Mahalagang Pagkakaiba – Eukaryotic vs Prokaryotic Promoter
Ang Transcription ay ang proseso ng pag-convert ng genetic na impormasyon na nakaimbak sa coding DNA sequence sa mRNA sequence. Ang isang partikular na rehiyon ng DNA na matatagpuan sa 5' dulo ng transcriptional unit ang nagpasimula ng prosesong ito. Ang rehiyong iyon ay kilala bilang rehiyon ng tagapagtaguyod. Ang mga promotor na ito ay karaniwang matatagpuan sa tabi ng site ng pagsisimula ng transkripsyon. Ang haba ng isang promoter ay nag-iiba mula 100 bp hanggang 1000 bp. Iba-iba ang mga promoter ayon sa uri ng organismo. Ang eukaryotic at prokaryotic promoters ay magkaiba sa isa't isa. Sa mga prokaryote, tatlong uri lamang ng mga sequence ng promoter ang matatagpuan lalo na, -10 promoter, -35 promoter at upstream na elemento. Sa mga eukaryote, maraming iba't ibang elemento ng promoter gaya ng TATA box, initiator elements, GC box, CAAT box, atbp. Ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng eukaryotic at prokaryotic promoters.
Ano ang Eukaryotic Promoter?
Tatlong pangunahing bahagi; core promoter, proximal promoter at distal promoter, sama-samang bumubuo ng isang promoter. Sa konteksto ng mga eukaryote, maraming bilang ng mga elemento ng promoter ang natagpuan na lubhang sopistikado at mas magkakaibang kaysa sa mga promoter. Napag-alaman na, dahil sa pagiging kumplikado ng mga eukaryotic promoter, ang DNA ay may kakayahang magtiklop pabalik sa sarili nito. Ipinapaliwanag din nito ang katotohanan na, ang epekto ng maraming mga pagkakasunud-sunod ng regulasyon ay nagaganap kahit na ang mga ito ay matatagpuan maraming kilobases ang layo mula sa site ng transkripsyon. Ang mga eukaryotic promoter na ito ay may kakayahang sumaklaw sa malawak na hanay ng mga sequence ng DNA.
Figure 01: Eukaryotic Promoter
Mga halimbawa para sa ilang eukaryotic promoter ay Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box atbp. Sa konteksto ng TATA box, ito ay isang sequence ng 5' – TATAA -3' na nasa core rehiyon ng promoter. Sa kahon ng TATA, ang mga protina ng transcription factor at mga protina ng histone ay nakatali. Ang pagbubuklod ng mga transcription factor protein sa TATA box ay tumutulong sa pagbubuklod ng RNA polymerase, na nagreresulta sa pagbuo ng transcription complex. Sa simpleng mga termino, ang pagbubuklod ng mga protina na ito ay magtutulak sa proseso ng transkripsyon. Ang prosesong ito ay mapipigilan kapag ang mga histone protein ay nakatali sa TATA box. Samakatuwid, ang TATA box ay isang mahalagang elemento ng promoter na may kinalaman sa regulasyon ng rate ng eukaryotic transcription.
Ano ang Prokaryotic Promoter?
Sa mga prokaryotic na organismo, ang promoter na kasangkot sa transkripsyon ay kinikilala ng nauugnay na salik na tinatawag na sigma factor. Ang mga kadahilanan ng Sigma ay natatangi sa iba't ibang mga pagkakasunud-sunod ng promoter. Samakatuwid, sinasabing ang bawat solong kadahilanan ng sigma ay makikilala ang isang solong pagkakasunud-sunod ng tagataguyod. Ito ay isang natatanging katangian na naroroon sa proseso ng prokaryotic transcription. Parehong RNA polymerase at ang sigma factor ang sama-samang tumutukoy sa tamang rehiyon ng promoter at bumubuo sa transcription complex.
