Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng class I at class II na transposable na elemento ay ang class I na transposable na elemento ay mga retrotransposon, habang ang class II na transposable na elemento ay DNA transposon.
Ang transposable element ay isang DNA sequence na maaaring magbago ng posisyon nito sa loob ng genome. Minsan ito ay lumilikha at binabaligtad ang mga mutasyon. Maaari rin nitong baguhin ang genetic identity at genome size ng cell. Ang prosesong ito ay madalas na nagreresulta sa pagdoble ng parehong genetic na materyal. Ang transposable element ay unang natuklasan ni Barbara McClintock, at nanalo siya ng Nobel Prize para sa kanyang pagtuklas noong 1983. Maaaring ikategorya ang mga transposable na elemento sa dalawang klase batay sa mekanismo ng transposisyon ng mga ito: class I at class II na transposable na elemento.
Ano ang Class I Transposable Elements?
Class I transposable elements ay mga retrotransposon. Ang Retrotransposon ay isang uri ng genetic component na kinokopya at i-paste ang sarili nito sa iba't ibang genomic na lokasyon sa pamamagitan ng pag-convert ng RNA pabalik sa DNA sa pamamagitan ng prosesong tinatawag na reverse transcription. Ang prosesong ito ay na-catalyze ng reverse transcriptase enzyme. Ang Retrotransposon ay karaniwang gumagamit ng RNA transposition intermediate. Karaniwang kinokopya ang Class I na mga transposable na elemento sa dalawang yugto. Una, sila ay na-transcribe mula sa DNA patungo sa RNA. Pagkatapos ang RNA na ginawa ay pagkatapos ay i-reverse transcribe sa DNA. Sa paglaon, ang kinopyang DNA na ito ay ipinasok pabalik sa genome sa isang bagong posisyon. Ang mga katangian ng retrotransposon ay halos kapareho ng retrovirus gaya ng HIV.
Figure 01: Class I Transposable Element
Ang mga retrotransposon ay maaaring hatiin sa tatlong uri.
- Retrotransposon na may mahabang terminal repeats (LTRs), na nag-e-encode para sa reverse transcriptase,
- Retrotransposon na may mahabang interspersed nuclear elements (LINE) na nag-encode para sa reverse transcriptase ngunit walang LTR at na-transcribe ng RNA polymerase II,
- Retrotransposon na may short interspersed nuclear elements (SINEs) na hindi naka-encode para sa reverse transcriptase at na-transcribe ng RNA polymerase III.
Bukod dito, dahil sa katulad na mekanismo na may mga retrotransposon, ang retrovirus ay maaari ding ituring bilang mga transposable na elemento.
Ano ang Class II Transposable Elements?
Class II transposable elements ay mga DNA transposon. Ang Class II na mga transposable na elemento ay may cut and paste na mekanismo ng transposisyon na hindi nagsasangkot ng RNA intermediate. Ang transposisyon ay na-catalysed ng ilang transposase enzymes. Ang mga enzyme na ito ay maaaring partikular o hindi partikular na magbigkis sa DNA. Ang Transposase ay gumagawa ng staggered cut sa target na site ng DNA na gumagawa ng malagkit na dulo. Pagkatapos ay pinutol ng mga ito ang DNA transposon ligates papunta sa iba pang mga target na site.
Figure 02: Class II Transposable Elements
Karaniwan, pinupunan ng DNA polymerase ang mga nagreresultang gaps mula sa malagkit na dulo, at sinasara ng DNA ligase ang sugar-phosphate backbone. Bukod dito, nagreresulta ang transposisyong ito sa pagdoble ng target na site. Ang mga insertion site ng DNA transposon ay maaaring makilala sa pamamagitan ng maikli, direktang pag-uulit na sinusundan ng inverted repeats. Ngunit hindi lahat ng DNA transposon ay nagpapakita ng isang cut at paste na mekanismo ng transposisyon. Halimbawa, ang ilang mga transposon ay nagpapakita ng replicative transposition kung saan ang mga transposon ay ginagaya ang kanilang mga sarili sa isang bagong target na site.
Mga Pagkakatulad sa pagitan ng Class I at Class II na Transposable Element
- Class I at Class II transposable elements ay mobile genetics elements o jumping genes.
- Maaaring baguhin ng dalawa ang kanilang posisyon sa genome.
- Binubuo sila ng mga DNA sequence.
- Sila ay mga makasariling genetic na elemento.
- Napakahalaga ng mga ito sa genomic function at evolution.
Pagkakaiba sa pagitan ng Class I at Class II na Transposable Element
Class I transposable elements ay retrotransposon, habang ang class II transposable elements ay DNA transposon. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng class I at class II na mga transposable na elemento. Higit pa rito, ang class I transposable elements ay gumagamit ng RNA intermediates sa transposition mechanism. Sa kabilang banda, ang class II transposable elements ay gumagamit ng DNA intermediate sa transposition mechanism.
Ang sumusunod na infographic ay nagsasama-sama ng mga pagkakaiba sa pagitan ng class I at class II na mga transposable na elemento sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – Class I vs Class II Transposable Elements
Ang mga naililipat na elemento ay kilala bilang mga mobile genetic na elemento o jumping genes. Ang mga ito ay mga sequence ng DNA. Ang mga transposable na elemento ay ikinategorya sa dalawang klase batay sa kanilang transposisyon na mekanismo bilang class I at class II na transposable na elemento. Ang Class I transposable elements ay mga retrotransposon, habang ang class II transposable elements ay DNA transposon. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng class I at class II na mga transposable na elemento.
