Mahalagang pagkakaiba – Rooted vs Unrooted Phylogenetic Tree
Ang Phylogeny ay isang mahalagang larangan na nagsasaliksik sa buhay sa mundo sa paglipas ng panahon. Ito ay nagpapakita ng koneksyon sa pagitan ng mga organismo sa kanilang mga ninuno at mga inapo. Ang mga ugnayan sa pagitan ng mga organismo ay diagrammatikong kinakatawan ng iba't ibang representasyong tulad ng puno tulad ng dendogram, cladogram, phenogram, phylogram, atbp. Ang phylogenetic tree ay isang branching tree-like diagram na nagpapaliwanag sa mga phylogenetic na relasyon sa pagitan ng mga organismo na may halaga ng evolutionary distance. Mayroong dalawang pangunahing uri ng phylogenetic tree na kilala bilang rooted at unrooted. Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng rooted at unrooted phylogenetic tree ay ang rooted tree ay nagpapakita ng pinaka-basal na ninuno ng puno habang ang unrooted phylogenetic tree ay hindi nagpapakita ng ancestral root.
Ano ang Rooted Phylogenetic Tree?
Ang nakaugat na phylogenetic tree ay nagsisilbing isang kapaki-pakinabang na diagram na nagpapakita ng kasaysayan ng ebolusyon. Mayroon itong basal node na tinatawag na ugat, na kumakatawan sa karaniwang ninuno ng lahat ng mga grupo ng puno. Ang ugat ng isang puno ay itinuturing na pinakalumang punto sa puno na kumakatawan sa huling karaniwang ninuno ng lahat ng mga pangkat na kasama sa puno. Samakatuwid, ang isang puno na may ugat ay nagpapakita ng direksyon ng panahon ng ebolusyon. Mula sa isang solong species ng isang punong may ugat, ang karaniwang ninuno o ang ninuno ng species ay matatagpuan sa pamamagitan ng pagsubaybay pabalik sa basal node. Dahil ang nakaugat na puno ay naglalarawan ng direksyon ng panahon ng ebolusyon, madaling mahanap ang mas matanda o mas bagong mga grupo na mayroon ito. Ang isang puno na may ugat ay maaaring gamitin upang pag-aralan ang buong grupo ng mga organismo. Ang tumpak na pag-ugat ng isang phylogenetic tree ay isang mahalaga at mahalagang salik dahil ang hindi tumpak na pag-rooting ay maaaring magresulta sa mga maling interpretasyon ng mga pagbabagong genetic sa pagitan ng mga organismo at ang direksyon ng kanilang ebolusyon.
Figure 01: Isang Rooted Phylogenetic Tree
Ano ang Unrooted Phylogenetic Tree?
Ang unrooted phylogenetic tree ay isang phylogenetic diagram na kulang sa isang common ancestor o basal node. Ang ganitong uri ng puno ay hindi nagpapahiwatig ng pinagmulan ng ebolusyon ng mga grupo ng interes. Ito ay naglalarawan lamang ng relasyon sa pagitan ng mga organismo anuman ang direksyon ng evolutionary time line. Samakatuwid, mahirap pag-aralan ang mga relasyon sa ebolusyon ng mga grupo na may paggalang sa oras gamit ang isang unrooted na puno.
Mayroong dalawang pangunahing paraan sa pag-ugat ng hindi nakaugat na phylogenetic tree. Sila ay
Paghahanap ng outgroup – Nangangailangan ito ng paunang kaalaman tungkol sa mga ugnayan sa pagitan ng taxa. Pagkatapos, ang isang taxon na nasa labas ng grupo ay maaaring gamitin bilang isang outgroup para gumuhit ng isang rooted phylogenetic tree
Paghanap ng midpoint o distansya – Ang midpoint ng pinakamalayo na dalawang taxa sa puno ay maaaring ipalagay bilang ugat ng phylogenetic tree
Figure 02: Isang Unrooted Phylogenetic Tree
Ano ang pagkakaiba ng Rooted at Unrooted Phylogenetic Tree?
Rooted vs Unrooted Phylogenetic Tree |
|
| Ang may ugat na phylogenetic tree ay isang diagram na nagpapakita ng huling karaniwang ninuno ng mga grupo. | Ang isang unrooted phylogenetic tree ay nagpapakita ng mga ugnayan sa pagitan ng mga organismo nang hindi nagpapakita ng karaniwang ninuno. |
| Node | |
| Mayroon itong node (root). | Wala itong node. |
| Direksyon ng Ebolusyon | |
| May direksyon itong ipahiwatig ang oras ng ebolusyon. | Hindi ito tumutukoy ng ebolusyonaryong relasyon. |
| Saloobin sa Iba | |
| Ang puno ay nagbibigay-daan upang matukoy ang ninuno – nagmula na relasyon sa pagitan ng mga grupo. | Hindi pinapayagan ng puno na pag-usapan ang tungkol sa ugnayan ng ninuno – nagmula. |
Buod – Rooted vs Unrooted Phylogenetic Tree
Ang isang phylogenetic tree ay kumakatawan sa mga evolutionary pathway at koneksyon sa pagitan ng mga organismo gamit ang isang branched tree-like diagram. Ang Phylogenetic tress ay maaaring ma-root o unrooted. Ang may ugat na puno ay may node sa base, na kumakatawan sa karaniwang ninuno na nag-uugnay sa lahat ng mga grupo ng interes. Ang isang unrooted na puno ay nagpapakita ng mga relasyon sa pagitan ng mga organismo. Gayunpaman, hindi nito inilalarawan ang karaniwang ninuno na ibinabahagi ng lahat ng grupo. Ito ang pagkakaiba sa pagitan ng rooted at unrooted phylogenetic tree.
