Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng pagkuha ng DNA ng halaman at hayop ay na sa pagkuha ng DNA ng halaman, kinakailangang basagin ang cell wall sa pamamagitan ng paggiling ng tissue sa dry ice o liquid nitrogen upang mailabas ang mga nilalaman ng cellular habang nasa pagkuha ng DNA ng hayop, hindi kailangang gawin ang hakbang na ito dahil walang cell wall ang mga selula ng hayop.
Ang Genomic DNA ay ang genetic na materyal ng mga selula ng halaman at hayop. Ang genomic DNA ay natatangi sa bawat indibidwal na halaman o hayop. Ang pagkuha ng DNA ng magandang kalidad na DNA ay ang kinakailangan para sa molekular na pananaliksik. Ang DNA ng mga organismo ay kinukuha para sa pagkakakilanlan, pagsusuri ng mga sakit, pagtuklas ng mga partikular na gene at pagkakasunud-sunod, forensic na layunin, paternity testing, genome sequencing, at pagbuo ng mga gamot, atbp. Nag-iiba-iba ang paraan ng pagkuha ng DNA depende sa uri ng mga selula – ito man ay selula ng hayop o selula ng halaman.
Ano ang Plant DNA Extraction?
Ang DNA sa mga selula ng halaman ay kinukuha para sa iba't ibang molecular studies. Kinakailangang kunin ang buo, purong genomic DNA. Samakatuwid, mayroong iba't ibang uri ng mga protocol ng pagkuha ng DNA na iba sa mga protocol ng pagkuha ng DNA mula sa mga selula ng hayop. Ito ay dahil ang mga cell ng halaman ay may cell wall na dapat sirain upang maalis ang mga nilalaman ng cellular.
Ang pagkuha ay karaniwang ginagawa sa pamamagitan ng paggiling ng mga tisyu ng halaman sa tuyong yelo o likidong nitrogen gamit ang isang mortar at halo. Pagkatapos ang mga lamad ng cell ay nagambala, at ang nilalaman ng cellular ay inilabas sa isang buffer ng pagkuha. Ito ay karaniwang ginagawa gamit ang isang detergent; SDS (sodium dodecyl sulfate) o CTAB (cetyltrimethylammonium bromide) buffer. Ang pinakawalan na DNA ay protektado mula sa mga endogenous na nucleases gamit ang isang chelating agent tulad ng EDTA. Bukod dito, ang mga protina ay pinaghihiwalay mula sa DNA gamit ang chloroform o phenol.
Figure 01: Plant DNA Extraction
Plants synthesize polysaccharides at polyphenols, kabilang ang flavonoids at iba pang pangalawang metabolites. Ang mga compound na ito ay nakakasagabal sa pagkuha ng purong genomic DNA. Kaya naman, karamihan sa mga protocol ng pagkuha ng DNA ng halaman ay nagsasangkot ng isa pang hakbang, gaya ng cesium chloride density gradient technique upang maalis ang mga compound na ito.
Karamihan sa mga protocol ng pagkuha ng DNA ay inirerekomenda ang paggamit ng mga sariwang sample ng dahon para sa pagkuha ng DNA. Ang ilang mga pamamaraan ay hindi kasama ang mga mapanganib na kemikal tulad ng liquid nitrogen at phenol. Ang CTAB (Cetyl trimethylammonium bromide) protocol ay isang popular na plant DNA extraction protocol na nagpapadali sa pagkuha ng de-kalidad na genomic DNA ng halaman. Ito ay isang simple, ligtas, maaasahan, at cost-efficient na paraan para sa pagkuha ng DNA ng halaman. Karamihan sa iba pang mga pamamaraan ay binagong bersyon ng pamamaraan ng CTAB.
Ano ang Animal DNA Extraction?
Ang Animal DNA extraction ay ang pagkuha ng genomic DNA mula sa mga selula ng hayop para sa molecular analysis. Hindi tulad ng pagkuha ng DNA ng halaman, ang pagkasira ng cell wall ay hindi kailangan para sa mga selula ng hayop dahil wala silang cell wall. Ang mga selula ng dugo ay ang pinakakaraniwang uri ng mga selula ng hayop na ginagamit para sa iba't ibang layunin.
Figure 02: Pagkuha ng DNA
Ang paraan ng phenol-chloroform ay isa sa mga pinakamahusay na pagpipilian para sa mga selula ng dugo. Mataas ang ani at kalidad ng DNA kapag kinukuha ang DNA mula sa pamamaraang ito. Ito ay isang liquid-liquid DNA extraction protocol, at ang paraang ito ay naghihiwalay sa mga molekula ng DNA batay sa kanilang solubility sa mga hindi mapaghalo na solusyon. Ang phenol, chloroform at isoamyl alcohol ang nangungunang tatlong sangkap ng pamamaraang ito.
Ano ang Pagkakatulad sa Pagitan ng Pagkuha ng DNA ng Halaman at Hayop?
- Sa panahon ng pag-extract ng DNA ng halaman at hayop, dapat maputol ang mga cell membrane.
- Dapat protektahan ang DNA mula sa mga endogenous nucleases.
- Bukod dito, dapat iwasan ang paggugupit ng DNA.
- Available ang mga commercial kit para sa pagkuha ng DNA ng halaman at DNA ng hayop.
- Karamihan sa mga paraan ng pagkuha ng DNA ng halaman at hayop ay nangangailangan ng patuloy na pagbabago at standardisasyon.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Pagkuha ng DNA ng Halaman at Hayop?
Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng pagkuha ng DNA ng halaman at hayop ay ang pagkuha ng DNA ng halaman ay nangangailangan ng paggiling ng tissue ng halaman sa tuyong yelo o likidong nitrogen upang masira ang pader ng cell habang ang pagkuha ng DNA ng hayop ay hindi nangangailangan ng hakbang na ito dahil sila ay hayop. ang mga cell ay walang cell wall. Ang pamamaraan ng CTAB ay isa sa mga pinakamahusay na pamamaraan para sa pagkuha ng DNA ng halaman habang ang pamamaraang phenol-chloroform ay isa sa mga pinakamahusay na pamamaraan para sa pagkuha ng DNA ng hayop.
Sa ibaba ng infographic ay naka-tabulate ang mga pagkakaiba sa pagitan ng pagkuha ng DNA ng halaman at hayop.
Buod – Pagkuha ng DNA ng Plant vs Animal
May iba't ibang paraan para sa pagkuha ng DNA mula sa iba't ibang uri ng cell. Samakatuwid, ang mga protocol ng pagkuha ng DNA ng halaman ay naiiba sa mga protocol ng pagkuha ng DNA ng cell ng hayop. Ang pagkuha ng DNA ng halaman ay nangangailangan ng pagkagambala ng cell wall, cell membrane at nuclear membrane habang ang animal DNA extraction ay nangangailangan ng pagkasira ng cell membrane at nuclear membrane. Higit sa lahat, ang pagkuha ng DNA ng selula ng hayop ay hindi nangangailangan ng pagkagambala ng mga pader ng cell sa pamamagitan ng paggiling sa tuyong yelo o likidong nitrogen. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng pagkuha ng DNA ng halaman at hayop.
