Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng transcriptional at posttranscriptional gene silencing ay ang transcriptional gene silencing ay ang regulasyon ng gene expression sa transcriptional level upang bawasan ang RNA synthesis sa pamamagitan ng promoter silencing habang ang posttranscriptional gene silencing ay ang regulasyon ng gene expression sa pagsasalin antas ayon sa sequence-specific na pagkasira ng RNA.
Ang Gene silencing ay ang proseso ng pag-regulate ng expression ng gene sa pamamagitan ng pag-abala o pagsugpo sa expression ng gene. Pinapatay nito ang ilang uri ng mga gene. Samakatuwid, pinipigilan nito ang paggawa ng isang protina mula sa kaukulang gene nito. Maaaring mangyari ang pag-silencing ng gene sa panahon ng transkripsyon o pagsasalin. Kaya naman, mayroong dalawang uri ng gene silencing bilang transcriptional gene silencing at posttranscriptional gene silencing. Ang transcriptional gene silencing ay nagpapababa ng RNA synthesis habang ang posttranscriptional gene silencing ay nagpapababa ng mRNA. Bukod dito, ang transcriptional gene silencing ay nagaganap sa nuclei habang ang posttranscriptional gene silencing ay nagaganap sa cytoplasm.
Ano ang Transcriptional Gene Silencing?
Ang Transcriptional gene silencing ay gene silencing na gumagana sa pamamagitan ng pagbaba ng RNA synthesis. Ito ay resulta ng pagbabago sa histone, na lumilikha ng isang kapaligiran na hindi naa-access sa mga makinarya ng transkripsyon. Nangyayari ito sa nuclei ng mga selula. Napakahalaga ng DNA methylation para sa transcriptional gene silencing dahil ang methylation ng promoter sequence ay nangyayari sa panahon ng transcriptional gene silencing. Ang methylation ng coding sequence ay hindi nakakaapekto sa transkripsyon. Ngunit, ang methylation ng mga sequence ng promoter ay nagreresulta sa hindi aktibo ng promoter dahil sa histone deacetylation at chromatin condensation. Kapag natahimik ang mga promotor, naaapektuhan nito ang transkripsyon ng gene. Kaya naman, sa transcriptional gene silencing, ang mga promoter ay pinatahimik upang i-regulate ang gene expression sa transcriptional level.
Figure 01: Gene Silencing
Ano ang Posttranscriptional Gene Silencing?
Ang Posttranscriptional gene silencing, na kilala rin bilang RNA silencing o RNA interference, ay isang uri ng gene silencing na gumagana sa pamamagitan ng sequence-specific degradation ng RNA. Bagama't hindi apektado ang transkripsyon ng gene, humihinto ang synthesis ng protina mula sa mRNA dahil sa hindi matatag o hindi naa-access na mRNA. Ang posttranscriptional gene silencing ay naudyok ng sinasadyang paggawa ng double-stranded RNA. Ang double-stranded na RNA ay nag-trigger ng cleavage ng homologous mRNA. Ang mga maliliit na nakakasagabal na RNA na may mga homologous na pagkakasunud-sunod sa mga na-transcribe na rehiyon ng mga gene ay gumagabay sa sequence-specific na degradation ng mRNA. Ang RNAi ay nagbubuklod sa komplementaryong bahagi ng target na mRNA at tina-tag ito para sa pagkasira.
Figure 02: Posttranscriptional Gene Silencing
Posttranscriptional gene silencing ay may ilang mga aplikasyon, kabilang ang gene therapy at paggamot sa cancer. Ang posttranscriptional gene silencing ay isa sa mga natural na mekanismo ng pagtatanggol sa mga halaman laban sa mga invading RNA virus. Samakatuwid, ang mga halaman na posttranscriptional gene silencing defective ay mas madaling kapitan ng impeksyon ng RNA virus.
Ano ang Mga Pagkakatulad sa Pagitan ng Transcriptional at Posttranscriptional Gene Silencing?
- Sila ay dalawang magkaibang gene-silencing phenomena.
- Ang parehong phenomena ay maaaring ma-induce ng dsRNA.
- Para sa parehong uri ng pananahimik, may makikitang maliliit na RNA species, na inaakalang mga produkto ng dsRNA decay.
- Ang mga ito ay may kaugnayan sa mekanikal.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Transcriptional at Posttranscriptional Gene Silencing?
Ang Transcriptional gene silencing ay isang gene silencing phenomenon na gumagana sa antas ng transkripsyon sa pamamagitan ng pagbaba ng RNA synthesis. Sa kabilang banda, ang posttranscriptional gene silencing ay isang gene silencing phenomenon na nangyayari sa antas ng pagsasalin sa pamamagitan ng sequence-specific na degradation ng mRNA. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng transcriptional at posttranscriptional gene silencing.
Bukod dito, ang transcriptional gene silencing ay nangyayari sa nuclei habang ang posttranscriptional gene silencing ay nangyayari sa cytoplasm. Bukod pa rito, hindi aktibo ang mga promoter sa transcriptional gene silencing habang ang mga promoter ay aktibo sa posttranscriptional gene silencing.
Sa ibaba ng infographic ay nag-tabulate ng higit pang pagkakaiba sa pagitan ng transcriptional at posttranscriptional gene silencing.
Buod – Transcriptional vs Posttranscriptional Gene Silencing
Ang mga gene ay kinokontrol sa alinman sa transcriptional o posttranscriptional na antas. Ang transcriptional gene silencing ay nangyayari sa nuclei sa pamamagitan ng promoter sequence na methylation at pagbabago ng histone. Bilang resulta, bumababa ang synthesis ng RNA. Ang posttranscriptional gene silencing ay nangyayari sa cytoplasm sa pamamagitan ng cleavage ng mRNA at pagsugpo sa pagsasalin. Ang parehong mga phenomena ay sapilitan ng dsRNA at nakasalalay sa mga maliliit na nakakasagabal na RNA. Kaya, ibinubuod nito ang pagkakaiba sa pagitan ng transcriptional at posttranscriptional gene silencing.
