Ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng protina subunit at domain ay ang isang protina subunit ay isang hiwalay na polypeptide chain ng isang protina na nagsasama-sama sa iba pang polypeptide chain upang bumuo ng isang protina complex habang, ang isang protina domain ay isang magkadikit na rehiyon ng polypeptide chain ng isang protina na madalas na nakatiklop nang nakapag-iisa sa isang compact, local, at semi-independent na unit.
Ang Protein subunit at domain ay napakahalagang bahagi ng isang multimeric na protina. Ang mga protina ay mga polimer na gawa sa polypeptides. Ang bawat polypeptide chain ay nabubuo mula sa isang monomer na kilala bilang isang amino acid. Ang isang kumplikadong protina ay naglalaman ng mga natatanging structural unit gaya ng mga subunit, domain, motif, at fold. Ang mga istrukturang yunit na ito ng isang kumplikadong protina ay lubhang mahalaga para sa istraktura nito at sa huli para sa paggana nito.
Ano ang Protein Subunit?
Ang isang subunit ng protina ay isang hiwalay na polypeptide chain ng isang protina na nagsasama-sama sa iba pang polypeptide chain upang bumuo ng isang protein complex. Sa structural biology, ang isang subunit ng protina ay isang solong molekula ng protina na nagsasama-sama sa iba pang mga molekula ng protina upang bumuo ng isang kumplikadong protina. Ang mga natural na protina ay may medyo maliit na bilang ng mga subunit, gaya ng hemoglobin at DNA polymerase. Samakatuwid, sila ay tinatawag na oligomeric. Ang iba pang mga protina ay binubuo ng isang malaking bilang ng mga subunit, kaya inilalarawan ang mga ito bilang multimeric. Halimbawa, ang mga microtubule at iba pang mga protina ng cytoskeleton ay multimeric. Ang mga subunit ng multimeric na protina ay maaaring magkapareho (homologous) o ganap na hindi magkatulad (heterologous).
Figure 01: Protein Subunit
Sa ilang multimeric na protina, ang isang subunit ay maaaring isang catalytic subunit. Sa kabilang banda, ang isa ay isang regulatory subunit. Ang function ng catalytic subunit ay catalysing ang enzymatic reaction samantalang, ang function ng regulatory subunit ay pinapadali o pinipigilan ang aktibidad nito. Ang isang enzyme na binubuo ng parehong catalytic at regulatory subunit kapag pinagsama-sama ay karaniwang tinutukoy bilang isang holoenzyme. Halimbawa, ang enzyme class I phosphoinositide 3-kinase ay mayroong p110 catalytic subunit at isang p85 regulatory subunit. Bukod dito, ang isang protina ay dapat magkaroon ng isang gene para sa bawat subunit. Ito ay dahil ang isang subunit ay binubuo ng isang hiwalay na polypeptide chain na mayroong isang coding gene.
Ano ang Protein Domain?
Ang isang domain ng protina ay isang magkadikit na rehiyon ng polypeptide chain ng isang protina na madalas na nakatiklop nang hiwalay sa isang compact, local, at semi-independent na mga unit. Ang domain ng isang protina ay kilala rin bilang isang rehiyon ng polypeptide chain ng protina na nagpapatatag sa sarili at nakatiklop nang hiwalay mula sa iba. Ang mga ito ay isang natatanging structural at functional unit sa isang protina. Karaniwan, ang mga domain ay may pananagutan para sa isang partikular na function o isang pakikipag-ugnayan na nag-aambag sa pangkalahatang papel ng protina. Halimbawa, ang domain ng SH3 ay humigit-kumulang 50 mga residu ng amino acid. Nagaganap ang mga ito sa magkakaibang hanay ng mga protina, kabilang ang mga adapter protein, phophatidylinositol3-kinases, phospholipases, at myosin. Ang mga SH3 domain na ito ay kasangkot sa mga pakikipag-ugnayan ng protina-protina.
Figure 02: Mga Protein Domain
Ang mga domain ay nag-iiba ang haba mula 50 amino acid hanggang 250 amino acid. Ang pinakamaikling domain, tulad ng zinc finger, ay pinapatatag ng mga metal ions at disulphide bridge. Ang isang domain ay madalas na gumagawa ng mga functional unit tulad ng calcium-binding EF-hand domain ng calmodulin. Higit pa rito, maaaring palitan ang mga domain sa pamamagitan ng genetic engineering sa pagitan ng isang protina patungo sa isa pa upang makagawa ng mga chimeric protein.
Ano ang Mga Pagkakatulad sa pagitan ng Protein Subunit at Domain?
- Ang mga subunit ng protina at domain ay mga istrukturang unit ng isang multimeric na protina.
- Parehong binubuo ng mga amino acid.
- Nakakonekta sila sa terminong “polypeptide chain”.
- Bukod dito, pareho silang napakahalaga para sa pangkalahatang paggana ng protina.
Ano ang Pagkakaiba sa pagitan ng Protein Subunit at Domain?
Ang isang subunit ng protina ay isang hiwalay na polypeptide chain ng isang protina na nagsasama-sama sa iba pang polypeptide chain upang bumuo ng isang protein complex. Sa kabilang banda, ang isang domain ng protina ay isang magkadikit na rehiyon ng polypeptide chain ng isang protina na madalas na nakatiklop nang nakapag-iisa sa isang compact, lokal, at semi-independent na mga yunit. Kaya, ito ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan ng subunit ng protina at domain. Bukod dito, mas malaki ang laki ng isang subunit ng protina kaysa sa isang domain ng protina.
Ibinubuod ng sumusunod na talahanayan ang pagkakaiba sa pagitan ng subunit ng protina at domain sa anyong tabular.
Buod – Protein Subunit vs Domain
Ang bumubuo ng mga protina ay mga amino acid. Ang mga protina ay nabuo sa pamamagitan ng paghalay ng mga amino acid. Ang mga istruktura ng protina ay may sukat mula sampu hanggang ilang libong amino acid. Ang istruktura ng protina ay pinatatag ng mga non-covalent na pakikipag-ugnayan gaya ng mga hydrogen bond, ionic bond, Van der Waals forces, hydrophobic bond, at covalent na pakikipag-ugnayan gaya ng disulphide bond. Ang isang kumplikadong protina ay naglalaman ng mga natatanging structural unit gaya ng mga subunit, domain, motif, at fold. Ang isang subunit ng protina ay isang hiwalay na polypeptide chain ng isang protina na nagsasama-sama sa iba pang mga polypeptide chain upang bumuo ng isang kumplikadong protina. Sa kabilang banda, ang domain ng protina ay isang rehiyon ng polypeptide chain ng protina na nagpapatatag sa sarili at nakatiklop nang nakapag-iisa mula sa iba. Kaya, ito ang buod ng pagkakaiba sa pagitan ng subunit ng protina at domain.