Ang prokaryotic promoter ay naglalaman lamang ng tatlong uri ng mga elemento ng promoter. Ang mas kaunting paglahok ng mga elemento ng promoter sa mga prokaryote ay ang pangunahing dahilan kung bakit hindi gaanong sopistikado ang kanilang proseso ng transkripsyon kung ihahambing sa eukaryotic transcription na nagsasangkot ng mas mataas na bilang ng mga sequence ng promoter. Sa tatlong elemento ng promoter ng mga prokaryote, mayroong dalawang pangunahing mahalagang dalawang maikling pagkakasunud-sunod ng DNA. Ang mga pagkakasunud-sunod na ito ay inuri ayon sa kanilang lokasyon. Ang mga ito ay, -10 promoter o elemento (naroroon ang 10bp upstream ng transcription start site), -35 promoter o element (iyon ay present 35bp upstream ng transcription start site).
Figure 02: Prokaryotic Promoter
Ang -10 promoter ay katumbas ng eukaryotic TATA box o Pribnow box at isang mahalagang bahagi para sa pagsisimula ng transkripsyon sa mga prokaryote. Ang -35 promoter ay binubuo ng isang sequence na TTGACA na aktibong kasangkot sa regulasyon ng rate ng prokaryotic transcription.
Ano ang Pagkakatulad sa Pagitan ng Eukaryotic at Prokaryotic Promoter?
- Sa parehong uri, ang mga promoter ay kinokontrol ng iba't ibang mga regulatory sequence ng DNA na kinabibilangan ng mga enhancer, silencer, insulators, at boundary elements.
- Ang mga promoter ay ang mga sequence na nagpapasimula ng transkripsyon sa mga prokaryote at eukaryotes.
- Ang mga promoter ay mga DNA sequence.
Ano ang Pagkakaiba sa Pagitan ng Eukaryotic at Prokaryotic Promoter?
Eukaryotic vs Prokaryotic Promoter |
|
| Ang mga promotor ng eukaryotic ay ang mga regulatory sequence na nagpapasimula ng transkripsyon ng mga eukaryotic organism. | Ang mga prokaryotic promoter ay ang mga regulatory sequence na nagpapasimula ng transkripsyon ng prokaryotic genes. |
| Elements | |
| Prokaryotic promoter ay binubuo ng upstream elements, -10 element at -35 elements. | Eukaryotic promoter ay binubuo ng Pribnow box (TATA box), CAAT box, GC box at mga elemento ng initiator. |
Buod – Eukaryotic vs Prokaryotic Promoter
Ang promoter ay isang rehiyon ng DNA na kinabibilangan ng pagsisimula ng prosesong tinatawag na transkripsyon. Ang mga promotor na ito ay karaniwang matatagpuan sa itaas ng agos patungo sa site ng pagsisimula ng transkripsyon. Ang tatlong pangunahing bahagi na bumubuo ng isang promoter ay ang core promoter, proximal promoter at distal promoter. Sa konteksto ng mga eukaryote, maraming bilang ng mga nagsusulong na elemento sa rehiyon ng promoter na lubhang sopistikado at mas magkakaibang kaysa sa mga prokaryote. Ang mga halimbawa ng ilang eukaryotic promoter elements ay Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box atbp. Sa prokaryotes, mayroong dalawang pangunahing importanteng elemento ng promoter na -10 element (na nasa 10bp upstream ng transcription start site), -35 elements (naroroon ang 35bp upstream ng transcription start site). -10 promoter ang nagpasimula ng transkripsyon, at ang -35 na promoter ang nag-regulate ng transkripsyon. Ang parehong uri ng mga promoter ay kinokontrol ng iba't ibang mga sequence ng regulasyon ng DNA na kinabibilangan ng mga enhancer, silencer, insulator at mga elemento ng hangganan. Ito ang pagkakaiba sa pagitan ng eukaryotic at prokaryotic promoters.
I-download ang PDF ng Eukaryotic vs Prokaryotic Promoter
Maaari mong i-download ang PDF na bersyon ng artikulong ito at gamitin ito para sa offline na layunin ayon sa tala ng pagsipi. Paki-download ang bersyon ng PDF dito: Pagkakaiba sa pagitan ng Eukaryotic at Prokaryotic promoter
