Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng RNA interference at antisense oligonucleotide ay ang RNA interference ay isang pamamaraan na kinasasangkutan ng sequence-specific suppression ng gene expression ng double-stranded RNA habang ang antisense oligonucleotide ay isang pamamaraan na nagsasangkot ng pagsugpo sa pagpapahayag ng gene na partikular sa pagkakasunod-sunod ng isang solong-stranded na DNA oligonucleotide.
Ang Gene silencing o suppression ay isang paraan ng pag-regulate ng gene expression sa isang biological cell upang maiwasan ang pagpapahayag ng isang partikular na gene. Karaniwan, kapag ang mga gene ay pinatahimik, ang kanilang ekspresyon ay nababawasan. Sa kaibahan, kapag ang mga gene ay na-knock out, sila ay ganap na nabubura mula sa genome ng organismo; kaya, ay walang ekspresyon. Minsan, ang gene silencing ay itinuturing na kapareho ng gene knockdown. Ito ay dahil ang mga paraan ng pag-silencing ng gene tulad ng RNAi, antisense oligonucleotide, at CRISPR na ginagamit upang patahimikin ang mga gene ay nagdudulot ng pagbawas ng expression ng gene ng hindi bababa sa 70%. Ang mga interference ng RNA at antisense oligonucleotides ay dalawang mahalagang diskarte sa pag-silencing ng gene.
Ano ang RNA Interference?
Ang
RNA interference (RNAi) ay isang biological na proseso kung saan ang mga double-stranded na molekula ng RNA ay nagsasagawa ng sequence-specific na pagsugpo sa expression ng gene. Ibinahagi nina Andrew Fire at Craig C. Mello ang premyong Nobel noong 2006 sa Medicine para sa kanilang pambihirang gawain sa RNA interference sa nematode worm: Caenorhabditis elegans. Ang panimulang pananaliksik na ito sa RNA interference ay unang inilathala nila noong 1998. Karaniwan, ang RNAi pathway ay matatagpuan sa maraming eukaryotic organism, kabilang ang mga hayop.
Figure 01: RNA interference
Dalawang central molecule, microRNA (miRNA) at small interference RNA (siRNA), ay kasangkot sa RNAi pathway. Ang isang enzyme na tinatawag na Dicer ay nagpapahiwatig ng landas na ito. Hinahati ng Dicer ang mahabang double-stranded na RNA sa maikling double-stranded na mga fragment (21 nucleotides siRNA). Pagkatapos, ang bawat siRNA ay ilalabas sa dalawang single-stranded na RNA na kilala bilang passenger strand at guide strand. Ang strand ng pasahero ay nasira habang ang guide strand ay isinama sa RNA induced silencing complex (RISC). Sa RISC, gabayan ang mga pares ng strand na may komplementaryong mRNA, na nag-trigger ng Argonaute (Ago2), ang catalytic na bahagi ng RISC complex. Nang maglaon, pinuputol ng Argonaute ang molekula ng mRNA. Hindi tulad ng siRNA, tina-target ng microRNA (miRNA) ang 3' hindi na-translate na rehiyon ng mRNA kung saan nagbubuklod ang mga ito nang may hindi perpektong pagkakatugma. Hinaharangan nito ang pag-access ng mRNA sa mga ribosom para sa pagsasalin.
Ano ang Antisense Oligonucleotide?
Ang
Antisense oligonucleotide ay isang pamamaraan na nagsasangkot ng pagsugpo sa gene expression na partikular sa pagkakasunod-sunod ng isang single-stranded na DNA oligonucleotide. Ang teknik na ito ay tinatawag ding antisense therapy Ito ay isang paraan ng therapy na gumagamit ng antisense oligonucleotides (ASOs) upang i-target ang messenger RNA (mRNA). Binabago ng antisense oligonucleotides ang expression ng mRNA sa pamamagitan ng paggamit ng iba't ibang mekanismo tulad ng ribonuclease H mediated decay ng pre mRNA, direktang steric blockage at modulasyon ng exon content sa pamamagitan ng splicing site binding sa pre mRNA.
Figure 02: Antisense Oligonucleotide
Maraming antisense oligonucleotides ang inaprubahan ng United States at European Union para sa paggamot sa sakit. Bukod dito, ang antisense oligonucleotides ay naaprubahan na bilang isang therapy para sa maraming sakit kabilang ang, Batten disease, cytomegalovirus retinitis, Duchenne muscular dystrophy, familial chylomicronaemia syndrome, familial hypercholesterolemia, hereditary transthyretin-mediated amyloidosis, at spinal muscular atrophy.
Ano ang Mga Pagkakatulad sa pagitan ng RNA Interference at Antisense Oligonucleotide?
- Ang interference ng RNA at antisense oligonucleotide ay dalawang mahalagang diskarte sa pag-silencing ng gene.
- Ang parehong mga diskarte ay nagta-target ng mga molekula ng mRNA.
- Ang mga ito ay mga diskarteng partikular sa pagkakasunud-sunod.
- Ang parehong mga diskarte ay ginagamit bilang mga therapy para sa maraming sakit.
- Pareho nilang pinipigilan ang pagpapahayag ng gene.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng RNA Interference at Antisense Oligonucleotide?
Ang RNA interference ay isang pamamaraan na kinasasangkutan ng sequence-specific na pagsugpo sa expression ng gene ng isang double-stranded RNA habang ang antisense oligonucleotide ay isang diskarteng nagsasangkot ng sequence-specific na pagsugpo ng gene expression ng isang single-stranded na DNA oligonucleotide. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng RNA interference at antisense oligonucleotide.
Ang infographic sa ibaba ay nagpapakita ng mga pagkakaiba sa pagitan ng RNA interference at antisense oligonucleotide sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – RNA Interference vs Antisense Oligonucleotide
Gene silencing techniques binabawasan ang cellular gene expression. Ang interference ng RNA at antisense oligonucleotide ay dalawang mahalagang pamamaraan ng pag-silencing ng gene. Ang interference ng RNA ay isang pamamaraan na kinasasangkutan ng sequence-specific na pagsugpo sa expression ng gene ng isang double-stranded na RNA habang ang antisense oligonucleotide ay isang pamamaraan na kinasasangkutan ng sequence-specific na pagsugpo sa expression ng gene ng isang single-stranded DNA oligonucleotide. Kaya, ito ay nagbubuod sa pagkakaiba sa pagitan ng RNA interference at antisense oligonucleotide.
