Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng dATP at ddATP ay hindi tinatapos ng dATP ang DNA synthesis habang nagagawa ng ddATP na wakasan ang DNA synthesis. Ito ay dahil ang ddATP ay may H atom na nakakabit sa 3ʹ na posisyon ng pentose sugar habang ang dATP ay may isang OH group na nakakabit sa 3ʹ na posisyon.
Ang dNTP ay bumubuo ng mga bloke ng DNA. Mayroong apat na uri ng dNTP ayon sa purine o pyrimidine bases-dATP isa sa mga ito. Ang nitrogenous base ng dATP ay adenosine. Ang mga ddNTP ay mga nucleotide na ginagamit sa pagkakasunud-sunod ng Sanger. Mayroong apat na uri ng mga ddNTP. Ang ddATP ay isang ddNTP.
Ano ang dATP?
Ang
Deoxyadenosine triphosphate ay isang nucleotide, na isang building block ng DNA. Gumagamit ang DNA polymerase enzyme ng dATP bilang substrate para sa synthesis ng DNA. Ang dATP ay may tatlong bahagi: isang molekula ng asukal na deoxyribose, isang adenosine, at ang tatlong grupo ng pospeyt. Samakatuwid, ito ay isang purine nucleoside triphosphate. Ang chemical formula ng dATP ay C10H16N5O12 P3, at ang molecular mass nito ay 491.182.
Figure 01: dATP
Ang dATP ay naiiba sa ATP (adenosine triphosphate) sa mga tuntunin ng mga bahagi ng asukal. Ang ATP ay may ribose sugar. Mga pares ng base ng dATP na may uracil nucleotide sa panahon ng transkripsyon. Bilang karagdagan sa pakikilahok sa synthesis ng DNA, ang dATP ay maaaring kumilos bilang isang molekula na naglilipat ng enerhiya upang mapanatili din ang posibilidad ng cell. Ang isang mataas na antas ng dATP sa katawan ay nakakalason dahil maaari itong kumilos bilang isang noncompetitive inhibitor para sa enzyme ribonucleotide reductase. Maaari itong humantong sa kapansanan sa immune function.
Ano ang ddATP?
Ang Dideoxyadenosine triphoaphate o ddATP ay isa sa apat na uri ng nucleotide na ginagamit sa Sanger sequencing method. Sa istruktura, ang ddATP ay mayroon ding tatlong bahagi na katulad ng dATP. Ang mga ito ay isang adenine base, isang deoxyribose na asukal at tatlong phosphate.
Figure 02: ddATP
Hindi tulad ng dATP, ang ddATP ay walang OH group sa 3ʹ na posisyon ng pentose sugar upang bumuo ng phosphodiester bond sa katabing nucleotide at ipagpatuloy ang pagpapahaba ng chain. Mayroon itong H atom sa 3ʹ na posisyon. Samakatuwid, kapag naisama na ang ddATP, magtatapos ang synthesis ng DNA. Ito ang pangunahing prinsipyo ng Sanger sequencing. Samakatuwid, ang ddATP ay gumagana bilang isang chain elongation inhibitor sa Sanger sequencing. Mayroong apat na tubo na ginagamit sa Sanger sequencing at ang ddATP ay idinagdag sa isang tubo.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng dATP at ddATP?
- Ang dATP at ddATP ay mga nucleotide.
- Parehong binubuo ng adenine, deoxyribose at tatlong phosphate.
- Mga organic compound ang mga ito.
- Parehong idinaragdag ang dATP at ddATP sa mga tubo sa Sanger sequencing.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng dATP at ddATP?
Ang dATP ay may pangkat na OH sa 3ʹ na posisyon ng pentose sugar habang ang ddATP ay walang OH group sa 3ʹ na posisyon ng pentose sugar. Higit pa rito, ang dATP ay isang monomer na ginagamit sa synthesis ng DNA habang ang ddATP ay ginagamit upang wakasan ang pagpapahaba ng chain sa panahon ng pagkakasunud-sunod ng Sanger. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng dATP at ddATP. Bukod dito, ang dATP ay maaaring bumuo ng mga phosphodiester bond habang ang ddATP ay hindi maaaring bumuo ng mga phosphodiester bond.
Sa ibaba ng infographic ay nagpapakita ng higit pang pagkakaiba sa pagitan ng dATP at ddATP sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – dATP vs ddATP
Sa madaling sabi, ang dATP ay isang precursor sa DNA synthesis habang ang ddATP ay isang nucleotide na ginagamit upang wakasan ang DNA synthesis sa Sanger sequencing. Bukod dito, ang dATP ay may pangkat na OH sa 3ʹ na posisyon ng pentose sugar at pinapayagan nito ang pagbuo ng isang phosphodiester bond sa susunod na nucleotide. Samantala, ang ddATP ay kulang sa pangkat ng OH sa posisyong 3ʹ; samakatuwid, hindi ito makabuo ng isang phosphodiester bond sa susunod na nucleotide. Bilang resulta, ang pagkakasunud-sunod ng DNA ay huminto sa pagpahaba nito. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng dATP at ddATP.
