Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng linker at adaptor ay ang linker ay walang magkakaugnay na dulo habang ang adaptor ay may isang magkakaugnay na dulo.
Ang DNA ligation ay ang proseso ng pagsasama-sama ng dalawang molekula ng DNA, na bumubuo ng mga phosphodiester bond. Ang enzyme na tinatawag na DNA ligase ay nag-catalyze sa reaksyong ito. Isa ito sa mga kritikal na hakbang sa modernong molecular biological field tulad ng recombinant DNA technology at DNA cloning. Ang kahusayan ng ligation ay nakasalalay sa mga dulo ng mga molekula ng DNA na i-ligate. Mayroong dalawang uri ng mga dulo ng DNA bilang malagkit na dulo at mapurol na dulo. Ang kahusayan ng ligation ay mataas na may malagkit na dulo kaysa sa mapurol na dulo. Kung ang mga target na molekula ng DNA ay may mapurol na dulo, ang mga molekula na tinatawag na mga adaptor o linker ay magiging kapaki-pakinabang. Ang mga adapter at linker ay mga chemically synthesized na oligonucleotide molecule na tumutulong sa DNA ligation. Mayroon din silang panloob na mga site ng paghihigpit. Ang adaptor ay may isang malagkit na dulo at isang mapurol na dulo, habang ang linker ay may dalawang mapurol na dulo.
Ano ang Linker?
Ang Linker ay isang chemically synthesized oligonucleotide sequence na double-stranded. Ang linker ay may dalawang mapurol na dulo. Ginagamit ang linker upang i-ligate ang mga molekula ng DNA na may mapurol na dulo sa mga vector. Naglalaman ito ng isa o higit pang panloob na mga site ng paghihigpit. Ang mga restriction site na ito ay gumagana bilang recognition site para sa restriction enzymes.
Figure 01: Linker
Pagkatapos ng ligation, ang DNA ay pinaghihigpitan muli ng mga restriction enzymes upang makagawa ng magkakaugnay na dulo. Ang mga EcoRI-linker at sal-I linker ay karaniwang ginagamit na mga linker.
Ano ang Adaptor?
Ang Adapter ay isang double-stranded oligonucleotide sequence na ginagamit upang pag-ugnayin ang dalawang molekula ng DNA. Ito ay isang maikling pagkakasunod-sunod na may isang mapurol na dulo at isang malagkit o magkakaugnay na dulo. Samakatuwid, binubuo ito ng isang naka-stranded na buntot sa isang dulo, na nagpapahusay sa kahusayan ng DNA ligation.
Figure 02: DNA Ligation by an Adaptor
Bukod dito, ang adapter ay may panloob na mga site ng paghihigpit. Samakatuwid, pagkatapos ng ligation, ang DNA ay maaaring paghigpitan ng naaangkop na mga enzyme ng paghihigpit upang lumikha ng isang bagong nakausli na terminal. Ang isang kawalan ng mga adapter ay ang dalawang adapter ay maaaring bumuo ng mga dimmer sa pamamagitan ng base na pagpapares sa kanilang mga sarili. Maiiwasan ito sa pamamagitan ng paggamot sa kanila ng enzyme na tinatawag na alkaline phosphatase.
Ano ang Pagkakatulad sa pagitan ng Linker at Adaptor?
- Parehong linker at adapter ay double-stranded na maiikling oligonucleotide sequence.
- Nagdadala sila ng mga panloob na site ng paghihigpit.
- Bukod dito, ang mga ito ay chemically synthesized na mga molekula ng DNA at mga sintetikong molekula.
- Maaari nilang iugnay ang dalawang molekula ng DNA nang magkasama.
- Pagkatapos ng ligation ng mga linker at adapter, ang DNA ay muling pinaghihigpitan ng mga restriction enzymes upang makagawa ng malagkit na dulo.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Linker at Adaptor?
Ang linker ay isang chemically synthesized na maikling oligonucleotide duplex na may dalawang blunt na dulo. Ang adaptor ay isang chemically synthesized na maikling oligonucleotide duplex na may isang malagkit na dulo at isang mapurol na dulo. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng linker at adaptor. Bukod dito, ang mga adaptor ay maaaring bumuo ng mga dimer, habang ang mga linker ay hindi bumubuo ng mga dimer. Kaya, ito ay isa pang makabuluhang pagkakaiba sa pagitan ng linker at adaptor.
Sa ibaba ay isang buod ng mga pagkakaiba sa pagitan ng linker at adapter sa tabular form.
Buod – Linker vs Adaptor
Ang Linker at adapter ay dalawang uri ng chemically synthesized oligonucleotides na kapaki-pakinabang sa pag-ligating ng blunt-end na DNA. Ang linker ay may dalawang mapurol na dulo, habang ang adaptor ay may isang mapurol na dulo at isang magkakaugnay na dulo. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng linker at adaptor. Ang mga ito ay mga double-stranded na molekula na may panloob na mga lugar ng paghihigpit. Malawakang ginagamit ang mga ito sa recombinant DNA technology at DNA cloning.
