Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng RNA polymerase core at holoenzyme ay ang RNA polymerase core ay isang enzyme na walang sigma factor, habang ang RNA polymerase holoenzyme ay isang enzyme na binubuo ng isang sigma factor.
Ang transkripsyon sa bacteria ay isang proseso kung saan ang isang segment ng bacterial DNA ay kinopya sa isang bagong synthesize na mRNA strand gamit ang isang RNA polymerase enzyme. Ang prosesong ito ay nangyayari sa tatlong pangunahing hakbang: pagsisimula, pagpahaba, at pagwawakas. Ang bacterial RNA polymerase ay binubuo ng 6 na subunits. Ang RNA polymerase core ay binubuo ng β, β′, α2 at ω subunits. Ang RNA polymerase core na ito ay nagiging holoenzyme kapag ang σ (sigma) factor ay nakatali sa core enzyme. Ang RNA polymerase core at holoenzyme ay dalawang anyo ng bacterial RNA polymerase enzyme.
Ano ang RNA Polymerase Core?
Ang RNA polymerase core ay isang enzyme na kasangkot sa bacterial transcription na walang sigma factor. Binubuo ito ng 5 subunit na itinalaga bilang β, β′, α2, at ω. Ang enzyme na ito ay hindi nagpapasimula ng tiyak na transkripsyon mula sa bacterial at phage DNA promoters. Ito ay dahil hindi nito kinikilala ang anumang partikular na bacterial o phage DNA promoters. Gayunpaman, pinapanatili ng enzyme na ito ang kakayahang mag-transcribe ng RNA mula sa mga hindi tiyak na pagkakasunud-sunod ng pagsisimula. Bukod dito, ang pagdaragdag ng sigma factor sa enzyme na ito ay nagpapahintulot sa enzyme na simulan ang RNA synthesis mula sa mga tiyak na bacterial at phage promoters. Ang molecular weight ng RNA polymerase core enzyme ay humigit-kumulang 400 kDa.
Figure 01: RNA Polymerase Core
Ang pangunahing enzyme ay naglalaman ng mga catalytic na katangian ng RNA polymerase. Ang α subunit ay isang homodimer na may sukat na 36.5 kDa. Ito ay naka-encode ng rpoA gene. Ang mga function ng subunit na ito ay RNAP assembly, pakikipag-ugnayan sa DNA, at transcription factor para sa transcriptional regulation. Ang Β subunit ay 150.4 kDa ang laki. Ito ay naka-encode ng rpoB gene. Ang mga function ng subunit na ito ay DNA at RNA binding, RNA synthesis, NTP binding, RMP binding site, at σ factor binding. Ang β′ subunit ay 155 kDa ang laki, at ito ay naka-encode ng rpoC gene. Ang mga function ng subunit na ito ay DNA binding, RNA synthesis, catalytic Mg2+ coordination, ppGpp binding site 1, at σ factor binding. Higit pa rito, ang ω factor ay 10.2 kDa ang laki at naka-encode ng rpoZ gene. Ang function ng ω factor ay RNAP folding at ppGpp binding site 1.
Ano ang RNA Polymerase Holoenzyme?
Ang RNA polymerase holoenzyme ay binubuo ng isang partikular na bahagi na kilala bilang sigma factor maliban sa β, β′, α2, at ω na mga subunit. Dahil sa sigma factor, nakikilala ng RNA polymerase holoenzyme ang mga promotor. Nakakatulong din ang sigma factor sa tamang paglalagay ng RNA polymerase holoenzyme at pag-unwinding sa start site. Kapag naisagawa na ng sigma factor ang kinakailangan at partikular na function nito, humihiwalay ito sa RNA polymerase holoenzyme habang ang catalytic na bahagi (β, β′, α2, at ω) ng RNA polymerase ay nananatili sa DNA at nagpapatuloy sa transkripsyon.
Figure 02: RNA Polymerase Holoenzyme
Ang bilang ng mga sigma factor ay nag-iiba-iba sa pagitan ng bacterial species. Ang E. coli ay may pitong sigma factor. Bukod dito, ang mga kadahilanan ng sigma ay nakikilala sa pamamagitan ng kanilang mga katangian na molekular na timbang. Halimbawa, ang σ70 ay ang sigma factor na may molecular weight na 70 kDa. Ang iba't ibang mga kadahilanan ng sigma ay ginagamit ng bakterya sa ilalim ng iba't ibang mga kondisyon sa kapaligiran. Kabilang sa mga halimbawa ng iba't ibang salik ng σ; σ19, σ24, σ18, σ32, σ38, at σ54
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng RNA Polymerase Core at Holoenzyme?
- Ang RNA polymerase core at holoenzyme ay dalawang anyo ng bacterial RNA polymerase enzyme.
- Ang parehong mga form ay kasangkot sa bacterial transcription.
- May mga subunit sila.
- Sila ay mga molekula ng protina na binubuo ng mga amino acid.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng RNA Polymerase Core at Holoenzyme?
Ang RNA polymerase core ay isang enzyme na walang sigma factor, habang ang RNA polymerase holoenzyme ay isang enzyme na binubuo ng isang sigma factor. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng RNA polymerase core at holoenzyme. Higit pa rito, ang RNA polymerase core ay pangunahing nakikilahok sa elongation step ng transkripsyon, habang ang RNA polymerase holoenzyme ay pangunahing na-catalyze sa initiation step ng transkripsyon.
Ipinapakita ng infographic sa ibaba ang mga pagkakaiba sa pagitan ng RNA polymerase core at holoenzyme sa tabular form para sa magkatabi na paghahambing.
Buod – RNA Polymerase Core vs Holoenzyme
Ang Bacterial RNA polymerase ay isang multi-subunit DNA-dependent enzyme. Nakikilahok ito sa transkripsyon ng bakterya. Ito ang pangunahing enzyme ng pagpapahayag ng gene at isang target ng regulasyon. Ang RNA polymerase core at holoenzyme ay dalawang anyo ng bacterial RNA polymerase enzyme. Ang RNA polymerase core ay walang sigma factor, habang ang RNA polymerase holoenzyme ay binubuo ng isang sigma factor. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng RNA polymerase core at holoenzyme.
