maliit na Nucleolar RNA
May dalawang klase ng snoRNA. Ang mga ito ay ang C/D box snoRNA at H/ACA box snoRNA. Ang C/D box snoRNA ay nauugnay sa methylation, at ang H/ACA box snoRNA ay nauugnay sa pseudo-uridylation. Ang bawat molekula ng snoRNA ay nagsisilbing gabay para sa isa o dalawang pagbabago sa isang target na RNA. Ang C/D box snoRNA ay naglalaman ng dalawang maikling conserved sequence motif na C at D, malapit sa 5' at 3' na dulo ng snoRNA, ayon sa pagkakabanggit. Ang mga maikling rehiyon na binubuo ng 5 nucleotides ay nag-aayos sa itaas ng C box at sa ibaba ng D box at bumubuo ng stem-box structure. Dinadala nito ang mga motif ng C at D box sa malapit. Ang istraktura ng stem-box ay mahalaga para sa tamang synthesis ng snoRNA at lokalisasyon ng nucleolar. Ang H/ACA box snoRNA ay may pangalawang istraktura na binubuo ng dalawang hairpins at dalawang single-stranded na rehiyon. Ito ay karaniwang kilala bilang istraktura ng hairpin-hinge-hairpin-tail. Ang H/ACA box snoRNA ay binubuo din ng dalawang conserved motif na H at ACA. Parehong matatagpuan sa mga single-stranded na rehiyon. Ang kahon ng H ay nasa bisagra, at ang ACA ay nasa rehiyon ng buntot. Tatlong nucleotide ang bumubuo sa 3’ dulo ng sequence.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng snRNA at snoRNA?
- Ang snRNA at snoRNA ay maliliit na RNA.
- Parehong nasa mga eukaryotic cell.
- Parehong mga non-coding na RNA molecule.
- Bukod dito, nakikilahok sila sa pagbabago ng RNA sa panahon ng proseso ng transkripsyon.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng snRNA at snoRNA?
Ang snRNA ay nakikilahok sa alternatibong splicing ng pre-mRNA habang pangunahing binago ng snoRNA ang mga molekula ng RNA. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng snRNA at snoRNA. Higit pa rito, ang mga snRNA ay humigit-kumulang 150 nucleotides ang haba at kadalasang matatagpuang nauugnay sa isang pangkat ng mga protina at mga complex na tinatawag na maliit na nuclear ribonucleoproteins. Ang mga snoRNA ay humigit-kumulang 60-170 nucleotides ang haba at pangunahing matatagpuan sa nucleolus.
Bukod dito, ang mga snRNA ay na-transcribe ng alinman sa RNA polymerase II o RNA polymerase III samantalang, ang snoRNA ay na-transcribe lamang ng RNA polymerase II.
Ang infographic sa ibaba ay nagpapakita ng mga pagkakaiba sa pagitan ng snRNA at snoRNA sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – snRNA vs snoRNA
Ang snRNA at snoRNA ay mga klase ng maliliit na molekula ng RNA. Ang snRNA ay nakikilahok sa alternatibong splicing ng pre-mRNA habang ang snoRNA ay pangunahing binabago ang mga molekula ng RNA. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng snRNA at snoRNA. Ang maliit na RNA ay mga polymeric na molekula ng RNA na binubuo ng mas mababa sa 200 nucleotides ang haba at karaniwang hindi coding. Ang mga snRNA ay matatagpuan sa nucleus ng mga eukaryotes. Ang mga snoRNA ay matatagpuan sa archaea at eukaryotes. Ang transkripsyon ng snRNA ay nagaganap sa pamamagitan ng RNA polymerase II at II, habang ang RNA polymerase II lamang ang kasangkot sa pag-transcribe ng snoRNA. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng snRNA at snoRNA.
