Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng candidate gene at GWAS ay ang candidate gene approach na nag-iimbestiga sa genetic variation sa loob ng maliit na bilang ng mga pre-specified genes of interest habang ang GWAS ay nag-iimbestiga sa buong genome para sa isang karaniwang genetic variation sa likod ng isang partikular na kondisyon ng sakit.
Ang Candidate gene approach at genome-wide association studies (GWAS) ay dalawang paraan na mahalaga upang matukoy ang genetic susceptibility sa mga sakit. Ang diskarte sa gene ng kandidato ay batay sa isang paunang tinukoy na maliit na bilang ng mga gene habang ang GWAS ay batay sa pagsubok sa buong genome. Samakatuwid, ang diskarte sa gene ng kandidato ay nangangailangan ng paunang kaalaman sa mga gene na may kaugnayan sa sakit, hindi katulad ng GWAS.
Ano ang Candidate Gene?
Ang diskarte sa gene ng kandidato ay isa sa mga diskarteng nagsisiyasat sa kaugnayan sa pagitan ng pagkakaiba-iba ng genetic sa loob ng paunang tinukoy na mga gene ng interes at mga phenotype o estado ng sakit. Sa diskarteng ito, kinakailangan na magkaroon ng paunang kaalaman sa biological functional na epekto ng gene sa katangian o sakit na pinag-uusapan. Batay sa kaalamang ito, ang isang maliit na bilang ng mga gene ay pinipili at sinusuri para sa genetic variation.
Figure 01: Candidate Gene Approach
Ang pagpili ng mga gene ay ginawa batay sa biological, physiological at functional na kaugnayan sa sakit na pinag-uusapan sa diskarteng ito. Ang diskarteng ito ay kadalasang idinisenyo bilang isang case-control study.
Ano ang GWAS?
Ang GWAS ay kumakatawan sa Genome-Wide Association Study. Ito rin ay tumutukoy sa buong-genome association studies. Ang mga pag-aaral na ito ay pangunahing nakatuon sa mga obserbasyonal na pag-aaral. Sinusuri nila ang mga genetic na variant ng iba't ibang indibidwal na karaniwang nauugnay sa isang partikular na katangian. Ang buong genome ay mahalaga para sa pagsusuri ng GWAS.
Ang GWAS ay isang mahalagang tool sa pagsusuri ng mga single nucleotide polymorphism na nauugnay sa iba't ibang kondisyon ng sakit. Ito ay isang paghahambing na pag-aaral ng iba't ibang solong nucleotide polymorphism sa isang malawak na populasyon. Ang sample ng pag-aaral ng GWAS ay napakataas; kaya, kailangan din nito ang format ng isang cross-sectional cohort study.
Figure 02: GWAS
Naganap ang unang pag-aaral ng GWAS patungkol sa myocardial infarction at pagsusuri sa mga gene na nauugnay sa myocardial infarction. Sa kasalukuyan, gumaganap ng mahalagang papel ang GWAS sa pagtukoy sa genetic na background ng mga kumplikadong sakit na may hindi kilalang etiology.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Candidate Gene at GWAS?
- Ang parehong candidate gene approach at GWAS ay mga diskarteng sumusuri sa genetic association sa pagitan ng genotype at phenotype ng sakit.
- Ang parehong mga diskarte ay nakakatulong upang maunawaan ang genetic na batayan ng pagkamaramdamin sa sakit.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Candidate Gene at GWAS?
Ang diskarte sa gene ng kandidato ay nakabatay sa mga gene ng kandidato o mga paunang tinukoy na gene, habang ang GWAS ay nakabatay sa buong genome. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng gene ng kandidato at GWAS. Gayundin, sa candidate gene approach, ang pagpili ng mga gene ay kailangan habang hindi ito kailangan sa GWAS.
Bukod dito, ang candidate gene approach ay nangangailangan ng paunang kaalaman sa mga gene na nauugnay sa sakit, habang hindi ito kinakailangan para sa GWAS.
Sa ibaba ng infographic ay nagbibigay ng mas detalyadong paghahambing na nauugnay sa pagkakaiba sa pagitan ng gene ng kandidato at GWAS.
Buod – Candidate Gene vs GWAS
Ang Candidate gene at GWAS ay dalawang gene association studies. Ang diskarte sa gene ng kandidato ay nakatuon sa pagkakaiba-iba ng genetic na nauugnay sa sakit sa loob ng maliit na bilang ng mga paunang tinukoy na gene. Sa kaibahan, sinisiyasat ng GWAS ang genetic variation na nauugnay sa sakit sa loob ng buong genome. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng gene ng kandidato at GWAS. Ang parehong paraan ay mahalaga sa pag-unawa sa genetic na batayan ng pagiging madaling kapitan sa sakit.
