Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng DNA at RNA probes ay ang DNA probe ay mga fragment ng DNA na pantulong sa mga target na nucleotide sequence habang ang RNA probes ay mga stretches ng single-stranded RNA na mga complementary nucleic acid sequence ng target sequence.
Ang Ang probe ay isang artipisyal na na-synthesize na maikling sequence ng DNA o RNA na maaaring may label na radioactive o may mga nonradioactive molecule. Maaari itong magkaroon ng haba na 100 hanggang 1000 base. Ang mga probe ay kapaki-pakinabang sa pag-detect ng mga target na nucleotide sequence na pantulong sa sequence ng probe. Kapag naidagdag na, ang mga probe ay na-hybrid sa mga pantulong na sequence o sa mga target na sequence at ginagawa itong nakikita upang matukoy ang mga target na sequence dahil nagdadala ito ng radioactivity. Ang mga probe ay mahalagang molecular tool para sa maraming microbial at molekular na lugar tulad ng pagtuklas ng mga genetic na sakit, sa virology, sa forensic pathology, sa paternity testing, sa DNA fingerprinting, RFLP, molecular cytogenetics, in situ hybridization, atbp.
Ano ang DNA Probes?
Ang DNA probe ay mga single-stranded stretches ng DNA. Maaari silang magamit upang makita ang pagkakaroon ng mga pantulong na nucleic acid sequence (target sequence) sa pamamagitan ng hybridization. Sa sandaling ang isang DNA probe ay na-hybrid sa komplementaryong sequence nito, ito ay bumubuo ng isang double-stranded hybrid. Upang makita ang mga ito, ang DNA probes ay karaniwang may label na radioisotopes, biotin, epitopes o fluorophores. Ang DNA probe na may label na biotin ay maaaring matukoy ng streptavidin-labelled alkaline phosphatase sa pamamagitan ng ilang enzymatic at kemikal na pamamaraan.
Figure 01: DNA Probe
Ang nucleotide sequence ng DNA probe ay kilala. Ang mga ito ay maiikling sequence na may haba na 100 hanggang 1000 base pairs. Ang mahabang DNA probes ay maaaring mabuo ng recombinant DNA technology. Maaari din silang mabuo sa pamamagitan ng PCR at cloning. Sa clinical microbiology laboratories, ang DNA probes ay madaling makuha para sa mabilis na pagsusuri ng mga nakakahawang sakit.
Ano ang RNA Probes?
Ang RNA probe ay mga single-stranded stretches ng RNA. Ang mga ito ay mga pantulong na pagkakasunud-sunod upang i-target ang mga pagkakasunud-sunod sa sample. Karaniwang na-synthesize ang mga ito kasama ang RNA polymerases mula sa bacteriophage SP6, T7, o T3 sa pamamagitan ng in vitro transcription ng DNA. Ang mahabang RNA probes ay maaaring mabuo ng in vitro transcription mula sa linearized plasmid DNA. Sa pangkalahatan, ang mga probe ng RNA ay nagbubuklod nang malakas at mas mahigpit sa kanilang mga pantulong na pagkakasunud-sunod kaysa sa mga probe ng DNA. Katulad ng mga DNA probes, ang RNA probes ay maaari ding lagyan ng label habang sila ay isinasalin.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng DNA at RNA Probes?
- Parehong DNA at RNA probe ay single-stranded nucleotide sequence.
- Parehong artipisyal na idinisenyo at na-synthesize.
- Bukod dito, maaari silang lagyan ng label ng radioisotopes, epitopes, biotin o fluorophores.
- Mayroon silang malakas na kaugnayan sa isang partikular na sequence ng target na DNA o RNA.
- Ginagamit ang mga ito sa iba't ibang pamamaraan ng blotting at in situ na hybridization para sa pagtuklas ng mga target na nucleic acid sequence.
- Ang parehong uri ng probe ay maaaring i-hybrid sa kanilang mga pantulong na pagkakasunud-sunod.
- Ginagamit din ang mga ito sa pagtukoy ng mga mikroorganismo at pag-diagnose ng mga nakakahawa, namamana, at iba pang sakit.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng DNA at RNA Probes?
Ang DNA probe ay isang maikling kahabaan ng DNA na pantulong sa target na sequence. Sa kabilang banda, ang RNA probe ay isang maikling single-stranded stretch ng RNA na pantulong sa target na pagkakasunud-sunod. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng DNA at RNA probes. Higit pa rito, ang DNA probe ay naglalaman ng A, T, C at G habang ang RNA probe ay naglalaman ng A, U, C at G.
Bukod dito, ang karagdagang pagkakaiba sa pagitan ng DNA at RNA probes ay ang kanilang thermodynamic stability. Ang mga RNA probe ay nagpapakita ng higit na thermodynamic stability kumpara sa mga DNA probe.
Sa ibaba ng infographic ay naka-tabulate ang mahahalagang pagkakaiba sa pagitan ng DNA at RNA probe.
Buod – DNA vs RNA Probes
Ang Ang probe ay isang maliit na fragment ng DNA o RNA na ginagamit upang makita ang pagkakaroon ng isang partikular na sequence sa sample ng DNA o RNA sa pamamagitan ng molecular hybridization. Ang DNA probes ay maiikling single-stranded na mga fragment ng DNA habang ang RNA probes ay maiikling single-stranded RNA sequence. Kilalang mga sequence ang mga ito. Ang thermodynamic stability ay mas malaki sa RNA probes kaysa sa DNA probes. Ang mga RNA probes ay mahigpit na nagbubuklod sa kanilang mga pantulong na pagkakasunud-sunod kaysa sa DNA probes na nagbubuklod. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng DNA at RNA probe.
